RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489554.1

SCAMP4-208, Transcript of secretory carrier membrane protein 4, human

TSL 3

Gene SCAMP4, Length 573 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SCAMP4-208	ENST00000489554	BDNF	P23560	247 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SCAMP4-208	ENST00000489554	CLCN1	P35523	988 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SCAMP4-208	ENST00000489554	GRIK1	P39086	918 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SCAMP4-208	ENST00000489554	NOP14	P78316	857 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
SCAMP4-208	ENST00000489554	LRMP	Q12912	555 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SCAMP4-208	ENST00000489554	ZNF268	Q14587	947 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
SCAMP4-208	ENST00000489554	DRC7	Q8IY82	874 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SCAMP4-208	ENST00000489554	MAB21L3	Q8N8X9	362 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SCAMP4-208	ENST00000489554	TC2N	Q8N9U0	490 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SCAMP4-208	ENST00000489554	SPC24	Q8NBT2	197 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SCAMP4-208	ENST00000489554	B3GALNT2	Q8NCR0	500 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SCAMP4-208	ENST00000489554	STKLD1	Q8NE28	680 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SCAMP4-208	ENST00000489554	FAM3C	Q92520	227 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SCAMP4-208	ENST00000489554	TNIP3	Q96KP6	325 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SCAMP4-208	ENST00000489554	C8orf48	Q96LL4	319 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SCAMP4-208	ENST00000489554	IER2	Q9BTL4	223 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SCAMP4-208	ENST00000489554	IMPG2	Q9BZV3	1241 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SCAMP4-208	ENST00000489554	ELOVL4	Q9GZR5	314 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SCAMP4-208	ENST00000489554	SMYD3	Q9H7B4	428 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SCAMP4-208	ENST00000489554	TDP1	Q9NUW8	608 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SCAMP4-208	ENST00000489554	CAPN11	Q9UMQ6	739 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SCAMP4-208	ENST00000489554	ZKSCAN5	Q9Y2L8	839 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SCAMP4-208	ENST00000489554	MTF2	Q9Y483	593 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
SCAMP4-208	ENST00000489554	NME7	Q9Y5B8	376 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SCAMP4-208	ENST00000489554	SHISA7	A6NL88	538 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SCAMP4-208	ENST00000489554	LAMTOR5	O43504	91 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SCAMP4-208	ENST00000489554	MFAP3L	O75121	409 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SCAMP4-208	ENST00000489554	TADA3	O75528	432 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SCAMP4-208	ENST00000489554	PFKL	P17858	780 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SCAMP4-208	ENST00000489554	TRIM21	P19474	475 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
SCAMP4-208	ENST00000489554	CASP14	P31944	242 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SCAMP4-208	ENST00000489554	PPP3CC	P48454	512 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SCAMP4-208	ENST00000489554	PDE6C	P51160	858 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SCAMP4-208	ENST00000489554	KPNA1	P52294	538 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
SCAMP4-208	ENST00000489554	POLR2F	P61218	127 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
SCAMP4-208	ENST00000489554	GCNT1	Q02742	428 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SCAMP4-208	ENST00000489554	TXNDC8	Q6A555	127 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SCAMP4-208	ENST00000489554	ZC3H14	Q6PJT7	736 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
SCAMP4-208	ENST00000489554	DENND5B	Q6ZUT9	1274 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SCAMP4-208	ENST00000489554	RRAGA	Q7L523	313 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SCAMP4-208	ENST00000489554	RALGPS2	Q86X27	583 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
SCAMP4-208	ENST00000489554	GPIHBP1	Q8IV16	184 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SCAMP4-208	ENST00000489554	NEK11	Q8NG66	645 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SCAMP4-208	ENST00000489554	OLIG1	Q8TAK6	271 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SCAMP4-208	ENST00000489554	SHC3	Q92529	594 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SCAMP4-208	ENST00000489554	USP13	Q92995	863 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
SCAMP4-208	ENST00000489554	NT5C1B	Q96P26	610 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SCAMP4-208	ENST00000489554	LRRC3B	Q96PB8	259 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SCAMP4-208	ENST00000489554	TTLL2	Q9BWV7	592 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SCAMP4-208	ENST00000489554	DPEP3	Q9H4B8	488 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SCAMP4-208	ENST00000489554	SPATA6	Q9NWH7	488 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
SCAMP4-208	ENST00000489554	DNAJC12	Q9UKB3	198 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SCAMP4-208	ENST00000489554	FBXO4	Q9UKT5	387 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SCAMP4-208	ENST00000489554	NDRG2	Q9UN36	371 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
SCAMP4-208	ENST00000489554	NUP210	Q8TEM1	1887 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
SCAMP4-208	ENST00000489554	TRAV19	A0A0A6YYK7	116 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SCAMP4-208	ENST00000489554		F8VP50	259 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SCAMP4-208	ENST00000489554	GFRA3	O60609	400 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SCAMP4-208	ENST00000489554	USP17L7	P0C7H9	530 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SCAMP4-208	ENST00000489554	PNMA6A	P0CW24	399 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
SCAMP4-208	ENST00000489554	FECH	P22830	423 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SCAMP4-208	ENST00000489554	RAP1GAP	P47736	663 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SCAMP4-208	ENST00000489554	CDH8	P55286	799 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SCAMP4-208	ENST00000489554	GSDMD	P57764	484 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SCAMP4-208	ENST00000489554	CETN1	Q12798	172 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SCAMP4-208	ENST00000489554	CUL2	Q13617	745 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SCAMP4-208	ENST00000489554	TRIM14	Q14142	442 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SCAMP4-208	ENST00000489554	ZNF528	Q3MIS6	628 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SCAMP4-208	ENST00000489554	CC2D1A	Q6P1N0	951 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
SCAMP4-208	ENST00000489554	SCARA5	Q6ZMJ2	495 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SCAMP4-208	ENST00000489554	UNC93A	Q86WB7	457 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SCAMP4-208	ENST00000489554	TMEM139	Q8IV31	216 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SCAMP4-208	ENST00000489554	ZNF687	Q8N1G0	1237 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SCAMP4-208	ENST00000489554	CCDC150	Q8NCX0	1101 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SCAMP4-208	ENST00000489554	NKD2	Q969F2	451 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
SCAMP4-208	ENST00000489554	FAXDC2	Q96IV6	333 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SCAMP4-208	ENST00000489554	DNAJC7	Q99615	494 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SCAMP4-208	ENST00000489554	NUP58	Q9BVL2	599 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SCAMP4-208	ENST00000489554	B3GNT5	Q9BYG0	378 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SCAMP4-208	ENST00000489554	EDEM3	Q9BZQ6	932 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SCAMP4-208	ENST00000489554	ZNF518B	Q9C0D4	1074 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SCAMP4-208	ENST00000489554	NIF3L1	Q9GZT8	377 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SCAMP4-208	ENST00000489554	SMG9	Q9H0W8	520 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
SCAMP4-208	ENST00000489554	SEMA4A	Q9H3S1	761 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SCAMP4-208	ENST00000489554	TRPC7	Q9HCX4	862 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SCAMP4-208	ENST00000489554	UBE2T	Q9NPD8	197 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
SCAMP4-208	ENST00000489554	NLRC4	Q9NPP4	1024 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SCAMP4-208	ENST00000489554	TRPM5	Q9NZQ8	1165 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SCAMP4-208	ENST00000489554	IMPACT	Q9P2X3	320 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SCAMP4-208	ENST00000489554	CNTN6	Q9UQ52	1028 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SCAMP4-208	ENST00000489554	DAAM1	Q9Y4D1	1078 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SCAMP4-208	ENST00000489554	UCHL5	Q9Y5K5	329 aa	Known RBP eCLIP	11.17	□□□□□ -0.62
SCAMP4-208	ENST00000489554	COL4A2	P08572	1712 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SCAMP4-208	ENST00000489554	COL4A3	Q01955	1670 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SCAMP4-208	ENST00000489554	LRRC53	A6NM62	1247 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SCAMP4-208	ENST00000489554		F8VZ95	297 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SCAMP4-208	ENST00000489554	SPECC1L-ADORA2A	F8WAN1	911 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SCAMP4-208	ENST00000489554	CKM	P06732	381 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SCAMP4-208	ENST00000489554	SP9	P0CG40	484 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SCAMP4-208	ENST00000489554	HNRNPH3	P31942	346 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62

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