RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489247.1

ATG4A-208, Transcript of autophagy related 4A cysteine peptidase, human

TSL 2

Gene ATG4A, Length 623 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATG4A-208	ENST00000489247	STK10	O94804	968 aa	Known RBP	5.91	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	MED26	O95402	600 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	SGPL1	O95470	568 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	TBC1D8	O95759	1140 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	FTL	P02792	175 aa	Predicted RBP	5.91	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	IQCF3	P0C7M6	154 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	UNG	P13051	313 aa	Predicted RBP	5.91	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	TNNI1	P19237	187 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	MARK3	P27448	753 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	TMOD1	P28289	359 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	CDH5	P33151	784 aa	Predicted RBP	5.91	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	PIK3CA	P42336	1068 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	PAFAH1B1	P43034	410 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	ACOT2	P49753	483 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	PDE6C	P51160	858 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	HUNK	P57058	714 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	NOP14	P78316	857 aa	Known RBP	5.91	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	ADAM17	P78536	824 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	CLC	Q05315	142 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	DGKD	Q16760	1214 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	CLEC16A	Q2KHT3	1053 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	SGSM1	Q2NKQ1	1148 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	ATF7IP2	Q5U623	682 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	WDR78	Q5VTH9	848 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	ACAD10	Q6JQN1	1059 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	EFCAB12	Q6NXP0	572 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	MTHFD1L	Q6UB35	978 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	TMCO3	Q6UWJ1	677 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	TRMT1L	Q7Z2T5	733 aa	Known RBP	5.91	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	DPP9	Q86TI2	863 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	SLC47A2	Q86VL8	602 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	KIAA0319L	Q8IZA0	1049 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	LRRC71	Q8N4P6	559 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	USP38	Q8NB14	1042 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	OR5B17	Q8NGF7	314 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	CXorf38	Q8TB03	319 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	SLC35G2	Q8TBE7	412 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	DGCR8	Q8WYQ5	773 aa	Known RBP eCLIP	5.91	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	CD101	Q93033	1021 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	ARHGEF26	Q96DR7	871 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	TSPAN18	Q96SJ8	248 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	PNKP	Q96T60	521 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	XYLT2	Q9H1B5	865 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	CARD9	Q9H257	536 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	ADAMTS10	Q9H324	1103 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	ASB7	Q9H672	318 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	MINDY3	Q9H8M7	445 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	VIPAS39	Q9H9C1	493 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF408	Q9H9D4	720 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	APOBEC3G	Q9HC16	384 aa	Known RBP	5.91	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	ARFGAP3	Q9NP61	516 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	SSU72	Q9NP77	194 aa	Known RBP	5.91	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	TAS2R14	Q9NYV8	317 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	L1RE1	Q9UN81	338 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	POLR3K	Q9Y2Y1	108 aa	Predicted RBP	5.91	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	NRCAM	Q92823	1304 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247		A0A1B0GUA9	196 aa		5.9	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	CCDC188	H7C350	402 aa		5.9	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	GFRA2	O00451	464 aa		5.9	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	MEFV	O15553	781 aa	Predicted RBP	5.9	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	ADCY6	O43306	1168 aa		5.9	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	NCK2	O43639	380 aa		5.9	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	ZEB2	O60315	1214 aa		5.9	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	TSPAN1	O60635	241 aa		5.9	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	LEFTY1	O75610	366 aa		5.9	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	LSM8	O95777	96 aa	Known RBP	5.9	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	FTCD	O95954	541 aa		5.9	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	MME	P08473	750 aa		5.9	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	SRGAP2C	P0DJJ0	459 aa		5.9	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	CTNNA2	P26232	953 aa		5.9	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	SSTR4	P31391	388 aa		5.9	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	ATIC	P31939	592 aa		5.9	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	ETFB	P38117	255 aa		5.9	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	RGS2	P41220	211 aa		5.9	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	TM4SF4	P48230	202 aa		5.9	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	CLCN3	P51790	818 aa		5.9	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	VSNL1	P62760	191 aa		5.9	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	PTP4A2	Q12974	167 aa		5.9	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	PPFIA1	Q13136	1202 aa		5.9	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	COL9A2	Q14055	689 aa	Predicted RBP	5.9	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	PPP2R5E	Q16537	467 aa		5.9	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	LONRF2	Q1L5Z9	754 aa		5.9	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	DCAF4L1	Q3SXM0	396 aa		5.9	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF568	Q3ZCX4	644 aa		5.9	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	GJC2	Q5T442	439 aa	Predicted RBP	5.9	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	FBXW10	Q5XX13	1052 aa		5.9	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	EEF1DP3	Q658K8	133 aa		5.9	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	CCDC70	Q6NSX1	233 aa		5.9	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	RGMB	Q6NW40	437 aa		5.9	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	MON1B	Q7L1V2	547 aa		5.9	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	HDX	Q7Z353	690 aa		5.9	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	PEX26	Q7Z412	305 aa		5.9	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	PHF13	Q86YI8	300 aa	Predicted RBP	5.9	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	RHPN2	Q8IUC4	686 aa		5.9	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	PHF6	Q8IWS0	365 aa	Known RBP eCLIP	5.9	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	CD302	Q8IX05	232 aa		5.9	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	EFCAB13	Q8IY85	973 aa		5.9	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	MCOLN2	Q8IZK6	566 aa		5.9	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	METTL13	Q8N6R0	699 aa		5.9	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	OR6J1	Q8NGC5	347 aa		5.9	□□□□□ -1.46

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