RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486964.5

POLR1A-208, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 5

Gene POLR1A, Length 1,427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-208ENST00000486964 CYTH4Q9UIA0 394 aa10.07□□□□□ -0.8
POLR1A-208ENST00000486964 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP10.07□□□□□ -0.8
POLR1A-208ENST00000486964 NR2E1Q9Y466 385 aa10.07□□□□□ -0.8
POLR1A-208ENST00000486964 SNX9Q9Y5X1 595 aa10.07□□□□□ -0.8
POLR1A-208ENST00000486964 CUL9Q8IWT3 2517 aa10.07□□□□□ -0.8
POLR1A-208ENST00000486964 TLDC2A0PJX2 215 aa10.07□□□□□ -0.8
POLR1A-208ENST00000486964 MED7O43513 233 aa10.07□□□□□ -0.8
POLR1A-208ENST00000486964 PSTPIP1O43586 416 aa10.07□□□□□ -0.8
POLR1A-208ENST00000486964 MGRN1O60291 552 aa10.07□□□□□ -0.8
POLR1A-208ENST00000486964 PFKMP08237 780 aa10.07□□□□□ -0.8
POLR1A-208ENST00000486964 VIMP08670 466 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
POLR1A-208ENST00000486964 WARSP23381 471 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
POLR1A-208ENST00000486964 PAX3P23760 479 aa10.07□□□□□ -0.8
POLR1A-208ENST00000486964 RRM1P23921 792 aa10.07□□□□□ -0.8
POLR1A-208ENST00000486964 MLH1P40692 756 aa10.07□□□□□ -0.8
POLR1A-208ENST00000486964 GPD2P43304 727 aa10.07□□□□□ -0.8
POLR1A-208ENST00000486964 GABRB2P47870 512 aa10.07□□□□□ -0.8
POLR1A-208ENST00000486964 KRT17Q04695 432 aa10.07□□□□□ -0.8
POLR1A-208ENST00000486964 UPP1Q16831 310 aa10.07□□□□□ -0.8
POLR1A-208ENST00000486964 SV2CQ496J9 727 aa10.07□□□□□ -0.8
POLR1A-208ENST00000486964 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa10.07□□□□□ -0.8
POLR1A-208ENST00000486964 WLSQ5T9L3 541 aa10.07□□□□□ -0.8
POLR1A-208ENST00000486964 ARHGAP17Q68EM7 881 aa10.07□□□□□ -0.8
POLR1A-208ENST00000486964 DENND1BQ6P3S1 775 aa10.07□□□□□ -0.8
POLR1A-208ENST00000486964 TTC27Q6P3X3 843 aa10.07□□□□□ -0.8
POLR1A-208ENST00000486964 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa10.07□□□□□ -0.8
POLR1A-208ENST00000486964 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa10.07□□□□□ -0.8
POLR1A-208ENST00000486964 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa10.07□□□□□ -0.8
POLR1A-208ENST00000486964 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
POLR1A-208ENST00000486964 RELL1Q8IUW5 271 aa10.07□□□□□ -0.8
POLR1A-208ENST00000486964 CCDC63Q8NA47 563 aa10.07□□□□□ -0.8
POLR1A-208ENST00000486964 VWCEQ96DN2 955 aa10.07□□□□□ -0.8
POLR1A-208ENST00000486964 FTHL17Q9BXU8 183 aa10.07□□□□□ -0.8
POLR1A-208ENST00000486964 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
POLR1A-208ENST00000486964 RSAD1Q9HA92 442 aa10.07□□□□□ -0.8
POLR1A-208ENST00000486964 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa10.07□□□□□ -0.8
POLR1A-208ENST00000486964 ADAM22Q9P0K1 906 aa10.07□□□□□ -0.8
POLR1A-208ENST00000486964 ASIC3Q9UHC3 531 aa10.07□□□□□ -0.8
POLR1A-208ENST00000486964 LGALS13Q9UHV8 139 aa10.07□□□□□ -0.8
POLR1A-208ENST00000486964 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
POLR1A-208ENST00000486964 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa10.06□□□□□ -0.8
POLR1A-208ENST00000486964 ABHD2P08910 425 aa10.06□□□□□ -0.8
POLR1A-208ENST00000486964 RARAP10276 462 aa10.06□□□□□ -0.8
POLR1A-208ENST00000486964 PYGMP11217 842 aa10.06□□□□□ -0.8
POLR1A-208ENST00000486964 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
POLR1A-208ENST00000486964 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
POLR1A-208ENST00000486964 NSFP46459 744 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
POLR1A-208ENST00000486964 GJA8P48165 433 aa10.06□□□□□ -0.8
POLR1A-208ENST00000486964 RPL34P49207 117 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
POLR1A-208ENST00000486964 SCNN1GP51170 649 aa10.06□□□□□ -0.8
POLR1A-208ENST00000486964 DSC1Q08554 894 aa10.06□□□□□ -0.8
POLR1A-208ENST00000486964 FAAP100Q0VG06 881 aa10.06□□□□□ -0.8
POLR1A-208ENST00000486964 MAMLD1Q13495 774 aa10.06□□□□□ -0.8
POLR1A-208ENST00000486964 AUHQ13825 339 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
POLR1A-208ENST00000486964 STILQ15468 1287 aa10.06□□□□□ -0.8
POLR1A-208ENST00000486964 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
POLR1A-208ENST00000486964 TCTN1Q2MV58 587 aa10.06□□□□□ -0.8
POLR1A-208ENST00000486964 LIN9Q5TKA1 542 aa10.06□□□□□ -0.8
POLR1A-208ENST00000486964 CCDC89Q8N998 374 aa10.06□□□□□ -0.8
POLR1A-208ENST00000486964 ANKLE1Q8NAG6 615 aa10.06□□□□□ -0.8
POLR1A-208ENST00000486964 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
POLR1A-208ENST00000486964 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
POLR1A-208ENST00000486964 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
POLR1A-208ENST00000486964 ADAM7Q9H2U9 754 aa10.06□□□□□ -0.8
POLR1A-208ENST00000486964 SEMA4AQ9H3S1 761 aa10.06□□□□□ -0.8
POLR1A-208ENST00000486964 HAUS2Q9NVX0 235 aa10.06□□□□□ -0.8
POLR1A-208ENST00000486964 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa10.06□□□□□ -0.8
POLR1A-208ENST00000486964 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
POLR1A-208ENST00000486964 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
POLR1A-208ENST00000486964 SCINQ9Y6U3 715 aa10.06□□□□□ -0.8
POLR1A-208ENST00000486964 A0A0C4DFX4 3053 aa10.05□□□□□ -0.8
POLR1A-208ENST00000486964 FRMPD3Q5JV73 1810 aa10.05□□□□□ -0.8
POLR1A-208ENST00000486964 TMEM191CA6NGB0 347 aa10.05□□□□□ -0.8
POLR1A-208ENST00000486964 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
POLR1A-208ENST00000486964 SNX3O60493 162 aa10.05□□□□□ -0.8
POLR1A-208ENST00000486964 CDH16O75309 829 aa10.05□□□□□ -0.8
POLR1A-208ENST00000486964 GABBR2O75899 941 aa10.05□□□□□ -0.8
POLR1A-208ENST00000486964 MICAL2O94851 1124 aa10.05□□□□□ -0.8
POLR1A-208ENST00000486964 PARNO95453 639 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
POLR1A-208ENST00000486964 OAS1P00973 400 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
POLR1A-208ENST00000486964 CALB1P05937 261 aa10.05□□□□□ -0.8
POLR1A-208ENST00000486964 LMO2P25791 158 aa10.05□□□□□ -0.8
POLR1A-208ENST00000486964 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
POLR1A-208ENST00000486964 MARCKSL1P49006 195 aa10.05□□□□□ -0.8
POLR1A-208ENST00000486964 CLCNKBP51801 687 aa10.05□□□□□ -0.8
POLR1A-208ENST00000486964 NUBP1P53384 320 aa10.05□□□□□ -0.8
POLR1A-208ENST00000486964 GRIK3Q13003 919 aa10.05□□□□□ -0.8
POLR1A-208ENST00000486964 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
POLR1A-208ENST00000486964 STAT4Q14765 748 aa10.05□□□□□ -0.8
POLR1A-208ENST00000486964 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
POLR1A-208ENST00000486964 CLLU1OSQ5K130 101 aa10.05□□□□□ -0.8
POLR1A-208ENST00000486964 RHBDF2Q6PJF5 856 aa10.05□□□□□ -0.8
POLR1A-208ENST00000486964 OSTM1Q86WC4 334 aa10.05□□□□□ -0.8
POLR1A-208ENST00000486964 PASD1Q8IV76 773 aa10.05□□□□□ -0.8
POLR1A-208ENST00000486964 LRRC34Q8IZ02 419 aa10.05□□□□□ -0.8
POLR1A-208ENST00000486964 C3orf58Q8NDZ4 430 aa10.05□□□□□ -0.8
POLR1A-208ENST00000486964 DBF4BQ8NFT6 615 aa10.05□□□□□ -0.8
POLR1A-208ENST00000486964 MDM1Q8TC05 714 aa10.05□□□□□ -0.8
POLR1A-208ENST00000486964 SPATA18Q8TC71 538 aa10.05□□□□□ -0.8
POLR1A-208ENST00000486964 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21 ms