RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486161.5

PTPRD-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 5,039 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-211ENST00000486161 CILPO75339 1184 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 CLCNKBP51801 687 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 FMO1Q01740 532 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 CDH18Q13634 790 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 IZUMO3Q5VZ72 239 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF449Q6P9G9 518 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 PALB2Q86YC2 1186 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 DEFB106AQ8N104 65 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 FAM84AQ96KN4 292 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 ACP6Q9NPH0 428 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 GJD2Q9UKL4 321 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 PCDHB8Q9UN66 801 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 STAMBPO95630 424 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 VIMP08670 466 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 FGFR1P11362 822 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 PMLP29590 882 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 STIP1P31948 543 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 ETFBP38117 255 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 NR1H3Q13133 447 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 KCNT1Q5JUK3 1230 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 PAK5Q9P286 719 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 STYXL1Q9Y6J8 313 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 SIGLEC16A6NMB1 481 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 USP17L7P0C7H9 530 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 SAT1P21673 171 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 NOS2P35228 1153 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 TBX4P57082 545 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 WDR59Q6PJI9 974 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 GIPC2Q8TF65 315 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP8.62□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 CFAP36Q96G28 342 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 LHX5Q9H2C1 402 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 ATXN3LQ9H3M9 355 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 SLC28A3Q9HAS3 691 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 RSPH14Q9UHP6 348 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 SCN9AQ15858 1988 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 F8VP50 259 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 H0Y626 953 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 SMAPO00193 183 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 NEMP1O14524 444 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 NOMO3P69849 1222 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 ERMARDQ5T6L9 678 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 FYB2Q5VWT5 728 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 VSTM1Q6UX27 236 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 FAM35AQ86V20 835 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 KRT35Q92764 455 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 DUSP16Q9BY84 665 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 DYRK4Q9NR20 520 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 LAMB1P07942 1786 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 MYADML2A6NDP7 307 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 TYMPP19971 482 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 FNTAP49354 379 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 MEI1Q5TIA1 1274 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 ALS2CLQ60I27 953 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 FUT10Q6P4F1 479 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 LCLAT1Q6UWP7 414 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 LRRC15Q8TF66 581 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 SMC6Q96SB8 1091 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 LRRC37AA6NMS7 1700 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 CXCL14O95715 111 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 STX2P32856 288 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 OR1D2P34982 312 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 NUP93Q8N1F7 819 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 C12orf29Q8N999 325 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 ACBD6Q9BR61 282 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 TRAIPQ9BWF2 469 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 CNGB3Q9NQW8 809 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 LAMA4Q16363 1823 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 TCHHQ07283 1943 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 RAPH1Q70E73 1250 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 EFHBQ8N7U6 833 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 GDAP1Q8TB36 358 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 ASIC4Q96FT7 647 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 VPS39Q96JC1 886 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 RAB6BQ9NRW1 208 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 CNTN3Q9P232 1028 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 TLK1Q9UKI8 766 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 GOLGA8MH3BSY2 632 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 RASGRF2O14827 1237 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 KCNE1P15382 129 aa8.61□□□□□ -1.03
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