RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484841.5

ACTB-212, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 1,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-212ENST00000484841 OPRD1P41143 372 aa21.36■■□□□ 1.01
ACTB-212ENST00000484841 DGKEP52429 567 aa21.36■■□□□ 1.01
ACTB-212ENST00000484841 SLC5A3P53794 718 aa21.36■■□□□ 1.01
ACTB-212ENST00000484841 ZXDBP98169 803 aa21.36■■□□□ 1.01
ACTB-212ENST00000484841 DHCR24Q15392 516 aa21.36■■□□□ 1.01
ACTB-212ENST00000484841 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
ACTB-212ENST00000484841 SV2AQ7L0J3 742 aa21.36■■□□□ 1.01
ACTB-212ENST00000484841 KBTBD6Q86V97 674 aa21.36■■□□□ 1.01
ACTB-212ENST00000484841 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa21.36■■□□□ 1.01
ACTB-212ENST00000484841 ELMO3Q96BJ8 720 aa21.36■■□□□ 1.01
ACTB-212ENST00000484841 PNKPQ96T60 521 aa21.36■■□□□ 1.01
ACTB-212ENST00000484841 FBXO44Q9H4M3 255 aa21.36■■□□□ 1.01
ACTB-212ENST00000484841 TMEM30AQ9NV96 361 aa21.36■■□□□ 1.01
ACTB-212ENST00000484841 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa21.36■■□□□ 1.01
ACTB-212ENST00000484841 EML5Q05BV3 1969 aa21.36■■□□□ 1.01
ACTB-212ENST00000484841 E2F8A0AVK6 867 aa21.35■■□□□ 1.01
ACTB-212ENST00000484841 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
ACTB-212ENST00000484841 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
ACTB-212ENST00000484841 SLC30A4O14863 429 aa21.35■■□□□ 1.01
ACTB-212ENST00000484841 MAPK13O15264 365 aa21.35■■□□□ 1.01
ACTB-212ENST00000484841 EPN2O95208 641 aa21.35■■□□□ 1.01
ACTB-212ENST00000484841 APODP05090 189 aa21.35■■□□□ 1.01
ACTB-212ENST00000484841 NR2F2P24468 414 aa21.35■■□□□ 1.01
ACTB-212ENST00000484841 NDUFA8P51970 172 aa21.35■■□□□ 1.01
ACTB-212ENST00000484841 NDST1P52848 882 aa21.35■■□□□ 1.01
ACTB-212ENST00000484841 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
ACTB-212ENST00000484841 BTBD8Q5XKL5 378 aa21.35■■□□□ 1.01
ACTB-212ENST00000484841 IL31Q6EBC2 164 aa21.35■■□□□ 1.01
ACTB-212ENST00000484841 SCAMP5Q8TAC9 235 aa21.35■■□□□ 1.01
ACTB-212ENST00000484841 SLC2A14Q8TDB8 520 aa21.35■■□□□ 1.01
ACTB-212ENST00000484841 OTUB2Q96DC9 234 aa21.35■■□□□ 1.01
ACTB-212ENST00000484841 SDCBP2Q9H190 292 aa21.35■■□□□ 1.01
ACTB-212ENST00000484841 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
ACTB-212ENST00000484841 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
ACTB-212ENST00000484841 EBF1Q9UH73 591 aa21.35■■□□□ 1.01
ACTB-212ENST00000484841 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa21.35■■□□□ 1.01
ACTB-212ENST00000484841 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa21.35■■□□□ 1.01
ACTB-212ENST00000484841 SPAG17Q6Q759 2223 aa21.35■■□□□ 1.01
ACTB-212ENST00000484841 COCHO43405 550 aa21.34■■□□□ 1.01
ACTB-212ENST00000484841 ALDH1A2O94788 518 aa21.34■■□□□ 1.01
ACTB-212ENST00000484841 RHOBTB3O94955 611 aa21.34■■□□□ 1.01
ACTB-212ENST00000484841 HLA-DRAP01903 254 aa21.34■■□□□ 1.01
ACTB-212ENST00000484841 ADH5P11766 374 aa21.34■■□□□ 1.01
ACTB-212ENST00000484841 CCDC130P13994 396 aa21.34■■□□□ 1.01
ACTB-212ENST00000484841 GBP1P32455 592 aa21.34■■□□□ 1.01
ACTB-212ENST00000484841 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
ACTB-212ENST00000484841 TUBP50607 506 aa21.34■■□□□ 1.01
ACTB-212ENST00000484841 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
ACTB-212ENST00000484841 GAD2Q05329 585 aa21.34■■□□□ 1.01
ACTB-212ENST00000484841 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
ACTB-212ENST00000484841 NUDT18Q6ZVK8 323 aa21.34■■□□□ 1.01
ACTB-212ENST00000484841 C11orf74Q86VG3 221 aa21.34■■□□□ 1.01
ACTB-212ENST00000484841 TTC30AQ86WT1 665 aa21.34■■□□□ 1.01
ACTB-212ENST00000484841 FUKQ8N0W3 1084 aa21.34■■□□□ 1.01
ACTB-212ENST00000484841 CRYBG2Q8N1P7 616 aa21.34■■□□□ 1.01
ACTB-212ENST00000484841 USP33Q8TEY7 942 aa21.34■■□□□ 1.01
ACTB-212ENST00000484841 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
ACTB-212ENST00000484841 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
ACTB-212ENST00000484841 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
ACTB-212ENST00000484841 MMRN2Q9H8L6 949 aa21.34■■□□□ 1.01
ACTB-212ENST00000484841 ASS1P00966 412 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
ACTB-212ENST00000484841 PRR29P0C7W0 189 aa21.33■■□□□ 1.01
ACTB-212ENST00000484841 ZNF806P0C7X5 589 aa21.33■■□□□ 1.01
ACTB-212ENST00000484841 FAM200BP0CF97 657 aa21.33■■□□□ 1.01
ACTB-212ENST00000484841 ADORA2BP29275 332 aa21.33■■□□□ 1.01
ACTB-212ENST00000484841 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
ACTB-212ENST00000484841 MAP3K7CLP57077 242 aa21.33■■□□□ 1.01
ACTB-212ENST00000484841 GOLGA8FQ08AF8 430 aa21.33■■□□□ 1.01
ACTB-212ENST00000484841 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa21.33■■□□□ 1.01
ACTB-212ENST00000484841 ORC1Q13415 861 aa21.33■■□□□ 1.01
ACTB-212ENST00000484841 CCDC6Q16204 474 aa21.33■■□□□ 1.01
ACTB-212ENST00000484841 SNX30Q5VWJ9 437 aa21.33■■□□□ 1.01
ACTB-212ENST00000484841 SPOPLQ6IQ16 392 aa21.33■■□□□ 1.01
ACTB-212ENST00000484841 KRBA2Q6ZNG9 492 aa21.33■■□□□ 1.01
ACTB-212ENST00000484841 PAQR9Q6ZVX9 377 aa21.33■■□□□ 1.01
ACTB-212ENST00000484841 FAM186BQ8IYM0 893 aa21.33■■□□□ 1.01
ACTB-212ENST00000484841 CCDC33Q8N5R6 958 aa21.33■■□□□ 1.01
ACTB-212ENST00000484841 ARHGEF4Q9NR80 690 aa21.33■■□□□ 1.01
ACTB-212ENST00000484841 FAM49BQ9NUQ9 324 aa21.33■■□□□ 1.01
ACTB-212ENST00000484841 GMIPQ9P107 970 aa21.33■■□□□ 1.01
ACTB-212ENST00000484841 A0A1W2PQ27 194 aa21.32■■□□□ 1
ACTB-212ENST00000484841 A0A1W2PQ64 194 aa21.32■■□□□ 1
ACTB-212ENST00000484841 A0A1W2PQD8 194 aa21.32■■□□□ 1
ACTB-212ENST00000484841 K7EQS6 105 aa21.32■■□□□ 1
ACTB-212ENST00000484841 TNFRSF10BO14763 440 aa21.32■■□□□ 1
ACTB-212ENST00000484841 KAT7O95251 611 aa21.32■■□□□ 1
ACTB-212ENST00000484841 KCNA4P22459 653 aa21.32■■□□□ 1
ACTB-212ENST00000484841 DPYDQ12882 1025 aa21.32■■□□□ 1
ACTB-212ENST00000484841 ADAM9Q13443 819 aa21.32■■□□□ 1
ACTB-212ENST00000484841 NFIL3Q16649 462 aa21.32■■□□□ 1
ACTB-212ENST00000484841 PLK5Q496M5 336 aa21.32■■□□□ 1
ACTB-212ENST00000484841 RHBDF2Q6PJF5 856 aa21.32■■□□□ 1
ACTB-212ENST00000484841 NT5C1AQ9BXI3 368 aa21.32■■□□□ 1
ACTB-212ENST00000484841 CCSER2Q9H7U1 834 aa21.32■■□□□ 1
ACTB-212ENST00000484841 CYP3A43Q9HB55 503 aa21.32■■□□□ 1
ACTB-212ENST00000484841 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP21.32■■□□□ 17e-9■■■■■ 36.6
ACTB-212ENST00000484841 MMP17Q9ULZ9 603 aa21.32■■□□□ 1
ACTB-212ENST00000484841 GPR179Q6PRD1 2367 aa21.31■■□□□ 1
ACTB-212ENST00000484841 IRF1P10914 325 aa21.31■■□□□ 1
ACTB-212ENST00000484841 TIE1P35590 1138 aa21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.1 ms