RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484101.5

UFD1-208, Transcript of ubiquitin recognition factor in ER associated degradation 1, human

TSL 5

Gene UFD1, Length 751 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UFD1-208	ENST00000484101	ST3GAL5	Q9UNP4	418 aa		10.09	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	ATP8A1	Q9Y2Q0	1164 aa		10.09	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	NEU2	Q9Y3R4	380 aa		10.09	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	HES2	Q9Y543	173 aa		10.09	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	PTGES	O14684	152 aa		10.08	□□□□□ -0.8
UFD1-208	ENST00000484101	GABRD	O14764	452 aa		10.08	□□□□□ -0.8
UFD1-208	ENST00000484101	MCF2L	O15068	1137 aa		10.08	□□□□□ -0.8
UFD1-208	ENST00000484101	ENDOD1	O94919	500 aa		10.08	□□□□□ -0.8
UFD1-208	ENST00000484101	GJB6	O95452	261 aa		10.08	□□□□□ -0.8
UFD1-208	ENST00000484101	PGK1	P00558	417 aa		10.08	□□□□□ -0.8
UFD1-208	ENST00000484101	ABHD2	P08910	425 aa		10.08	□□□□□ -0.8
UFD1-208	ENST00000484101	CCL5	P13501	91 aa		10.08	□□□□□ -0.8
UFD1-208	ENST00000484101	CAPN2	P17655	700 aa		10.08	□□□□□ -0.8
UFD1-208	ENST00000484101	TGM2	P21980	687 aa		10.08	□□□□□ -0.8
UFD1-208	ENST00000484101	KLRC2	P26717	231 aa		10.08	□□□□□ -0.8
UFD1-208	ENST00000484101	KCNJ1	P48048	391 aa		10.08	□□□□□ -0.8
UFD1-208	ENST00000484101	AIF1	P55008	147 aa		10.08	□□□□□ -0.8
UFD1-208	ENST00000484101	ORC1	Q13415	861 aa		10.08	□□□□□ -0.8
UFD1-208	ENST00000484101	SNX1	Q13596	522 aa		10.08	□□□□□ -0.8
UFD1-208	ENST00000484101	PTGIS	Q16647	500 aa		10.08	□□□□□ -0.8
UFD1-208	ENST00000484101	KRT71	Q3SY84	523 aa		10.08	□□□□□ -0.8
UFD1-208	ENST00000484101	TTMP	Q5BVD1	217 aa		10.08	□□□□□ -0.8
UFD1-208	ENST00000484101	CCSAP	Q6IQ19	270 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
UFD1-208	ENST00000484101	STRADA	Q7RTN6	431 aa		10.08	□□□□□ -0.8
UFD1-208	ENST00000484101	CNPY4	Q8N129	248 aa		10.08	□□□□□ -0.8
UFD1-208	ENST00000484101	ZCCHC9	Q8N567	271 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
UFD1-208	ENST00000484101	MAFA	Q8NHW3	353 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
UFD1-208	ENST00000484101	UBA3	Q8TBC4	463 aa		10.08	□□□□□ -0.8
UFD1-208	ENST00000484101	RXFP2	Q8WXD0	754 aa		10.08	□□□□□ -0.8
UFD1-208	ENST00000484101	ATG4A	Q8WYN0	398 aa		10.08	□□□□□ -0.8
UFD1-208	ENST00000484101	HAUS1	Q96CS2	278 aa		10.08	□□□□□ -0.8
UFD1-208	ENST00000484101	CCDC77	Q9BR77	488 aa		10.08	□□□□□ -0.8
UFD1-208	ENST00000484101	HEMGN	Q9BXL5	484 aa		10.08	□□□□□ -0.8
UFD1-208	ENST00000484101	CAPS2	Q9BXY5	557 aa		10.08	□□□□□ -0.8
UFD1-208	ENST00000484101	FRMD8	Q9BZ67	464 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
UFD1-208	ENST00000484101	TSPYL2	Q9H2G4	693 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
UFD1-208	ENST00000484101	RRN3	Q9NYV6	651 aa		10.08	□□□□□ -0.8
UFD1-208	ENST00000484101	RCOR3	Q9P2K3	495 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
UFD1-208	ENST00000484101	ZNF148	Q9UQR1	794 aa		10.08	□□□□□ -0.8
UFD1-208	ENST00000484101	NOD1	Q9Y239	953 aa		10.08	□□□□□ -0.8
UFD1-208	ENST00000484101	R3HDM2	Q9Y2K5	976 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
UFD1-208	ENST00000484101	LAMA2	P24043	3122 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
UFD1-208	ENST00000484101	PATJ	Q8NI35	1801 aa		10.07	□□□□□ -0.8
UFD1-208	ENST00000484101	TRBV21OR9-2	A0A075B6F4	123 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
UFD1-208	ENST00000484101		A0A0U1RQF3	1178 aa		10.07	□□□□□ -0.8
UFD1-208	ENST00000484101	CYB561D2	O14569	222 aa		10.07	□□□□□ -0.8
UFD1-208	ENST00000484101	DNALI1	O14645	258 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
UFD1-208	ENST00000484101	PPEF2	O14830	753 aa		10.07	□□□□□ -0.8
UFD1-208	ENST00000484101	EIF3H	O15372	352 aa	Known RBP eCLIP	10.07	□□□□□ -0.8
UFD1-208	ENST00000484101	RIPK2	O43353	540 aa		10.07	□□□□□ -0.8
UFD1-208	ENST00000484101	DAB1	O75553	588 aa		10.07	□□□□□ -0.8
UFD1-208	ENST00000484101	TCEA3	O75764	348 aa		10.07	□□□□□ -0.8
UFD1-208	ENST00000484101	AGT	P01019	485 aa		10.07	□□□□□ -0.8
UFD1-208	ENST00000484101	CHRNA1	P02708	482 aa		10.07	□□□□□ -0.8
UFD1-208	ENST00000484101	ODC1	P11926	461 aa		10.07	□□□□□ -0.8
UFD1-208	ENST00000484101	NPR3	P17342	541 aa		10.07	□□□□□ -0.8
UFD1-208	ENST00000484101	IVD	P26440	423 aa		10.07	□□□□□ -0.8
UFD1-208	ENST00000484101	STIP1	P31948	543 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
UFD1-208	ENST00000484101	ACTN2	P35609	894 aa		10.07	□□□□□ -0.8
UFD1-208	ENST00000484101	THPO	P40225	353 aa		10.07	□□□□□ -0.8
UFD1-208	ENST00000484101	ZNF135	P52742	658 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
UFD1-208	ENST00000484101	ITGA8	P53708	1063 aa		10.07	□□□□□ -0.8
UFD1-208	ENST00000484101	PDE4C	Q08493	712 aa		10.07	□□□□□ -0.8
UFD1-208	ENST00000484101	KRT81	Q14533	505 aa		10.07	□□□□□ -0.8
UFD1-208	ENST00000484101	MAPRE1	Q15691	268 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
UFD1-208	ENST00000484101	KCNA10	Q16322	511 aa		10.07	□□□□□ -0.8
UFD1-208	ENST00000484101	IZUMO3	Q5VZ72	239 aa		10.07	□□□□□ -0.8
UFD1-208	ENST00000484101	KAZN	Q674X7	775 aa		10.07	□□□□□ -0.8
UFD1-208	ENST00000484101	MFSD5	Q6N075	450 aa		10.07	□□□□□ -0.8
UFD1-208	ENST00000484101	HIBCH	Q6NVY1	386 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
UFD1-208	ENST00000484101	PMF1	Q6P1K2	205 aa		10.07	□□□□□ -0.8
UFD1-208	ENST00000484101	PPP1R21	Q6ZMI0	780 aa		10.07	□□□□□ -0.8
UFD1-208	ENST00000484101	BZW1	Q7L1Q6	419 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
UFD1-208	ENST00000484101	TAOK1	Q7L7X3	1001 aa		10.07	□□□□□ -0.8
UFD1-208	ENST00000484101	RIBC1	Q8N443	379 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
UFD1-208	ENST00000484101	SLAIN1	Q8ND83	568 aa		10.07	□□□□□ -0.8
UFD1-208	ENST00000484101	TRAF3IP1	Q8TDR0	691 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
UFD1-208	ENST00000484101	RIN2	Q8WYP3	895 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
UFD1-208	ENST00000484101	RAPGEF5	Q92565	580 aa		10.07	□□□□□ -0.8
UFD1-208	ENST00000484101	CENPI	Q92674	756 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
UFD1-208	ENST00000484101	DUSP16	Q9BY84	665 aa		10.07	□□□□□ -0.8
UFD1-208	ENST00000484101	RNF208	Q9H0X6	261 aa		10.07	□□□□□ -0.8
UFD1-208	ENST00000484101	ZWILCH	Q9H900	591 aa		10.07	□□□□□ -0.8
UFD1-208	ENST00000484101	FAM49B	Q9NUQ9	324 aa		10.07	□□□□□ -0.8
UFD1-208	ENST00000484101	KLK14	Q9P0G3	267 aa		10.07	□□□□□ -0.8
UFD1-208	ENST00000484101	CDH9	Q9ULB4	789 aa		10.07	□□□□□ -0.8
UFD1-208	ENST00000484101	ZMYND8	Q9ULU4	1186 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
UFD1-208	ENST00000484101	STAP1	Q9ULZ2	295 aa		10.07	□□□□□ -0.8
UFD1-208	ENST00000484101	PI4K2B	G5E9Z4	385 aa		10.06	□□□□□ -0.8
UFD1-208	ENST00000484101	PAPSS1	O43252	624 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
UFD1-208	ENST00000484101	CST8	O60676	142 aa		10.06	□□□□□ -0.8
UFD1-208	ENST00000484101	TTC4	O95801	387 aa		10.06	□□□□□ -0.8
UFD1-208	ENST00000484101	CYP11A1	P05108	521 aa		10.06	□□□□□ -0.8
UFD1-208	ENST00000484101	FAM200B	P0CF97	657 aa		10.06	□□□□□ -0.8
UFD1-208	ENST00000484101	COL6A1	P12109	1028 aa		10.06	□□□□□ -0.8
UFD1-208	ENST00000484101	TSHR	P16473	764 aa		10.06	□□□□□ -0.8
UFD1-208	ENST00000484101	PTPN1	P18031	435 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
UFD1-208	ENST00000484101	IL1R2	P27930	398 aa		10.06	□□□□□ -0.8
UFD1-208	ENST00000484101	FLT3	P36888	993 aa		10.06	□□□□□ -0.8
UFD1-208	ENST00000484101	MLH1	P40692	756 aa		10.06	□□□□□ -0.8

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