RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483873.6

GTF3C4-202, Transcript of general transcription factor IIIC subunit 4, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene GTF3C4, Length 1,417 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C4-202ENST00000483873 LRSAM1Q6UWE0 723 aa27.95■■■□□ 2.07
GTF3C4-202ENST00000483873 LCLAT1Q6UWP7 414 aa27.95■■■□□ 2.07
GTF3C4-202ENST00000483873 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP27.95■■■□□ 2.07
GTF3C4-202ENST00000483873 BPIFB1Q8TDL5 484 aa27.95■■■□□ 2.07
GTF3C4-202ENST00000483873 SHC3Q92529 594 aa27.95■■■□□ 2.07
GTF3C4-202ENST00000483873 ZFYVE19Q96K21 471 aa27.95■■■□□ 2.07
GTF3C4-202ENST00000483873 RNF38Q9H0F5 515 aa27.95■■■□□ 2.07
GTF3C4-202ENST00000483873 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa27.95■■■□□ 2.07
GTF3C4-202ENST00000483873 FHOD1Q9Y613 1164 aa27.95■■■□□ 2.07
GTF3C4-202ENST00000483873 KMT2EQ8IZD2 1858 aa27.94■■■□□ 2.06
GTF3C4-202ENST00000483873 OAS1P00973 400 aaKnown RBP27.94■■■□□ 2.06
GTF3C4-202ENST00000483873 TPM2P07951 284 aa27.94■■■□□ 2.06
GTF3C4-202ENST00000483873 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa27.94■■■□□ 2.06
GTF3C4-202ENST00000483873 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP27.94■■■□□ 2.06
GTF3C4-202ENST00000483873 USP8P40818 1118 aa27.94■■■□□ 2.06
GTF3C4-202ENST00000483873 CNGA2Q16280 664 aa27.94■■■□□ 2.06
GTF3C4-202ENST00000483873 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa27.94■■■□□ 2.06
GTF3C4-202ENST00000483873 YAF2Q8IY57 180 aa27.94■■■□□ 2.06
GTF3C4-202ENST00000483873 ARHGEF3Q9NR81 526 aa27.94■■■□□ 2.06
GTF3C4-202ENST00000483873 SCML2Q9UQR0 700 aa27.94■■■□□ 2.06
GTF3C4-202ENST00000483873 ZNF263O14978 683 aa27.93■■■□□ 2.06
GTF3C4-202ENST00000483873 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP27.93■■■□□ 2.06
GTF3C4-202ENST00000483873 ZNF445P59923 1031 aa27.93■■■□□ 2.06
GTF3C4-202ENST00000483873 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP27.93■■■□□ 2.06
GTF3C4-202ENST00000483873 IQCB1Q15051 598 aa27.93■■■□□ 2.06
GTF3C4-202ENST00000483873 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa27.93■■■□□ 2.06
GTF3C4-202ENST00000483873 SNX30Q5VWJ9 437 aa27.93■■■□□ 2.06
GTF3C4-202ENST00000483873 TTC16Q8NEE8 873 aa27.93■■■□□ 2.06
GTF3C4-202ENST00000483873 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa27.93■■■□□ 2.06
GTF3C4-202ENST00000483873 UBXN6Q9BZV1 441 aa27.93■■■□□ 2.06
GTF3C4-202ENST00000483873 CCSER2Q9H7U1 834 aa27.93■■■□□ 2.06
GTF3C4-202ENST00000483873 KIF9Q9HAQ2 790 aa27.93■■■□□ 2.06
GTF3C4-202ENST00000483873 USP3Q9Y6I4 520 aa27.93■■■□□ 2.06
GTF3C4-202ENST00000483873 M0QYV0 167 aa27.92■■■□□ 2.06
GTF3C4-202ENST00000483873 ARNTLO00327 626 aa27.92■■■□□ 2.06
GTF3C4-202ENST00000483873 OLFM2O95897 454 aa27.92■■■□□ 2.06
GTF3C4-202ENST00000483873 SLC8A3P57103 927 aa27.92■■■□□ 2.06
GTF3C4-202ENST00000483873 ZXDBP98169 803 aa27.92■■■□□ 2.06
GTF3C4-202ENST00000483873 PFKPQ01813 784 aa27.92■■■□□ 2.06
GTF3C4-202ENST00000483873 RAB41Q5JT25 222 aa27.92■■■□□ 2.06
GTF3C4-202ENST00000483873 NMUR1Q9HB89 426 aa27.92■■■□□ 2.06
GTF3C4-202ENST00000483873 OSER1Q9NX31 292 aa27.92■■■□□ 2.06
GTF3C4-202ENST00000483873 SMTNL1A8MU46 457 aa27.92■■■□□ 2.06
GTF3C4-202ENST00000483873 LGALS16A8MUM7 142 aa27.92■■■□□ 2.06
GTF3C4-202ENST00000483873 COCHO43405 550 aa27.92■■■□□ 2.06
GTF3C4-202ENST00000483873 SETSIPP0DME0 302 aa27.92■■■□□ 2.06
GTF3C4-202ENST00000483873 PFKLP17858 780 aa27.92■■■□□ 2.06
GTF3C4-202ENST00000483873 GNA15P30679 374 aa27.92■■■□□ 2.06
GTF3C4-202ENST00000483873 USP4Q13107 963 aa27.92■■■□□ 2.06
GTF3C4-202ENST00000483873 STILQ15468 1287 aa27.92■■■□□ 2.06
GTF3C4-202ENST00000483873 ZNF77Q15935 545 aa27.92■■■□□ 2.06
GTF3C4-202ENST00000483873 FKBP15Q5T1M5 1219 aa27.92■■■□□ 2.06
GTF3C4-202ENST00000483873 IRF7Q92985 503 aa27.92■■■□□ 2.06
GTF3C4-202ENST00000483873 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP27.92■■■□□ 2.06
GTF3C4-202ENST00000483873 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP27.92■■■□□ 2.06
GTF3C4-202ENST00000483873 HEBP1Q9NRV9 189 aa27.92■■■□□ 2.06
GTF3C4-202ENST00000483873 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa27.92■■■□□ 2.06
GTF3C4-202ENST00000483873 A0A1W2PQH9 124 aa27.91■■■□□ 2.06
GTF3C4-202ENST00000483873 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP27.91■■■□□ 2.06
GTF3C4-202ENST00000483873 CHADO15335 359 aa27.91■■■□□ 2.06
GTF3C4-202ENST00000483873 PLA2G4AP47712 749 aa27.91■■■□□ 2.06
GTF3C4-202ENST00000483873 PDE6CP51160 858 aa27.91■■■□□ 2.06
GTF3C4-202ENST00000483873 RAPGEF1Q13905 1077 aa27.91■■■□□ 2.06
GTF3C4-202ENST00000483873 SLC44A4Q53GD3 710 aa27.91■■■□□ 2.06
GTF3C4-202ENST00000483873 HECTD3Q5T447 861 aa27.91■■■□□ 2.06
GTF3C4-202ENST00000483873 CCDC186Q7Z3E2 898 aa27.91■■■□□ 2.06
GTF3C4-202ENST00000483873 FBXL6Q8N531 539 aa27.91■■■□□ 2.06
GTF3C4-202ENST00000483873 SH3RF2Q8TEC5 729 aa27.91■■■□□ 2.06
GTF3C4-202ENST00000483873 DNASE1L2Q92874 299 aa27.91■■■□□ 2.06
GTF3C4-202ENST00000483873 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP27.91■■■□□ 2.06
GTF3C4-202ENST00000483873 GANQ9H2C0 597 aa27.91■■■□□ 2.06
GTF3C4-202ENST00000483873 MFSD1Q9H3U5 465 aa27.91■■■□□ 2.06
GTF3C4-202ENST00000483873 CBX8Q9HC52 389 aa27.91■■■□□ 2.06
GTF3C4-202ENST00000483873 SMPD4Q9NXE4 827 aa27.91■■■□□ 2.06
GTF3C4-202ENST00000483873 CPQQ9Y646 472 aa27.91■■■□□ 2.06
GTF3C4-202ENST00000483873 LRRC10BA6NIK2 292 aa27.9■■■□□ 2.06
GTF3C4-202ENST00000483873 THAP12O43422 761 aa27.9■■■□□ 2.06
GTF3C4-202ENST00000483873 UCHL3P15374 230 aa27.9■■■□□ 2.06
GTF3C4-202ENST00000483873 RGS7P49802 495 aa27.9■■■□□ 2.06
GTF3C4-202ENST00000483873 TKTL1P51854 596 aa27.9■■■□□ 2.06
GTF3C4-202ENST00000483873 SLC7A9P82251 487 aa27.9■■■□□ 2.06
GTF3C4-202ENST00000483873 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP27.9■■■□□ 2.06
GTF3C4-202ENST00000483873 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP27.9■■■□□ 2.06
GTF3C4-202ENST00000483873 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa27.9■■■□□ 2.06
GTF3C4-202ENST00000483873 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP27.9■■■□□ 2.06
GTF3C4-202ENST00000483873 SCD5Q86SK9 330 aa27.9■■■□□ 2.06
GTF3C4-202ENST00000483873 FLCNQ8NFG4 579 aa27.9■■■□□ 2.06
GTF3C4-202ENST00000483873 SLC35F5Q8WV83 523 aa27.9■■■□□ 2.06
GTF3C4-202ENST00000483873 ZNF606Q8WXB4 792 aa27.9■■■□□ 2.06
GTF3C4-202ENST00000483873 ULBP1Q9BZM6 244 aa27.9■■■□□ 2.06
GTF3C4-202ENST00000483873 TSPY26PQ9H489 355 aa27.9■■■□□ 2.06
GTF3C4-202ENST00000483873 PLCB1Q9NQ66 1216 aa27.9■■■□□ 2.06
GTF3C4-202ENST00000483873 SIK3Q9Y2K2 1263 aa27.9■■■□□ 2.06
GTF3C4-202ENST00000483873 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa27.89■■■□□ 2.06
GTF3C4-202ENST00000483873 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP27.89■■■□□ 2.06
GTF3C4-202ENST00000483873 ADIGQ0VDE8 80 aa27.89■■■□□ 2.06
GTF3C4-202ENST00000483873 MTF1Q14872 753 aa27.89■■■□□ 2.06
GTF3C4-202ENST00000483873 SYCP1Q15431 976 aa27.89■■■□□ 2.06
GTF3C4-202ENST00000483873 PMF1Q6P1K2 205 aa27.89■■■□□ 2.06
GTF3C4-202ENST00000483873 DENND1BQ6P3S1 775 aa27.89■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22 ms