RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 CDKAL1Q5VV42 579 aa22.11■■□□□ 1.13
ACTB-211ENST00000480301 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
ACTB-211ENST00000480301 PIGZQ86VD9 579 aa22.11■■□□□ 1.13
ACTB-211ENST00000480301 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa22.11■■□□□ 1.13
ACTB-211ENST00000480301 SH3RF2Q8TEC5 729 aa22.11■■□□□ 1.13
ACTB-211ENST00000480301 SIX2Q9NPC8 291 aa22.11■■□□□ 1.13
ACTB-211ENST00000480301 GKN1Q9NS71 199 aa22.11■■□□□ 1.13
ACTB-211ENST00000480301 F5P12259 2224 aa22.11■■□□□ 1.13
ACTB-211ENST00000480301 TULP2O00295 520 aa22.1■■□□□ 1.13
ACTB-211ENST00000480301 CALCAP01258 141 aa22.1■■□□□ 1.13
ACTB-211ENST00000480301 COL4A2P08572 1712 aa22.1■■□□□ 1.13
ACTB-211ENST00000480301 RFX1P22670 979 aa22.1■■□□□ 1.13
ACTB-211ENST00000480301 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
ACTB-211ENST00000480301 TYRO3Q06418 890 aa22.1■■□□□ 1.13
ACTB-211ENST00000480301 TNK2Q07912 1038 aa22.1■■□□□ 1.13
ACTB-211ENST00000480301 PDE4CQ08493 712 aa22.1■■□□□ 1.13
ACTB-211ENST00000480301 CNGA2Q16280 664 aa22.1■■□□□ 1.13
ACTB-211ENST00000480301 PKDCCQ504Y2 493 aa22.1■■□□□ 1.13
ACTB-211ENST00000480301 RAB41Q5JT25 222 aa22.1■■□□□ 1.13
ACTB-211ENST00000480301 HECTD3Q5T447 861 aa22.1■■□□□ 1.13
ACTB-211ENST00000480301 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa22.1■■□□□ 1.13
ACTB-211ENST00000480301 LCLAT1Q6UWP7 414 aa22.1■■□□□ 1.13
ACTB-211ENST00000480301 CCSER2Q9H7U1 834 aa22.1■■□□□ 1.13
ACTB-211ENST00000480301 LTB4R2Q9NPC1 389 aa22.1■■□□□ 1.13
ACTB-211ENST00000480301 FANCLQ9NW38 375 aa22.1■■□□□ 1.13
ACTB-211ENST00000480301 GTSE1Q9NYZ3 720 aa22.1■■□□□ 1.13
ACTB-211ENST00000480301 HESX1Q9UBX0 185 aa22.1■■□□□ 1.13
ACTB-211ENST00000480301 APEX2Q9UBZ4 518 aa22.1■■□□□ 1.13
ACTB-211ENST00000480301 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
ACTB-211ENST00000480301 PIAS3Q9Y6X2 628 aa22.1■■□□□ 1.13
ACTB-211ENST00000480301 MYH10P35580 1976 aa22.1■■□□□ 1.13
ACTB-211ENST00000480301 KMT2EQ8IZD2 1858 aa22.09■■□□□ 1.13
ACTB-211ENST00000480301 CYP26A1O43174 497 aa22.09■■□□□ 1.13
ACTB-211ENST00000480301 COCHO43405 550 aa22.09■■□□□ 1.13
ACTB-211ENST00000480301 GLULP15104 373 aa22.09■■□□□ 1.13
ACTB-211ENST00000480301 TUBP50607 506 aa22.09■■□□□ 1.13
ACTB-211ENST00000480301 MFAP3P55082 362 aa22.09■■□□□ 1.13
ACTB-211ENST00000480301 MTF1Q14872 753 aa22.09■■□□□ 1.13
ACTB-211ENST00000480301 TRIM68Q6AZZ1 485 aa22.09■■□□□ 1.13
ACTB-211ENST00000480301 ZNF852Q6ZMS4 543 aa22.09■■□□□ 1.13
ACTB-211ENST00000480301 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa22.09■■□□□ 1.13
ACTB-211ENST00000480301 PJA1Q8NG27 643 aa22.09■■□□□ 1.13
ACTB-211ENST00000480301 TTC8Q8TAM2 541 aa22.09■■□□□ 1.13
ACTB-211ENST00000480301 UBA3Q8TBC4 463 aa22.09■■□□□ 1.13
ACTB-211ENST00000480301 FAM81BQ96LP2 452 aa22.09■■□□□ 1.13
ACTB-211ENST00000480301 KCNH6Q9H252 994 aa22.09■■□□□ 1.13
ACTB-211ENST00000480301 HPS4Q9NQG7 708 aa22.09■■□□□ 1.13
ACTB-211ENST00000480301 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
ACTB-211ENST00000480301 OSER1Q9NX31 292 aa22.09■■□□□ 1.13
ACTB-211ENST00000480301 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa22.09■■□□□ 1.13
ACTB-211ENST00000480301 SIT1Q9Y3P8 196 aa22.09■■□□□ 1.13
ACTB-211ENST00000480301 CPQQ9Y646 472 aa22.09■■□□□ 1.13
ACTB-211ENST00000480301 PATJQ8NI35 1801 aa22.08■■□□□ 1.13
ACTB-211ENST00000480301 LEFTY2O00292 366 aa22.08■■□□□ 1.13
ACTB-211ENST00000480301 MAN2B1O00754 1011 aa22.08■■□□□ 1.13
ACTB-211ENST00000480301 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
ACTB-211ENST00000480301 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
ACTB-211ENST00000480301 BRD2P25440 801 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
ACTB-211ENST00000480301 SOX9P48436 509 aa22.08■■□□□ 1.13
ACTB-211ENST00000480301 NUBP1P53384 320 aa22.08■■□□□ 1.13
ACTB-211ENST00000480301 BCAT1P54687 386 aa22.08■■□□□ 1.13
ACTB-211ENST00000480301 SLC8A3P57103 927 aa22.08■■□□□ 1.13
ACTB-211ENST00000480301 BST2Q10589 180 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
ACTB-211ENST00000480301 KCNMA1Q12791 1236 aa22.08■■□□□ 1.13
ACTB-211ENST00000480301 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
ACTB-211ENST00000480301 CCDC186Q7Z3E2 898 aa22.08■■□□□ 1.13
ACTB-211ENST00000480301 ZNF687Q8N1G0 1237 aa22.08■■□□□ 1.13
ACTB-211ENST00000480301 TTC16Q8NEE8 873 aa22.08■■□□□ 1.13
ACTB-211ENST00000480301 OSCP1Q8WVF1 389 aa22.08■■□□□ 1.13
ACTB-211ENST00000480301 OSBPL6Q9BZF3 934 aa22.08■■□□□ 1.13
ACTB-211ENST00000480301 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
ACTB-211ENST00000480301 NMUR1Q9HB89 426 aa22.08■■□□□ 1.13
ACTB-211ENST00000480301 SMPD4Q9NXE4 827 aa22.08■■□□□ 1.13
ACTB-211ENST00000480301 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP22.08■■□□□ 1.133e-8■□□□□ 8.2
ACTB-211ENST00000480301 A0A1W2PQH9 124 aa22.07■■□□□ 1.12
ACTB-211ENST00000480301 FAM170BA6NMN3 283 aa22.07■■□□□ 1.12
ACTB-211ENST00000480301 DCNP07585 359 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
ACTB-211ENST00000480301 KRT5P13647 590 aa22.07■■□□□ 1.12
ACTB-211ENST00000480301 TARSP26639 723 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
ACTB-211ENST00000480301 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
ACTB-211ENST00000480301 MYL5Q02045 173 aa22.07■■□□□ 1.12
ACTB-211ENST00000480301 UBXN2BQ14CS0 331 aa22.07■■□□□ 1.12
ACTB-211ENST00000480301 NCAPHQ15003 741 aa22.07■■□□□ 1.12
ACTB-211ENST00000480301 KRT31Q15323 416 aa22.07■■□□□ 1.12
ACTB-211ENST00000480301 STILQ15468 1287 aa22.07■■□□□ 1.12
ACTB-211ENST00000480301 ARHGAP44Q17R89 818 aa22.07■■□□□ 1.12
ACTB-211ENST00000480301 KLHL40Q2TBA0 621 aa22.07■■□□□ 1.12
ACTB-211ENST00000480301 SCD5Q86SK9 330 aa22.07■■□□□ 1.12
ACTB-211ENST00000480301 CCDC105Q8IYK2 499 aa22.07■■□□□ 1.12
ACTB-211ENST00000480301 PRSS33Q8NF86 280 aa22.07■■□□□ 1.12
ACTB-211ENST00000480301 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
ACTB-211ENST00000480301 NELL2Q99435 816 aa22.07■■□□□ 1.12
ACTB-211ENST00000480301 EBF3Q9H4W6 596 aa22.07■■□□□ 1.12
ACTB-211ENST00000480301 CYLDQ9NQC7 956 aa22.07■■□□□ 1.12
ACTB-211ENST00000480301 TAB2Q9NYJ8 693 aa22.07■■□□□ 1.12
ACTB-211ENST00000480301 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
ACTB-211ENST00000480301 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
ACTB-211ENST00000480301 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa22.07■■□□□ 1.12
ACTB-211ENST00000480301 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
ACTB-211ENST00000480301 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
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