RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479976.5

CHTF18-209, Transcript of chromosome transmission fidelity factor 18, humanhuman

TSL 2

Gene CHTF18, Length 1,110 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF18-209ENST00000479976 C12orf29Q8N999 325 aa30.15■■■□□ 2.42
CHTF18-209ENST00000479976 TAS1R2Q8TE23 839 aa30.15■■■□□ 2.42
CHTF18-209ENST00000479976 SMOQ99835 787 aa30.15■■■□□ 2.42
CHTF18-209ENST00000479976 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa30.15■■■□□ 2.42
CHTF18-209ENST00000479976 CFAP97Q9P2B7 532 aa30.15■■■□□ 2.42
CHTF18-209ENST00000479976 FAM92AA1XBS5 289 aa30.14■■■□□ 2.42
CHTF18-209ENST00000479976 RETP07949 1114 aa30.14■■■□□ 2.42
CHTF18-209ENST00000479976 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP30.14■■■□□ 2.42
CHTF18-209ENST00000479976 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP30.14■■■□□ 2.42
CHTF18-209ENST00000479976 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP30.14■■■□□ 2.42
CHTF18-209ENST00000479976 EDRF1Q3B7T1 1238 aa30.14■■■□□ 2.42
CHTF18-209ENST00000479976 HECTD3Q5T447 861 aa30.14■■■□□ 2.42
CHTF18-209ENST00000479976 CAMKK1Q8N5S9 505 aa30.14■■■□□ 2.42
CHTF18-209ENST00000479976 ZMIZ2Q8NF64 920 aa30.14■■■□□ 2.42
CHTF18-209ENST00000479976 CYP3A43Q9HB55 503 aa30.14■■■□□ 2.42
CHTF18-209ENST00000479976 DLL3Q9NYJ7 618 aa30.14■■■□□ 2.42
CHTF18-209ENST00000479976 COCHO43405 550 aa30.13■■■□□ 2.41
CHTF18-209ENST00000479976 BEST1O76090 585 aa30.13■■■□□ 2.41
CHTF18-209ENST00000479976 PXNP49023 591 aaPredicted RBP30.13■■■□□ 2.41
CHTF18-209ENST00000479976 INCA1Q0VD86 236 aa30.13■■■□□ 2.41
CHTF18-209ENST00000479976 PNOCQ13519 176 aa30.13■■■□□ 2.41
CHTF18-209ENST00000479976 CEP68Q76N32 757 aa30.13■■■□□ 2.41
CHTF18-209ENST00000479976 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP30.13■■■□□ 2.41
CHTF18-209ENST00000479976 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP30.13■■■□□ 2.41
CHTF18-209ENST00000479976 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa30.13■■■□□ 2.41
CHTF18-209ENST00000479976 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP30.13■■■□□ 2.41
CHTF18-209ENST00000479976 TMEM8AQ9HCN3 771 aa30.13■■■□□ 2.41
CHTF18-209ENST00000479976 PARD6AQ9NPB6 346 aa30.13■■■□□ 2.41
CHTF18-209ENST00000479976 FAM49BQ9NUQ9 324 aa30.13■■■□□ 2.41
CHTF18-209ENST00000479976 USP18Q9UMW8 372 aa30.13■■■□□ 2.41
CHTF18-209ENST00000479976 MYH10P35580 1976 aa30.12■■■□□ 2.41
CHTF18-209ENST00000479976 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa30.12■■■□□ 2.41
CHTF18-209ENST00000479976 CYP17A1P05093 508 aa30.12■■■□□ 2.41
CHTF18-209ENST00000479976 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa30.12■■■□□ 2.41
CHTF18-209ENST00000479976 GTF2H1P32780 548 aa30.12■■■□□ 2.41
CHTF18-209ENST00000479976 OPRD1P41143 372 aa30.12■■■□□ 2.41
CHTF18-209ENST00000479976 MAP3K7CLP57077 242 aa30.12■■■□□ 2.41
CHTF18-209ENST00000479976 SPEM2Q0P670 501 aa30.12■■■□□ 2.41
CHTF18-209ENST00000479976 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP30.12■■■□□ 2.41
CHTF18-209ENST00000479976 SYT13Q7L8C5 426 aa30.12■■■□□ 2.41
CHTF18-209ENST00000479976 CCDC150Q8NCX0 1101 aa30.12■■■□□ 2.41
CHTF18-209ENST00000479976 CCDC26Q8TAB7 109 aa30.12■■■□□ 2.41
CHTF18-209ENST00000479976 MMRN2Q9H8L6 949 aa30.12■■■□□ 2.41
CHTF18-209ENST00000479976 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP30.12■■■□□ 2.41
CHTF18-209ENST00000479976 TUBP50607 506 aa30.11■■■□□ 2.41
CHTF18-209ENST00000479976 LMNB2Q03252 620 aa30.11■■■□□ 2.41
CHTF18-209ENST00000479976 DHCR24Q15392 516 aa30.11■■■□□ 2.41
CHTF18-209ENST00000479976 GAB4Q2WGN9 574 aa30.11■■■□□ 2.41
CHTF18-209ENST00000479976 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP30.11■■■□□ 2.41
CHTF18-209ENST00000479976 TWNKQ96RR1 684 aa30.11■■■□□ 2.41
CHTF18-209ENST00000479976 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP30.11■■■□□ 2.41
CHTF18-209ENST00000479976 NT5C1AQ9BXI3 368 aa30.11■■■□□ 2.41
CHTF18-209ENST00000479976 NIF3L1Q9GZT8 377 aa30.11■■■□□ 2.41
CHTF18-209ENST00000479976 FBXO44Q9H4M3 255 aa30.11■■■□□ 2.41
CHTF18-209ENST00000479976 CCSER2Q9H7U1 834 aa30.11■■■□□ 2.41
CHTF18-209ENST00000479976 RMND1Q9NWS8 449 aa30.11■■■□□ 2.41
CHTF18-209ENST00000479976 GMIPQ9P107 970 aa30.11■■■□□ 2.41
CHTF18-209ENST00000479976 TBC1D14Q9P2M4 693 aa30.11■■■□□ 2.41
CHTF18-209ENST00000479976 E2F8A0AVK6 867 aa30.1■■■□□ 2.41
CHTF18-209ENST00000479976 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa30.1■■■□□ 2.41
CHTF18-209ENST00000479976 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP30.1■■■□□ 2.41
CHTF18-209ENST00000479976 LRP3O75074 770 aa30.1■■■□□ 2.41
CHTF18-209ENST00000479976 FAM200BP0CF97 657 aa30.1■■■□□ 2.41
CHTF18-209ENST00000479976 NUCB2P80303 420 aa30.1■■■□□ 2.41
CHTF18-209ENST00000479976 ARHGAP8P85298 464 aa30.1■■■□□ 2.41
CHTF18-209ENST00000479976 KRT39Q6A163 491 aa30.1■■■□□ 2.41
CHTF18-209ENST00000479976 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa30.1■■■□□ 2.41
CHTF18-209ENST00000479976 GAB3Q8WWW8 586 aa30.1■■■□□ 2.41
CHTF18-209ENST00000479976 CYFIP2Q96F07 1278 aa30.1■■■□□ 2.41
CHTF18-209ENST00000479976 EEF2KMTQ96G04 330 aa30.1■■■□□ 2.41
CHTF18-209ENST00000479976 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP30.1■■■□□ 2.41
CHTF18-209ENST00000479976 CACNA1AO00555 2505 aa30.1■■■□□ 2.41
CHTF18-209ENST00000479976 CETN3O15182 167 aa30.09■■■□□ 2.41
CHTF18-209ENST00000479976 SDHBP21912 280 aa30.09■■■□□ 2.41
CHTF18-209ENST00000479976 ADORA2BP29275 332 aa30.09■■■□□ 2.41
CHTF18-209ENST00000479976 PRCPP42785 496 aa30.09■■■□□ 2.41
CHTF18-209ENST00000479976 RHBDF2Q6PJF5 856 aa30.09■■■□□ 2.41
CHTF18-209ENST00000479976 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP30.09■■■□□ 2.41
CHTF18-209ENST00000479976 ACDQ96AP0 544 aa30.09■■■□□ 2.41
CHTF18-209ENST00000479976 GSDMAQ96QA5 445 aa30.09■■■□□ 2.41
CHTF18-209ENST00000479976 K7EQS6 105 aa30.08■■■□□ 2.41
CHTF18-209ENST00000479976 CILPO75339 1184 aa30.08■■■□□ 2.41
CHTF18-209ENST00000479976 RPP40O75818 363 aaKnown RBP30.08■■■□□ 2.41
CHTF18-209ENST00000479976 CD58P19256 250 aa30.08■■■□□ 2.41
CHTF18-209ENST00000479976 ENGASEQ8NFI3 743 aa30.08■■■□□ 2.41
CHTF18-209ENST00000479976 WHAMMQ8TF30 809 aa30.08■■■□□ 2.41
CHTF18-209ENST00000479976 HHIPQ96QV1 700 aa30.08■■■□□ 2.41
CHTF18-209ENST00000479976 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP30.08■■■□□ 2.41
CHTF18-209ENST00000479976 MYO16Q9Y6X6 1858 aa30.08■■■□□ 2.41
CHTF18-209ENST00000479976 ADH1CP00326 375 aa30.07■■■□□ 2.4
CHTF18-209ENST00000479976 EPB41P11171 864 aaKnown RBP30.07■■■□□ 2.4
CHTF18-209ENST00000479976 PGFP49763 221 aa30.07■■■□□ 2.4
CHTF18-209ENST00000479976 DMC1Q14565 340 aa30.07■■■□□ 2.4
CHTF18-209ENST00000479976 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP30.07■■■□□ 2.4
CHTF18-209ENST00000479976 CLEC20AQ6ZU45 233 aa30.07■■■□□ 2.4
CHTF18-209ENST00000479976 OTUB2Q96DC9 234 aa30.07■■■□□ 2.4
CHTF18-209ENST00000479976 DNAI2Q9GZS0 605 aa30.07■■■□□ 2.4
CHTF18-209ENST00000479976 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa30.07■■■□□ 2.4
CHTF18-209ENST00000479976 HHLA1C9JL84 531 aa30.06■■■□□ 2.4
CHTF18-209ENST00000479976 STX10O60499 249 aa30.06■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.2 ms