RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475335.5

SIKE1-208, Transcript of suppressor of IKBKE 1, humanhuman

TSL 2

Gene SIKE1, Length 470 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIKE1-208ENST00000475335 NELL2Q99435 816 aa22.21■■□□□ 1.15
SIKE1-208ENST00000475335 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
SIKE1-208ENST00000475335 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
SIKE1-208ENST00000475335 SCML2Q9UQR0 700 aa22.21■■□□□ 1.15
SIKE1-208ENST00000475335 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
SIKE1-208ENST00000475335 LEFTY2O00292 366 aa22.2■■□□□ 1.14
SIKE1-208ENST00000475335 CYP26A1O43174 497 aa22.2■■□□□ 1.14
SIKE1-208ENST00000475335 COCHO43405 550 aa22.2■■□□□ 1.14
SIKE1-208ENST00000475335 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
SIKE1-208ENST00000475335 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
SIKE1-208ENST00000475335 KIF11P52732 1056 aa22.2■■□□□ 1.14
SIKE1-208ENST00000475335 ZNF132P52740 706 aa22.2■■□□□ 1.14
SIKE1-208ENST00000475335 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
SIKE1-208ENST00000475335 GCNT1Q02742 428 aa22.2■■□□□ 1.14
SIKE1-208ENST00000475335 PDGFRLQ15198 375 aa22.2■■□□□ 1.14
SIKE1-208ENST00000475335 ANGPT1Q15389 498 aa22.2■■□□□ 1.14
SIKE1-208ENST00000475335 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
SIKE1-208ENST00000475335 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
SIKE1-208ENST00000475335 PPM1KQ8N3J5 372 aa22.2■■□□□ 1.14
SIKE1-208ENST00000475335 OSCP1Q8WVF1 389 aa22.2■■□□□ 1.14
SIKE1-208ENST00000475335 JAKMIP2Q96AA8 810 aa22.2■■□□□ 1.14
SIKE1-208ENST00000475335 KREMEN1Q96MU8 473 aa22.2■■□□□ 1.14
SIKE1-208ENST00000475335 PHOX2BQ99453 314 aa22.2■■□□□ 1.14
SIKE1-208ENST00000475335 FBXO44Q9H4M3 255 aa22.2■■□□□ 1.14
SIKE1-208ENST00000475335 EBF3Q9H4W6 596 aa22.2■■□□□ 1.14
SIKE1-208ENST00000475335 CCSER2Q9H7U1 834 aa22.2■■□□□ 1.14
SIKE1-208ENST00000475335 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
SIKE1-208ENST00000475335 CPQQ9Y646 472 aa22.2■■□□□ 1.14
SIKE1-208ENST00000475335 WNT6Q9Y6F9 365 aa22.2■■□□□ 1.14
SIKE1-208ENST00000475335 USP3Q9Y6I4 520 aa22.2■■□□□ 1.14
SIKE1-208ENST00000475335 MAGEA9P43362 315 aa22.19■■□□□ 1.14
SIKE1-208ENST00000475335 CETN1Q12798 172 aa22.19■■□□□ 1.14
SIKE1-208ENST00000475335 RUNX3Q13761 415 aa22.19■■□□□ 1.14
SIKE1-208ENST00000475335 EML3Q32P44 896 aa22.19■■□□□ 1.14
SIKE1-208ENST00000475335 ANKRD52Q8NB46 1076 aa22.19■■□□□ 1.14
SIKE1-208ENST00000475335 ZSWIM1Q9BR11 485 aa22.19■■□□□ 1.14
SIKE1-208ENST00000475335 DNAI2Q9GZS0 605 aa22.19■■□□□ 1.14
SIKE1-208ENST00000475335 THAP9Q9H5L6 903 aa22.19■■□□□ 1.14
SIKE1-208ENST00000475335 NMUR1Q9HB89 426 aa22.19■■□□□ 1.14
SIKE1-208ENST00000475335 FAM86C1Q9NVL1 165 aa22.19■■□□□ 1.14
SIKE1-208ENST00000475335 OSER1Q9NX31 292 aa22.19■■□□□ 1.14
SIKE1-208ENST00000475335 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
SIKE1-208ENST00000475335 O00370 1275 aa22.18■■□□□ 1.14
SIKE1-208ENST00000475335 ABL1P00519 1130 aa22.18■■□□□ 1.14
SIKE1-208ENST00000475335 CHRNB1P11230 501 aa22.18■■□□□ 1.14
SIKE1-208ENST00000475335 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa22.18■■□□□ 1.14
SIKE1-208ENST00000475335 RAB41Q5JT25 222 aa22.18■■□□□ 1.14
SIKE1-208ENST00000475335 HECTD3Q5T447 861 aa22.18■■□□□ 1.14
SIKE1-208ENST00000475335 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
SIKE1-208ENST00000475335 C1orf228Q6PIY5 440 aa22.18■■□□□ 1.14
SIKE1-208ENST00000475335 RRAGAQ7L523 313 aa22.18■■□□□ 1.14
SIKE1-208ENST00000475335 C1orf210Q8IVY1 113 aa22.18■■□□□ 1.14
SIKE1-208ENST00000475335 KIAA1958Q8N8K9 716 aa22.18■■□□□ 1.14
SIKE1-208ENST00000475335 TFAP2BQ92481 460 aa22.18■■□□□ 1.14
SIKE1-208ENST00000475335 UBXN6Q9BZV1 441 aa22.18■■□□□ 1.14
SIKE1-208ENST00000475335 CHRDQ9H2X0 955 aa22.18■■□□□ 1.14
SIKE1-208ENST00000475335 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
SIKE1-208ENST00000475335 SMPD4Q9NXE4 827 aa22.18■■□□□ 1.14
SIKE1-208ENST00000475335 TSPAN16Q9UKR8 245 aa22.18■■□□□ 1.14
SIKE1-208ENST00000475335 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
SIKE1-208ENST00000475335 TULP2O00295 520 aa22.17■■□□□ 1.14
SIKE1-208ENST00000475335 PAEPP09466 180 aa22.17■■□□□ 1.14
SIKE1-208ENST00000475335 PKDCCQ504Y2 493 aa22.17■■□□□ 1.14
SIKE1-208ENST00000475335 SGO2Q562F6 1265 aa22.17■■□□□ 1.14
SIKE1-208ENST00000475335 TMEM270Q6UE05 265 aa22.17■■□□□ 1.14
SIKE1-208ENST00000475335 CCDC186Q7Z3E2 898 aa22.17■■□□□ 1.14
SIKE1-208ENST00000475335 SCD5Q86SK9 330 aa22.17■■□□□ 1.14
SIKE1-208ENST00000475335 PIGZQ86VD9 579 aa22.17■■□□□ 1.14
SIKE1-208ENST00000475335 CYLDQ9NQC7 956 aa22.17■■□□□ 1.14
SIKE1-208ENST00000475335 CNTN6Q9UQ52 1028 aa22.17■■□□□ 1.14
SIKE1-208ENST00000475335 MYO16Q9Y6X6 1858 aa22.16■■□□□ 1.14
SIKE1-208ENST00000475335 TLR5O60602 858 aa22.16■■□□□ 1.14
SIKE1-208ENST00000475335 VDRP11473 427 aa22.16■■□□□ 1.14
SIKE1-208ENST00000475335 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
SIKE1-208ENST00000475335 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
SIKE1-208ENST00000475335 TRIM65Q6PJ69 517 aa22.16■■□□□ 1.14
SIKE1-208ENST00000475335 CRACR2AQ9BSW2 395 aa22.16■■□□□ 1.14
SIKE1-208ENST00000475335 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa22.16■■□□□ 1.14
SIKE1-208ENST00000475335 LINC00597Q9H2U6 94 aa22.16■■□□□ 1.14
SIKE1-208ENST00000475335 ECT2Q9H8V3 914 aa22.16■■□□□ 1.14
SIKE1-208ENST00000475335 CFAP97Q9P2B7 532 aa22.16■■□□□ 1.14
SIKE1-208ENST00000475335 DACH1Q9UI36 760 aa22.16■■□□□ 1.14
SIKE1-208ENST00000475335 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa22.16■■□□□ 1.14
SIKE1-208ENST00000475335 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa22.15■■□□□ 1.14
SIKE1-208ENST00000475335 FRYLO94915 3013 aa22.15■■□□□ 1.14
SIKE1-208ENST00000475335 A0A1W2PQH9 124 aa22.15■■□□□ 1.14
SIKE1-208ENST00000475335 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
SIKE1-208ENST00000475335 GOLGA6L22H0YM25 854 aa22.15■■□□□ 1.14
SIKE1-208ENST00000475335 NCAM2O15394 837 aa22.15■■□□□ 1.14
SIKE1-208ENST00000475335 CALCAP01258 141 aa22.15■■□□□ 1.14
SIKE1-208ENST00000475335 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
SIKE1-208ENST00000475335 CD19P15391 556 aa22.15■■□□□ 1.14
SIKE1-208ENST00000475335 IFNAR2P48551 515 aa22.15■■□□□ 1.14
SIKE1-208ENST00000475335 BCAT1P54687 386 aa22.15■■□□□ 1.14
SIKE1-208ENST00000475335 APBA1Q02410 837 aa22.15■■□□□ 1.14
SIKE1-208ENST00000475335 PDE4CQ08493 712 aa22.15■■□□□ 1.14
SIKE1-208ENST00000475335 CCINQ13939 588 aa22.15■■□□□ 1.14
SIKE1-208ENST00000475335 GAS6Q14393 721 aa22.15■■□□□ 1.14
SIKE1-208ENST00000475335 PON2Q15165 354 aa22.15■■□□□ 1.14
SIKE1-208ENST00000475335 GAB4Q2WGN9 574 aa22.15■■□□□ 1.14
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