RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463533.1

ANKRD28-208, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 3

Gene ANKRD28, Length 742 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-208ENST00000463533 CNGA2Q16280 664 aa8.91□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 ASIC2Q16515 512 aa8.91□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 DDR2Q16832 855 aa8.91□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa8.91□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 MGAT5BQ3V5L5 792 aa8.91□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 SFMBT2Q5VUG0 894 aa8.91□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 TAF3Q5VWG9 929 aa8.91□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 ARHGAP17Q68EM7 881 aa8.91□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa8.91□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 TCEAL8Q8IYN2 117 aa8.91□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 SPC24Q8NBT2 197 aa8.91□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 STKLD1Q8NE28 680 aa8.91□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 SLC7A14Q8TBB6 771 aa8.91□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 SPPL2BQ8TCT7 592 aa8.91□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 GPR152Q8TDT2 470 aa8.91□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 GIPC2Q8TF65 315 aa8.91□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF606Q8WXB4 792 aa8.91□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 CASP10Q92851 521 aa8.91□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 SMOQ99835 787 aa8.91□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 TMEM30AQ9NV96 361 aa8.91□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 CLDND1Q9NY35 253 aa8.91□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 TSPAN16Q9UKR8 245 aa8.91□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 KIAA1257Q9ULG3 409 aa8.91□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 YIPF1Q9Y548 306 aa8.91□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 INSL5Q9Y5Q6 135 aa8.91□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 MYO16Q9Y6X6 1858 aa8.91□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 PATJQ8NI35 1801 aa8.91□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 NOTCH4Q99466 2003 aa8.9□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 DENND4CQ5VZ89 1909 aa8.9□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 ATP8B3O60423 1300 aa8.9□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 O00370 1275 aa8.9□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 CCL16O15467 120 aa8.9□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 RFPL2O75678 378 aa8.9□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 MICAL2O94851 1124 aa8.9□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 TPM1P09493 284 aa8.9□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 FAM200BP0CF97 657 aa8.9□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 SKILP12757 684 aa8.9□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 CYP11B1P15538 503 aa8.9□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 FERP16591 822 aa8.9□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 CHRNB2P17787 502 aa8.9□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 CDC25BP30305 580 aa8.9□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 KRT9P35527 623 aa8.9□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 MAGEA11P43364 429 aa8.9□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 TUFMP49411 452 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 MAP3K7CLP57077 242 aa8.9□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 BPIFB4P59827 614 aa8.9□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 TWF1Q12792 350 aa8.9□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 TRIM14Q14142 442 aa8.9□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 CFAP221Q4G0U5 840 aa8.9□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 OXLD1Q5BKU9 147 aa8.9□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 PPM1LQ5SGD2 360 aa8.9□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 LIN9Q5TKA1 542 aa8.9□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 ANKRD54Q6NXT1 300 aa8.9□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 DENND1BQ6P3S1 775 aa8.9□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 LCLAT1Q6UWP7 414 aa8.9□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 CCDC149Q6ZUS6 474 aa8.9□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa8.9□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 PASD1Q8IV76 773 aa8.9□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 ZMIZ2Q8NF64 920 aa8.9□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 SLC20A1Q8WUM9 679 aa8.9□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 IQCDQ96DY2 449 aa8.9□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 SMARCD1Q96GM5 515 aa8.9□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP8.9□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 KCNK16Q96T55 309 aa8.9□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 DUSP16Q9BY84 665 aa8.9□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa8.9□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 ALG2Q9H553 416 aa8.9□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 ABCB6Q9NP58 842 aa8.9□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 KRT82Q9NSB4 513 aa8.9□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 AIPL1Q9NZN9 384 aa8.9□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 CLEC1BQ9P126 229 aa8.9□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 HESX1Q9UBX0 185 aa8.9□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 MAFFQ9ULX9 164 aa8.9□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 MYO6Q9UM54 1294 aa8.9□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP8.9□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa8.89□□□□□ -0.99
ANKRD28-208ENST00000463533 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
ANKRD28-208ENST00000463533 F8VP50 259 aa8.89□□□□□ -0.99
ANKRD28-208ENST00000463533 M0QYV0 167 aa8.89□□□□□ -0.99
ANKRD28-208ENST00000463533 TULP2O00295 520 aa8.89□□□□□ -0.99
ANKRD28-208ENST00000463533 MED7O43513 233 aa8.89□□□□□ -0.99
ANKRD28-208ENST00000463533 NCK2O43639 380 aa8.89□□□□□ -0.99
ANKRD28-208ENST00000463533 TBX10O75333 385 aa8.89□□□□□ -0.99
ANKRD28-208ENST00000463533 C1RP00736 705 aa8.89□□□□□ -0.99
ANKRD28-208ENST00000463533 LRG1P02750 347 aa8.89□□□□□ -0.99
ANKRD28-208ENST00000463533 MMEP08473 750 aa8.89□□□□□ -0.99
ANKRD28-208ENST00000463533 NPR3P17342 541 aa8.89□□□□□ -0.99
ANKRD28-208ENST00000463533 ATF6P18850 670 aa8.89□□□□□ -0.99
ANKRD28-208ENST00000463533 ANXA13P27216 316 aa8.89□□□□□ -0.99
ANKRD28-208ENST00000463533 LTBRP36941 435 aa8.89□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.9 ms