RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462322.2

SMKR1-201, Transcript of small lysine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMKR1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMKR1-201ENST00000462322 CPQQ9Y646 472 aa25.34■■□□□ 1.65
SMKR1-201ENST00000462322 WNT6Q9Y6F9 365 aa25.34■■□□□ 1.65
SMKR1-201ENST00000462322 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa25.34■■□□□ 1.65
SMKR1-201ENST00000462322 LEFTY2O00292 366 aa25.33■■□□□ 1.65
SMKR1-201ENST00000462322 AFPP02771 609 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
SMKR1-201ENST00000462322 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
SMKR1-201ENST00000462322 HECTD3Q5T447 861 aa25.33■■□□□ 1.65
SMKR1-201ENST00000462322 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa25.33■■□□□ 1.65
SMKR1-201ENST00000462322 CREBRFQ8IUR6 639 aa25.33■■□□□ 1.65
SMKR1-201ENST00000462322 PNPLA8Q9NP80 782 aa25.33■■□□□ 1.65
SMKR1-201ENST00000462322 HHLA1C9JL84 531 aa25.32■■□□□ 1.64
SMKR1-201ENST00000462322 LAMTOR5O43504 91 aa25.32■■□□□ 1.64
SMKR1-201ENST00000462322 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa25.32■■□□□ 1.64
SMKR1-201ENST00000462322 ACO1P21399 889 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
SMKR1-201ENST00000462322 ZXDBP98169 803 aa25.32■■□□□ 1.64
SMKR1-201ENST00000462322 PON2Q15165 354 aa25.32■■□□□ 1.64
SMKR1-201ENST00000462322 SNX30Q5VWJ9 437 aa25.32■■□□□ 1.64
SMKR1-201ENST00000462322 ARHGAP17Q68EM7 881 aa25.32■■□□□ 1.64
SMKR1-201ENST00000462322 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
SMKR1-201ENST00000462322 CPA6Q8N4T0 437 aa25.32■■□□□ 1.64
SMKR1-201ENST00000462322 MED15Q96RN5 788 aa25.32■■□□□ 1.64
SMKR1-201ENST00000462322 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
SMKR1-201ENST00000462322 COCHO43405 550 aa25.31■■□□□ 1.64
SMKR1-201ENST00000462322 CHRNB1P11230 501 aa25.31■■□□□ 1.64
SMKR1-201ENST00000462322 PPM1KQ8N3J5 372 aa25.31■■□□□ 1.64
SMKR1-201ENST00000462322 EHBP1Q8NDI1 1231 aa25.31■■□□□ 1.64
SMKR1-201ENST00000462322 LMO3Q8TAP4 145 aa25.31■■□□□ 1.64
SMKR1-201ENST00000462322 ATP2A3Q93084 1043 aa25.31■■□□□ 1.64
SMKR1-201ENST00000462322 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
SMKR1-201ENST00000462322 CHRDQ9H2X0 955 aa25.31■■□□□ 1.64
SMKR1-201ENST00000462322 CCSER2Q9H7U1 834 aa25.31■■□□□ 1.64
SMKR1-201ENST00000462322 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
SMKR1-201ENST00000462322 SCML2Q9UQR0 700 aa25.31■■□□□ 1.64
SMKR1-201ENST00000462322 HELZP42694 1942 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
SMKR1-201ENST00000462322 CD19P15391 556 aa25.3■■□□□ 1.64
SMKR1-201ENST00000462322 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
SMKR1-201ENST00000462322 MRE11P49959 708 aa25.3■■□□□ 1.64
SMKR1-201ENST00000462322 TUBP50607 506 aa25.3■■□□□ 1.64
SMKR1-201ENST00000462322 AMPD2Q01433 879 aa25.3■■□□□ 1.64
SMKR1-201ENST00000462322 MTAPQ13126 283 aa25.3■■□□□ 1.64
SMKR1-201ENST00000462322 LRRC32Q14392 662 aa25.3■■□□□ 1.64
SMKR1-201ENST00000462322 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
SMKR1-201ENST00000462322 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP25.3■■□□□ 1.64
SMKR1-201ENST00000462322 UBR7Q8N806 425 aa25.3■■□□□ 1.64
SMKR1-201ENST00000462322 NACA2Q9H009 215 aa25.3■■□□□ 1.64
SMKR1-201ENST00000462322 LINC00597Q9H2U6 94 aa25.3■■□□□ 1.64
SMKR1-201ENST00000462322 ECT2Q9H8V3 914 aa25.3■■□□□ 1.64
SMKR1-201ENST00000462322 CFAP97Q9P2B7 532 aa25.3■■□□□ 1.64
SMKR1-201ENST00000462322 PATJQ8NI35 1801 aa25.29■■□□□ 1.64
SMKR1-201ENST00000462322 GOLGA6L22H0YM25 854 aa25.29■■□□□ 1.64
SMKR1-201ENST00000462322 CYP26A1O43174 497 aa25.29■■□□□ 1.64
SMKR1-201ENST00000462322 PGFP49763 221 aa25.29■■□□□ 1.64
SMKR1-201ENST00000462322 KIF11P52732 1056 aa25.29■■□□□ 1.64
SMKR1-201ENST00000462322 SLC8A3P57103 927 aa25.29■■□□□ 1.64
SMKR1-201ENST00000462322 EML3Q32P44 896 aa25.29■■□□□ 1.64
SMKR1-201ENST00000462322 DPCR1Q3MIW9 517 aa25.29■■□□□ 1.64
SMKR1-201ENST00000462322 SGO2Q562F6 1265 aa25.29■■□□□ 1.64
SMKR1-201ENST00000462322 DGKKQ5KSL6 1271 aa25.29■■□□□ 1.64
SMKR1-201ENST00000462322 TMEM270Q6UE05 265 aa25.29■■□□□ 1.64
SMKR1-201ENST00000462322 ANKRD52Q8NB46 1076 aa25.29■■□□□ 1.64
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SMKR1-201ENST00000462322 TLR5O60602 858 aa25.28■■□□□ 1.64
SMKR1-201ENST00000462322 SP9P0CG40 484 aa25.28■■□□□ 1.64
SMKR1-201ENST00000462322 NBL1P41271 181 aa25.28■■□□□ 1.64
SMKR1-201ENST00000462322 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa25.28■■□□□ 1.64
SMKR1-201ENST00000462322 RRAGAQ7L523 313 aa25.28■■□□□ 1.64
SMKR1-201ENST00000462322 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
SMKR1-201ENST00000462322 KAT5Q92993 513 aa25.28■■□□□ 1.64
SMKR1-201ENST00000462322 IER2Q9BTL4 223 aa25.28■■□□□ 1.64
SMKR1-201ENST00000462322 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
SMKR1-201ENST00000462322 DACH1Q9UI36 760 aa25.28■■□□□ 1.64
SMKR1-201ENST00000462322 KIAA1257Q9ULG3 409 aa25.28■■□□□ 1.64
SMKR1-201ENST00000462322 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
SMKR1-201ENST00000462322 NFATC1O95644 943 aa25.27■■□□□ 1.64
SMKR1-201ENST00000462322 VDRP11473 427 aa25.27■■□□□ 1.64
SMKR1-201ENST00000462322 GJA4P35212 333 aa25.27■■□□□ 1.64
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SMKR1-201ENST00000462322 ARHGEF19Q8IW93 802 aa25.27■■□□□ 1.64
SMKR1-201ENST00000462322 KIAA1958Q8N8K9 716 aa25.27■■□□□ 1.64
SMKR1-201ENST00000462322 UBXN6Q9BZV1 441 aa25.27■■□□□ 1.64
SMKR1-201ENST00000462322 HESX1Q9UBX0 185 aa25.27■■□□□ 1.64
SMKR1-201ENST00000462322 TSPAN16Q9UKR8 245 aa25.27■■□□□ 1.64
SMKR1-201ENST00000462322 FBXO4Q9UKT5 387 aa25.27■■□□□ 1.64
SMKR1-201ENST00000462322 MYO16Q9Y6X6 1858 aa25.26■■□□□ 1.63
SMKR1-201ENST00000462322 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
SMKR1-201ENST00000462322 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
SMKR1-201ENST00000462322 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
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SMKR1-201ENST00000462322 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP25.26■■□□□ 1.63
SMKR1-201ENST00000462322 PIGZQ86VD9 579 aa25.26■■□□□ 1.63
SMKR1-201ENST00000462322 TTC30AQ86WT1 665 aa25.26■■□□□ 1.63
SMKR1-201ENST00000462322 IRF2BP1Q8IU81 584 aa25.26■■□□□ 1.63
SMKR1-201ENST00000462322 GPT2Q8TD30 523 aa25.26■■□□□ 1.63
SMKR1-201ENST00000462322 CHFRQ96EP1 664 aa25.26■■□□□ 1.63
SMKR1-201ENST00000462322 A0A1W2PQH9 124 aa25.25■■□□□ 1.63
SMKR1-201ENST00000462322 PROB1E7EW31 1015 aa25.25■■□□□ 1.63
SMKR1-201ENST00000462322 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
SMKR1-201ENST00000462322 PAEPP09466 180 aa25.25■■□□□ 1.63
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