RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000456943.6

GMDS-AS1-201, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene GMDS-AS1, Length 2,308 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ANAPC5Q9UJX4 755 aa18.2■□□□□ 0.5
GMDS-AS1-201ENST00000456943 DSEQ9UL01 958 aa18.2■□□□□ 0.5
GMDS-AS1-201ENST00000456943 KBTBD13C9JR72 458 aa18.2■□□□□ 0.5
GMDS-AS1-201ENST00000456943 H0YGN5 161 aa18.2■□□□□ 0.5
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ATP2C2O75185 946 aa18.2■□□□□ 0.5
GMDS-AS1-201ENST00000456943 GABBR2O75899 941 aa18.2■□□□□ 0.5
GMDS-AS1-201ENST00000456943 POMCP01189 267 aa18.2■□□□□ 0.5
GMDS-AS1-201ENST00000456943 RARGP13631 454 aa18.2■□□□□ 0.5
GMDS-AS1-201ENST00000456943 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
GMDS-AS1-201ENST00000456943 DYNLT1P63172 113 aa18.2■□□□□ 0.5
GMDS-AS1-201ENST00000456943 IFFO1Q0D2I5 559 aa18.2■□□□□ 0.5
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SCYL2Q6P3W7 929 aa18.2■□□□□ 0.5
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PIGZQ86VD9 579 aa18.2■□□□□ 0.5
GMDS-AS1-201ENST00000456943 VSIG1Q86XK7 387 aa18.2■□□□□ 0.5
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SLC43A3Q8NBI5 491 aa18.2■□□□□ 0.5
GMDS-AS1-201ENST00000456943 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP18.2■□□□□ 0.5
GMDS-AS1-201ENST00000456943 HAUS1Q96CS2 278 aa18.2■□□□□ 0.5
GMDS-AS1-201ENST00000456943 LRRC4Q9HBW1 653 aa18.2■□□□□ 0.5
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CACNG4Q9UBN1 327 aa18.2■□□□□ 0.5
GMDS-AS1-201ENST00000456943 NFS1Q9Y697 457 aa18.2■□□□□ 0.5
GMDS-AS1-201ENST00000456943 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
GMDS-AS1-201ENST00000456943 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa18.19■□□□□ 0.5
GMDS-AS1-201ENST00000456943 APOC2P02655 101 aa18.19■□□□□ 0.5
GMDS-AS1-201ENST00000456943 IVDP26440 423 aa18.19■□□□□ 0.5
GMDS-AS1-201ENST00000456943 KLRC2P26717 231 aa18.19■□□□□ 0.5
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ITGA8P53708 1063 aa18.19■□□□□ 0.5
GMDS-AS1-201ENST00000456943 OASLQ15646 514 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
GMDS-AS1-201ENST00000456943 TTMPQ5BVD1 217 aa18.19■□□□□ 0.5
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa18.19■□□□□ 0.5
GMDS-AS1-201ENST00000456943 C3orf58Q8NDZ4 430 aa18.19■□□□□ 0.5
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SLC35B2Q8TB61 432 aa18.19■□□□□ 0.5
GMDS-AS1-201ENST00000456943 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ARL8AQ96BM9 186 aa18.19■□□□□ 0.5
GMDS-AS1-201ENST00000456943 RGS18Q9NS28 235 aa18.19■□□□□ 0.5
GMDS-AS1-201ENST00000456943 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP18.19■□□□□ 0.52e-6■■■■□ 20.6
GMDS-AS1-201ENST00000456943 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa18.19■□□□□ 0.5
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa18.19■□□□□ 0.5
GMDS-AS1-201ENST00000456943 MDM4O15151 490 aa18.18■□□□□ 0.5
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ENDOD1O94919 500 aa18.18■□□□□ 0.5
GMDS-AS1-201ENST00000456943 NUDT17P0C025 328 aa18.18■□□□□ 0.5
GMDS-AS1-201ENST00000456943 RDXP35241 583 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
GMDS-AS1-201ENST00000456943 VPS41P49754 854 aa18.18■□□□□ 0.5
GMDS-AS1-201ENST00000456943 VEGFBP49765 207 aa18.18■□□□□ 0.5
GMDS-AS1-201ENST00000456943 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
GMDS-AS1-201ENST00000456943 IZUMO3Q5VZ72 239 aa18.18■□□□□ 0.5
GMDS-AS1-201ENST00000456943 RHBDF2Q6PJF5 856 aa18.18■□□□□ 0.5
GMDS-AS1-201ENST00000456943 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CROCCP2Q86T23 111 aa18.18■□□□□ 0.5
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa18.18■□□□□ 0.5
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ACTL9Q8TC94 416 aa18.18■□□□□ 0.5
GMDS-AS1-201ENST00000456943 FOXP3Q9BZS1 431 aa18.18■□□□□ 0.5
GMDS-AS1-201ENST00000456943 TRPV6Q9H1D0 765 aa18.18■□□□□ 0.5
GMDS-AS1-201ENST00000456943 TMBIM4Q9HC24 238 aa18.18■□□□□ 0.5
GMDS-AS1-201ENST00000456943 KRT82Q9NSB4 513 aa18.18■□□□□ 0.5
GMDS-AS1-201ENST00000456943 TSC2P49815 1807 aa18.18■□□□□ 0.5
GMDS-AS1-201ENST00000456943 INPPL1O15357 1258 aa18.18■□□□□ 0.5
GMDS-AS1-201ENST00000456943 B3GAT3O94766 335 aa18.18■□□□□ 0.5
GMDS-AS1-201ENST00000456943 EOMESO95936 686 aa18.18■□□□□ 0.5
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CD48P09326 243 aa18.18■□□□□ 0.5
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ZNF844Q08AG5 666 aa18.18■□□□□ 0.5
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ADIGQ0VDE8 80 aa18.18■□□□□ 0.5
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
GMDS-AS1-201ENST00000456943 HOOK3Q86VS8 718 aa18.18■□□□□ 0.5
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CLEC4CQ8WTT0 213 aa18.18■□□□□ 0.5
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa18.18■□□□□ 0.5
GMDS-AS1-201ENST00000456943 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PCDH9Q9HC56 1237 aa18.18■□□□□ 0.5
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CRTAC1Q9NQ79 661 aa18.18■□□□□ 0.5
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SGK1O00141 431 aa18.17■□□□□ 0.5
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ARVCFO00192 962 aa18.17■□□□□ 0.5
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CLDN5O00501 218 aa18.17■□□□□ 0.5
GMDS-AS1-201ENST00000456943 MCF2LO15068 1137 aa18.17■□□□□ 0.5
GMDS-AS1-201ENST00000456943 DAB1O75553 588 aa18.17■□□□□ 0.5
GMDS-AS1-201ENST00000456943 DPYSL3Q14195 570 aa18.17■□□□□ 0.5
GMDS-AS1-201ENST00000456943 TIGD5Q53EQ6 642 aa18.17■□□□□ 0.5
GMDS-AS1-201ENST00000456943 GLB1LQ6UWU2 654 aa18.17■□□□□ 0.5
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CLEC20AQ6ZU45 233 aa18.17■□□□□ 0.5
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CCDC25Q86WR0 208 aa18.17■□□□□ 0.5
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SAGE1Q9NXZ1 904 aa18.17■□□□□ 0.5
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PHF24Q9UPV7 400 aa18.17■□□□□ 0.5
GMDS-AS1-201ENST00000456943 FBXO21O94952 628 aa18.17■□□□□ 0.5
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ARSEP51690 589 aa18.17■□□□□ 0.5
GMDS-AS1-201ENST00000456943 P3H1Q32P28 736 aa18.17■□□□□ 0.5
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PAQR9Q6ZVX9 377 aa18.17■□□□□ 0.5
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SLC24A5Q71RS6 500 aa18.17■□□□□ 0.5
GMDS-AS1-201ENST00000456943 STRADAQ7RTN6 431 aa18.17■□□□□ 0.5
GMDS-AS1-201ENST00000456943 FAM35AQ86V20 835 aa18.17■□□□□ 0.5
GMDS-AS1-201ENST00000456943 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa18.17■□□□□ 0.5
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
GMDS-AS1-201ENST00000456943 FTHL17Q9BXU8 183 aa18.17■□□□□ 0.5
GMDS-AS1-201ENST00000456943 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ZNF487B1APH4 448 aa18.16■□□□□ 0.5
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CYP11A1P05108 521 aa18.16■□□□□ 0.5
GMDS-AS1-201ENST00000456943 MATKP42679 507 aa18.16■□□□□ 0.5
GMDS-AS1-201ENST00000456943 HDAC4P56524 1084 aa18.16■□□□□ 0.5
GMDS-AS1-201ENST00000456943 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
GMDS-AS1-201ENST00000456943 OR2W6PQ8NHA6 318 aa18.16■□□□□ 0.5
GMDS-AS1-201ENST00000456943 URGCPQ8TCY9 931 aa18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70.4 ms