RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438888.5

PRAME-208, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 4

Gene PRAME, Length 566 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-208ENST00000438888 FSTL4Q6MZW2 842 aa13.23□□□□□ -0.29
PRAME-208ENST00000438888 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP13.23□□□□□ -0.29
PRAME-208ENST00000438888 SV2AQ7L0J3 742 aa13.23□□□□□ -0.29
PRAME-208ENST00000438888 VSTM4Q8IW00 320 aa13.23□□□□□ -0.29
PRAME-208ENST00000438888 C1orf127Q8N9H9 656 aa13.23□□□□□ -0.29
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PRAME-208ENST00000438888 SLC30A4O14863 429 aa13.21□□□□□ -0.29
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PRAME-208ENST00000438888 TADA3O75528 432 aa13.21□□□□□ -0.29
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PRAME-208ENST00000438888 CHD8Q9HCK8 2581 aa13.2□□□□□ -0.3
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PRAME-208ENST00000438888 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP13.2□□□□□ -0.3
PRAME-208ENST00000438888 RAB20Q9NX57 234 aa13.2□□□□□ -0.3
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PRAME-208ENST00000438888 ITGA11Q9UKX5 1188 aa13.2□□□□□ -0.3
PRAME-208ENST00000438888 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP13.2□□□□□ -0.3
PRAME-208ENST00000438888 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP13.2□□□□□ -0.32e-53■□□□□ 8.1
PRAME-208ENST00000438888 WNT6Q9Y6F9 365 aa13.2□□□□□ -0.3
PRAME-208ENST00000438888 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP13.2□□□□□ -0.3
PRAME-208ENST00000438888 SDK1Q7Z5N4 2213 aa13.2□□□□□ -0.3
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