RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438547.6

SEMA4D-211, Transcript of semaphorin 4D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SEMA4D, Length 4,824 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4D-211ENST00000438547 PDPK2PQ6A1A2 396 aa11.56□□□□□ -0.56
SEMA4D-211ENST00000438547 STRA8Q7Z7C7 330 aa11.56□□□□□ -0.56
SEMA4D-211ENST00000438547 WDR49Q8IV35 697 aa11.56□□□□□ -0.56
SEMA4D-211ENST00000438547 EFHBQ8N7U6 833 aa11.56□□□□□ -0.56
SEMA4D-211ENST00000438547 SAR1AQ9NR31 198 aa11.56□□□□□ -0.56
SEMA4D-211ENST00000438547 ADGRA2Q96PE1 1338 aa11.56□□□□□ -0.56
SEMA4D-211ENST00000438547 SMIM22K7EJ46 135 aa11.56□□□□□ -0.56
SEMA4D-211ENST00000438547 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP11.56□□□□□ -0.56
SEMA4D-211ENST00000438547 FKBP9O95302 570 aa11.56□□□□□ -0.56
SEMA4D-211ENST00000438547 HMBSP08397 361 aa11.56□□□□□ -0.56
SEMA4D-211ENST00000438547 AVPR1AP37288 418 aa11.56□□□□□ -0.56
SEMA4D-211ENST00000438547 TMED10P49755 219 aaKnown RBP11.56□□□□□ -0.56
SEMA4D-211ENST00000438547 MTFR1Q15390 333 aa11.56□□□□□ -0.56
SEMA4D-211ENST00000438547 IL17AQ16552 155 aa11.56□□□□□ -0.56
SEMA4D-211ENST00000438547 ACCSLQ4AC99 568 aa11.56□□□□□ -0.56
SEMA4D-211ENST00000438547 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP11.56□□□□□ -0.56
SEMA4D-211ENST00000438547 AADACL2Q6P093 401 aa11.56□□□□□ -0.56
SEMA4D-211ENST00000438547 FKBP9P1Q75LS8 142 aa11.56□□□□□ -0.56
SEMA4D-211ENST00000438547 TAGAPQ8N103 731 aa11.56□□□□□ -0.56
SEMA4D-211ENST00000438547 ETNPPLQ8TBG4 499 aa11.56□□□□□ -0.56
SEMA4D-211ENST00000438547 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP11.56□□□□□ -0.56
SEMA4D-211ENST00000438547 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP11.56□□□□□ -0.56
SEMA4D-211ENST00000438547 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP11.56□□□□□ -0.56
SEMA4D-211ENST00000438547 PDCD2LQ9BRP1 358 aa11.56□□□□□ -0.56
SEMA4D-211ENST00000438547 FRMPD4Q14CM0 1322 aa11.56□□□□□ -0.56
SEMA4D-211ENST00000438547 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa11.56□□□□□ -0.56
SEMA4D-211ENST00000438547 STRNO43815 780 aa11.56□□□□□ -0.56
SEMA4D-211ENST00000438547 ADRA1DP25100 572 aa11.56□□□□□ -0.56
SEMA4D-211ENST00000438547 S100A5P33763 92 aa11.56□□□□□ -0.56
SEMA4D-211ENST00000438547 GPR141Q7Z602 305 aa11.56□□□□□ -0.56
SEMA4D-211ENST00000438547 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP11.56□□□□□ -0.56
SEMA4D-211ENST00000438547 PPP2R3CQ969Q6 453 aa11.56□□□□□ -0.56
SEMA4D-211ENST00000438547 FAM162AQ96A26 154 aa11.56□□□□□ -0.56
SEMA4D-211ENST00000438547 ELMO3Q96BJ8 720 aa11.56□□□□□ -0.56
SEMA4D-211ENST00000438547 TUBGCP3Q96CW5 907 aa11.56□□□□□ -0.56
SEMA4D-211ENST00000438547 VPS50Q96JG6 964 aa11.56□□□□□ -0.56
SEMA4D-211ENST00000438547 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa11.56□□□□□ -0.56
SEMA4D-211ENST00000438547 CHST12Q9NRB3 414 aa11.56□□□□□ -0.56
SEMA4D-211ENST00000438547 AP4S1Q9Y587 144 aa11.56□□□□□ -0.56
SEMA4D-211ENST00000438547 SLCO1B7G3V0H7 640 aa11.55□□□□□ -0.56
SEMA4D-211ENST00000438547 CYP2C9P11712 490 aa11.55□□□□□ -0.56
SEMA4D-211ENST00000438547 NNMTP40261 264 aa11.55□□□□□ -0.56
SEMA4D-211ENST00000438547 PNPLA4P41247 253 aa11.55□□□□□ -0.56
SEMA4D-211ENST00000438547 SOX10P56693 466 aa11.55□□□□□ -0.56
SEMA4D-211ENST00000438547 PPATQ06203 517 aa11.55□□□□□ -0.56
SEMA4D-211ENST00000438547 MGAT5Q09328 741 aa11.55□□□□□ -0.56
SEMA4D-211ENST00000438547 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
SEMA4D-211ENST00000438547 KRT72Q14CN4 511 aa11.55□□□□□ -0.56
SEMA4D-211ENST00000438547 C3orf67Q6ZVT6 689 aa11.55□□□□□ -0.56
SEMA4D-211ENST00000438547 MFN1Q8IWA4 741 aa11.55□□□□□ -0.56
SEMA4D-211ENST00000438547 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
SEMA4D-211ENST00000438547 CCDC126Q96EE4 140 aa11.55□□□□□ -0.56
SEMA4D-211ENST00000438547 APOPT1Q96IL0 206 aa11.55□□□□□ -0.56
SEMA4D-211ENST00000438547 DEFB129Q9H1M3 183 aa11.55□□□□□ -0.56
SEMA4D-211ENST00000438547 GANQ9H2C0 597 aa11.55□□□□□ -0.56
SEMA4D-211ENST00000438547 SLC38A7Q9NVC3 462 aa11.55□□□□□ -0.56
SEMA4D-211ENST00000438547 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa11.55□□□□□ -0.56
SEMA4D-211ENST00000438547 SEPT3Q9UH03 358 aa11.55□□□□□ -0.56
SEMA4D-211ENST00000438547 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
SEMA4D-211ENST00000438547 AP4E1Q9UPM8 1137 aa11.55□□□□□ -0.56
SEMA4D-211ENST00000438547 KIF20BQ96Q89 1820 aa11.55□□□□□ -0.56
SEMA4D-211ENST00000438547 SLC25A27O95847 323 aa11.55□□□□□ -0.56
SEMA4D-211ENST00000438547 IL1R1P14778 569 aa11.55□□□□□ -0.56
SEMA4D-211ENST00000438547 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP11.55□□□□□ -0.56
SEMA4D-211ENST00000438547 CLK1P49759 484 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
SEMA4D-211ENST00000438547 CASP5P51878 434 aa11.55□□□□□ -0.56
SEMA4D-211ENST00000438547 AMHR2Q16671 573 aa11.55□□□□□ -0.56
SEMA4D-211ENST00000438547 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP11.55□□□□□ -0.56
SEMA4D-211ENST00000438547 SLC44A4Q53GD3 710 aa11.55□□□□□ -0.56
SEMA4D-211ENST00000438547 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa11.55□□□□□ -0.56
SEMA4D-211ENST00000438547 RRM2BQ7LG56 351 aa11.55□□□□□ -0.56
SEMA4D-211ENST00000438547 FAM131BQ86XD5 332 aa11.55□□□□□ -0.56
SEMA4D-211ENST00000438547 UNC45BQ8IWX7 931 aa11.55□□□□□ -0.56
SEMA4D-211ENST00000438547 SAMD3Q8N6K7 520 aa11.55□□□□□ -0.56
SEMA4D-211ENST00000438547 C2orf69Q8N8R5 385 aa11.55□□□□□ -0.56
SEMA4D-211ENST00000438547 DNAJC19Q96DA6 116 aa11.55□□□□□ -0.56
SEMA4D-211ENST00000438547 TMEM176AQ96HP8 235 aa11.55□□□□□ -0.56
SEMA4D-211ENST00000438547 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP11.55□□□□□ -0.56
SEMA4D-211ENST00000438547 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
SEMA4D-211ENST00000438547 WDCPQ9H6R7 721 aa11.55□□□□□ -0.56
SEMA4D-211ENST00000438547 PALMDQ9NP74 551 aa11.55□□□□□ -0.56
SEMA4D-211ENST00000438547 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
SEMA4D-211ENST00000438547 SCN3BQ9NY72 215 aa11.55□□□□□ -0.56
SEMA4D-211ENST00000438547 TAS2R14Q9NYV8 317 aa11.55□□□□□ -0.56
SEMA4D-211ENST00000438547 ACOT9Q9Y305 439 aa11.55□□□□□ -0.56
SEMA4D-211ENST00000438547 PKP3Q9Y446 797 aa11.55□□□□□ -0.56
SEMA4D-211ENST00000438547 KBTBD13C9JR72 458 aa11.55□□□□□ -0.56
SEMA4D-211ENST00000438547 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
SEMA4D-211ENST00000438547 RHOBTB1O94844 696 aa11.55□□□□□ -0.56
SEMA4D-211ENST00000438547 DRG2P55039 364 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
SEMA4D-211ENST00000438547 PTK2BQ14289 1009 aa11.55□□□□□ -0.56
SEMA4D-211ENST00000438547 ARHGEF6Q15052 776 aa11.55□□□□□ -0.56
SEMA4D-211ENST00000438547 IL31Q6EBC2 164 aa11.55□□□□□ -0.56
SEMA4D-211ENST00000438547 NOTUMQ6P988 496 aa11.55□□□□□ -0.56
SEMA4D-211ENST00000438547 SLFN11Q7Z7L1 901 aa11.55□□□□□ -0.56
SEMA4D-211ENST00000438547 MICU2Q8IYU8 434 aa11.55□□□□□ -0.56
SEMA4D-211ENST00000438547 AGAP11Q8TF27 550 aa11.55□□□□□ -0.56
SEMA4D-211ENST00000438547 ECSITQ9BQ95 431 aa11.55□□□□□ -0.56
SEMA4D-211ENST00000438547 ARMCX1Q9P291 453 aa11.55□□□□□ -0.56
SEMA4D-211ENST00000438547 BTNL10A8MVZ5 291 aa11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.9 ms