RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437322.2

USP27X-AS1-201, Transcript of USP27X antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP27X-AS1, Length 2,175 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP27X-AS1-201ENST00000437322 BEGAINQ9BUH8 593 aa18.03■□□□□ 0.48
USP27X-AS1-201ENST00000437322 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
USP27X-AS1-201ENST00000437322 PHTF1Q9UMS5 762 aa18.03■□□□□ 0.48
USP27X-AS1-201ENST00000437322 MOXD2PA6NHM9 499 aa18.03■□□□□ 0.48
USP27X-AS1-201ENST00000437322 KRT19P08727 400 aa18.03■□□□□ 0.48
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ATP6V1C1P21283 382 aa18.03■□□□□ 0.48
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ALDH3A1P30838 453 aa18.03■□□□□ 0.48
USP27X-AS1-201ENST00000437322 RASSF2P50749 326 aa18.03■□□□□ 0.48
USP27X-AS1-201ENST00000437322 PTP4A2Q12974 167 aa18.03■□□□□ 0.48
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP18.03■□□□□ 0.48
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ZNF699Q32M78 642 aa18.03■□□□□ 0.48
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CCDC89Q8N998 374 aa18.03■□□□□ 0.48
USP27X-AS1-201ENST00000437322 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP18.03■□□□□ 0.48
USP27X-AS1-201ENST00000437322 HERPUD2Q9BSE4 406 aa18.03■□□□□ 0.48
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP18.03■□□□□ 0.48
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SIX4Q9UIU6 781 aa18.03■□□□□ 0.48
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CHRNA1P02708 482 aa18.02■□□□□ 0.48
USP27X-AS1-201ENST00000437322 T-ENOLP0DO92 83 aa18.02■□□□□ 0.48
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ACO1P21399 889 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.48
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SPARCL1Q14515 664 aa18.02■□□□□ 0.48
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CCNG2Q16589 344 aa18.02■□□□□ 0.48
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ANO7Q6IWH7 933 aa18.02■□□□□ 0.48
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP18.02■□□□□ 0.48
USP27X-AS1-201ENST00000437322 GLT1D1Q96MS3 346 aa18.02■□□□□ 0.48
USP27X-AS1-201ENST00000437322 PWWP2AQ96N64 755 aa18.02■□□□□ 0.48
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SH3GL3Q99963 347 aa18.02■□□□□ 0.48
USP27X-AS1-201ENST00000437322 FAM167BQ9BTA0 163 aa18.02■□□□□ 0.48
USP27X-AS1-201ENST00000437322 XYLT2Q9H1B5 865 aa18.02■□□□□ 0.48
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TLE6Q9H808 572 aa18.02■□□□□ 0.48
USP27X-AS1-201ENST00000437322 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.48
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.48
USP27X-AS1-201ENST00000437322 C2CD2Q9Y426 696 aa18.02■□□□□ 0.48
USP27X-AS1-201ENST00000437322 HGSO14964 777 aaPredicted RBP18.01■□□□□ 0.47
USP27X-AS1-201ENST00000437322 EDF1O60869 148 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ITGB3P05106 788 aa18.01■□□□□ 0.47
USP27X-AS1-201ENST00000437322 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
USP27X-AS1-201ENST00000437322 RRM1P23921 792 aa18.01■□□□□ 0.47
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TARSP26639 723 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
USP27X-AS1-201ENST00000437322 THPOP40225 353 aa18.01■□□□□ 0.47
USP27X-AS1-201ENST00000437322 RAD23BP54727 409 aa18.01■□□□□ 0.47
USP27X-AS1-201ENST00000437322 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
USP27X-AS1-201ENST00000437322 MGAT3Q09327 533 aa18.01■□□□□ 0.47
USP27X-AS1-201ENST00000437322 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP18.01■□□□□ 0.47
USP27X-AS1-201ENST00000437322 PDK4Q16654 411 aa18.01■□□□□ 0.47
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa18.01■□□□□ 0.47
USP27X-AS1-201ENST00000437322 UBXN11Q5T124 520 aa18.01■□□□□ 0.47
USP27X-AS1-201ENST00000437322 LMNTD2Q8IXW0 634 aa18.01■□□□□ 0.47
USP27X-AS1-201ENST00000437322 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SNX27Q96L92 541 aa18.01■□□□□ 0.47
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa18.01■□□□□ 0.47
USP27X-AS1-201ENST00000437322 NIF3L1Q9GZT8 377 aa18.01■□□□□ 0.47
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CXCL16Q9H2A7 254 aa18.01■□□□□ 0.47
USP27X-AS1-201ENST00000437322 HAO1Q9UJM8 370 aa18.01■□□□□ 0.47
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
USP27X-AS1-201ENST00000437322 NOD1Q9Y239 953 aa18.01■□□□□ 0.47
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP18.01■□□□□ 0.47
USP27X-AS1-201ENST00000437322 GM2AP17900 193 aa18.01■□□□□ 0.47
USP27X-AS1-201ENST00000437322 LLGL1Q15334 1064 aa18.01■□□□□ 0.47
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TMED2Q15363 201 aa18.01■□□□□ 0.47
USP27X-AS1-201ENST00000437322 IZUMO3Q5VZ72 239 aa18.01■□□□□ 0.47
USP27X-AS1-201ENST00000437322 LONP2Q86WA8 852 aa18.01■□□□□ 0.47
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
USP27X-AS1-201ENST00000437322 KIF12Q96FN5 646 aa18.01■□□□□ 0.47
USP27X-AS1-201ENST00000437322 C9orf72Q96LT7 481 aa18.01■□□□□ 0.47
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CFAP57Q96MR6 1250 aa18.01■□□□□ 0.47
USP27X-AS1-201ENST00000437322 APOL6Q9BWW8 343 aa18.01■□□□□ 0.47
USP27X-AS1-201ENST00000437322 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa18.01■□□□□ 0.47
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SENP1Q9P0U3 644 aa18.01■□□□□ 0.47
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ANAPC7Q9UJX3 599 aa18.01■□□□□ 0.47
USP27X-AS1-201ENST00000437322 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
USP27X-AS1-201ENST00000437322 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa18.01■□□□□ 0.47
USP27X-AS1-201ENST00000437322 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
USP27X-AS1-201ENST00000437322 RECQL4O94761 1208 aa18■□□□□ 0.47
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CALCAP01258 141 aa18■□□□□ 0.47
USP27X-AS1-201ENST00000437322 LMNAP02545 664 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
USP27X-AS1-201ENST00000437322 FESP07332 822 aa18■□□□□ 0.47
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ACADSP16219 412 aa18■□□□□ 0.47
USP27X-AS1-201ENST00000437322 GCAP28676 217 aa18■□□□□ 0.47
USP27X-AS1-201ENST00000437322 MAGEA4P43358 317 aa18■□□□□ 0.47
USP27X-AS1-201ENST00000437322 DNAJC3Q13217 504 aa18■□□□□ 0.47
USP27X-AS1-201ENST00000437322 LBRQ14739 615 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ZNF365Q70YC5 407 aa18■□□□□ 0.47
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa18■□□□□ 0.47
USP27X-AS1-201ENST00000437322 NT5DC4Q86YG4 428 aa18■□□□□ 0.47
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CXorf38Q8TB03 319 aa18■□□□□ 0.47
USP27X-AS1-201ENST00000437322 C10orf82Q8WW14 230 aa18■□□□□ 0.47
USP27X-AS1-201ENST00000437322 NUDCD1Q96RS6 583 aa18■□□□□ 0.47
USP27X-AS1-201ENST00000437322 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP18■□□□□ 0.47
USP27X-AS1-201ENST00000437322 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
USP27X-AS1-201ENST00000437322 AHCYL1O43865 530 aa18■□□□□ 0.47
USP27X-AS1-201ENST00000437322 AKAP5P24588 427 aa18■□□□□ 0.47
USP27X-AS1-201ENST00000437322 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP18■□□□□ 0.47
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TMEM270Q6UE05 265 aa18■□□□□ 0.47
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP18■□□□□ 0.47
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa18■□□□□ 0.47
USP27X-AS1-201ENST00000437322 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP17.99■□□□□ 0.47
USP27X-AS1-201ENST00000437322 A0A1W2PQY0 241 aa17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.7 ms