RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000431413.5

HERC3-206, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 761 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-206ENST00000431413 TMEM30AQ9NV96 361 aa16.07■□□□□ 0.16
HERC3-206ENST00000431413 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
HERC3-206ENST00000431413 CACNA1AO00555 2505 aa16.07■□□□□ 0.16
HERC3-206ENST00000431413 DMXL1Q9Y485 3027 aa16.06■□□□□ 0.16
HERC3-206ENST00000431413 E2F8A0AVK6 867 aa16.06■□□□□ 0.16
HERC3-206ENST00000431413 AXIN1O15169 862 aa16.06■□□□□ 0.16
HERC3-206ENST00000431413 ZNF202O95125 648 aa16.06■□□□□ 0.16
HERC3-206ENST00000431413 APBB3O95704 486 aa16.06■□□□□ 0.16
HERC3-206ENST00000431413 HLA-DRAP01903 254 aa16.06■□□□□ 0.16
HERC3-206ENST00000431413 ADAM9Q13443 819 aa16.06■□□□□ 0.16
HERC3-206ENST00000431413 DMC1Q14565 340 aa16.06■□□□□ 0.16
HERC3-206ENST00000431413 DHCR24Q15392 516 aa16.06■□□□□ 0.16
HERC3-206ENST00000431413 SNX30Q5VWJ9 437 aa16.06■□□□□ 0.16
HERC3-206ENST00000431413 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
HERC3-206ENST00000431413 PAQR9Q6ZVX9 377 aa16.06■□□□□ 0.16
HERC3-206ENST00000431413 FAM186BQ8IYM0 893 aa16.06■□□□□ 0.16
HERC3-206ENST00000431413 FUKQ8N0W3 1084 aa16.06■□□□□ 0.16
HERC3-206ENST00000431413 SCAMP5Q8TAC9 235 aa16.06■□□□□ 0.16
HERC3-206ENST00000431413 SLC2A14Q8TDB8 520 aa16.06■□□□□ 0.16
HERC3-206ENST00000431413 NETO1Q8TDF5 533 aa16.06■□□□□ 0.16
HERC3-206ENST00000431413 CHAMP1Q96JM3 812 aa16.06■□□□□ 0.16
HERC3-206ENST00000431413 SDCBP2Q9H190 292 aa16.06■□□□□ 0.16
HERC3-206ENST00000431413 CYP3A43Q9HB55 503 aa16.06■□□□□ 0.16
HERC3-206ENST00000431413 IL37Q9NZH6 218 aa16.06■□□□□ 0.16
HERC3-206ENST00000431413 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa16.06■□□□□ 0.16
HERC3-206ENST00000431413 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa16.06■□□□□ 0.16
HERC3-206ENST00000431413 PTPRDP23468 1912 aa16.06■□□□□ 0.16
HERC3-206ENST00000431413 GREB1Q4ZG55 1949 aa16.06■□□□□ 0.16
HERC3-206ENST00000431413 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa16.05■□□□□ 0.16
HERC3-206ENST00000431413 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
HERC3-206ENST00000431413 TNFRSF10BO14763 440 aa16.05■□□□□ 0.16
HERC3-206ENST00000431413 COCHO43405 550 aa16.05■□□□□ 0.16
HERC3-206ENST00000431413 CYP17A1P05093 508 aa16.05■□□□□ 0.16
HERC3-206ENST00000431413 PRR29P0C7W0 189 aa16.05■□□□□ 0.16
HERC3-206ENST00000431413 FAM200BP0CF97 657 aa16.05■□□□□ 0.16
HERC3-206ENST00000431413 CCDC130P13994 396 aa16.05■□□□□ 0.16
HERC3-206ENST00000431413 OPRD1P41143 372 aa16.05■□□□□ 0.16
HERC3-206ENST00000431413 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
HERC3-206ENST00000431413 ASPAP45381 313 aa16.05■□□□□ 0.16
HERC3-206ENST00000431413 GCLMP48507 274 aa16.05■□□□□ 0.16
HERC3-206ENST00000431413 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
HERC3-206ENST00000431413 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
HERC3-206ENST00000431413 TSTD1Q8NFU3 115 aa16.05■□□□□ 0.16
HERC3-206ENST00000431413 ELMO3Q96BJ8 720 aa16.05■□□□□ 0.16
HERC3-206ENST00000431413 HHIPQ96QV1 700 aa16.05■□□□□ 0.16
HERC3-206ENST00000431413 PNKPQ96T60 521 aa16.05■□□□□ 0.16
HERC3-206ENST00000431413 NT5C1AQ9BXI3 368 aa16.05■□□□□ 0.16
HERC3-206ENST00000431413 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa16.05■□□□□ 0.16
HERC3-206ENST00000431413 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
HERC3-206ENST00000431413 EBF1Q9UH73 591 aa16.05■□□□□ 0.16
HERC3-206ENST00000431413 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa16.05■□□□□ 0.16
HERC3-206ENST00000431413 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa16.05■□□□□ 0.16
HERC3-206ENST00000431413 FAM92AA1XBS5 289 aa16.04■□□□□ 0.16
HERC3-206ENST00000431413 STX10O60499 249 aa16.04■□□□□ 0.16
HERC3-206ENST00000431413 MAP3K7CLP57077 242 aa16.04■□□□□ 0.16
HERC3-206ENST00000431413 ELF2Q15723 593 aa16.04■□□□□ 0.16
HERC3-206ENST00000431413 EDRF1Q3B7T1 1238 aa16.04■□□□□ 0.16
HERC3-206ENST00000431413 C2orf27AQ580R0 203 aa16.04■□□□□ 0.16
HERC3-206ENST00000431413 BTBD8Q5XKL5 378 aa16.04■□□□□ 0.16
HERC3-206ENST00000431413 SPOPLQ6IQ16 392 aa16.04■□□□□ 0.16
HERC3-206ENST00000431413 PRR23CQ6ZRP0 262 aa16.04■□□□□ 0.16
HERC3-206ENST00000431413 NUDT18Q6ZVK8 323 aa16.04■□□□□ 0.16
HERC3-206ENST00000431413 TTC39CQ8N584 583 aa16.04■□□□□ 0.16
HERC3-206ENST00000431413 USP33Q8TEY7 942 aa16.04■□□□□ 0.16
HERC3-206ENST00000431413 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
HERC3-206ENST00000431413 SMOQ99835 787 aa16.04■□□□□ 0.16
HERC3-206ENST00000431413 NIF3L1Q9GZT8 377 aa16.04■□□□□ 0.16
HERC3-206ENST00000431413 TMEM8AQ9HCN3 771 aa16.04■□□□□ 0.16
HERC3-206ENST00000431413 FAM49BQ9NUQ9 324 aa16.04■□□□□ 0.16
HERC3-206ENST00000431413 RMND1Q9NWS8 449 aa16.04■□□□□ 0.16
HERC3-206ENST00000431413 GMIPQ9P107 970 aa16.04■□□□□ 0.16
HERC3-206ENST00000431413 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
HERC3-206ENST00000431413 DCHS1Q96JQ0 3298 aa16.04■□□□□ 0.16
HERC3-206ENST00000431413 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
HERC3-206ENST00000431413 RHOBTB1O94844 696 aa16.03■□□□□ 0.16
HERC3-206ENST00000431413 APODP05090 189 aa16.03■□□□□ 0.16
HERC3-206ENST00000431413 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa16.03■□□□□ 0.16
HERC3-206ENST00000431413 TRIM49P0CI25 452 aa16.03■□□□□ 0.16
HERC3-206ENST00000431413 TRIM49CP0CI26 452 aa16.03■□□□□ 0.16
HERC3-206ENST00000431413 ADH5P11766 374 aa16.03■□□□□ 0.16
HERC3-206ENST00000431413 ADORA2BP29275 332 aa16.03■□□□□ 0.16
HERC3-206ENST00000431413 HOXC13P31276 330 aa16.03■□□□□ 0.16
HERC3-206ENST00000431413 GTF2H1P32780 548 aa16.03■□□□□ 0.16
HERC3-206ENST00000431413 DGKEP52429 567 aa16.03■□□□□ 0.16
HERC3-206ENST00000431413 SEC13P55735 322 aa16.03■□□□□ 0.16
HERC3-206ENST00000431413 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
HERC3-206ENST00000431413 GAD2Q05329 585 aa16.03■□□□□ 0.16
HERC3-206ENST00000431413 GOLGA8FQ08AF8 430 aa16.03■□□□□ 0.16
HERC3-206ENST00000431413 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa16.03■□□□□ 0.16
HERC3-206ENST00000431413 INCA1Q0VD86 236 aa16.03■□□□□ 0.16
HERC3-206ENST00000431413 ORC1Q13415 861 aa16.03■□□□□ 0.16
HERC3-206ENST00000431413 BECN1Q14457 450 aa16.03■□□□□ 0.16
HERC3-206ENST00000431413 C1orf220Q5T0J3 134 aa16.03■□□□□ 0.16
HERC3-206ENST00000431413 KRT39Q6A163 491 aa16.03■□□□□ 0.16
HERC3-206ENST00000431413 RHBDF2Q6PJF5 856 aa16.03■□□□□ 0.16
HERC3-206ENST00000431413 C11orf74Q86VG3 221 aa16.03■□□□□ 0.16
HERC3-206ENST00000431413 C12orf29Q8N999 325 aa16.03■□□□□ 0.16
HERC3-206ENST00000431413 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
HERC3-206ENST00000431413 TAS1R2Q8TE23 839 aa16.03■□□□□ 0.16
HERC3-206ENST00000431413 CYFIP2Q96F07 1278 aa16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.2 ms