RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428527.1

TTC27-202, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 27, humanhuman

TSL 3

Gene TTC27, Length 687 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC27-202ENST00000428527 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
TTC27-202ENST00000428527 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa6.6□□□□□ -1.35
TTC27-202ENST00000428527 YAF2Q8IY57 180 aa6.6□□□□□ -1.35
TTC27-202ENST00000428527 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
TTC27-202ENST00000428527 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
TTC27-202ENST00000428527 ASB2Q96Q27 587 aa6.6□□□□□ -1.35
TTC27-202ENST00000428527 SNX18Q96RF0 628 aa6.6□□□□□ -1.35
TTC27-202ENST00000428527 MMS19Q96T76 1030 aa6.6□□□□□ -1.35
TTC27-202ENST00000428527 SEMA4CQ9C0C4 833 aa6.6□□□□□ -1.35
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TTC27-202ENST00000428527 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
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TTC27-202ENST00000428527 PGDP52209 483 aa6.58□□□□□ -1.36
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TTC27-202ENST00000428527 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP6.58□□□□□ -1.36
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TTC27-202ENST00000428527 CEP78Q5JTW2 689 aa6.58□□□□□ -1.36
TTC27-202ENST00000428527 CYB5RLQ6IPT4 315 aa6.58□□□□□ -1.36
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TTC27-202ENST00000428527 UNC13DQ70J99 1090 aa6.58□□□□□ -1.36
TTC27-202ENST00000428527 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
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TTC27-202ENST00000428527 ZNF212Q9UDV6 495 aa6.57□□□□□ -1.36
TTC27-202ENST00000428527 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
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TTC27-202ENST00000428527 TUBB4AP04350 444 aa6.56□□□□□ -1.36
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TTC27-202ENST00000428527 IL1R2P27930 398 aa6.56□□□□□ -1.36
TTC27-202ENST00000428527 GATMP50440 423 aa6.56□□□□□ -1.36
TTC27-202ENST00000428527 LMAN2Q12907 356 aa6.56□□□□□ -1.36
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TTC27-202ENST00000428527 C5orf34Q96MH7 638 aa6.56□□□□□ -1.36
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TTC27-202ENST00000428527 SNX15Q9NRS6 342 aa6.56□□□□□ -1.36
TTC27-202ENST00000428527 CORO2BQ9UQ03 480 aa6.56□□□□□ -1.36
TTC27-202ENST00000428527 F8W8V4 182 aa6.55□□□□□ -1.36
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TTC27-202ENST00000428527 SPRY2O43597 315 aa6.55□□□□□ -1.36
TTC27-202ENST00000428527 GCATO75600 419 aa6.55□□□□□ -1.36
TTC27-202ENST00000428527 MT-ND5P03915 603 aa6.55□□□□□ -1.36
TTC27-202ENST00000428527 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
TTC27-202ENST00000428527 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
TTC27-202ENST00000428527 CREB1P16220 341 aa6.55□□□□□ -1.36
TTC27-202ENST00000428527 BTF3P20290 206 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
TTC27-202ENST00000428527 DIO1P49895 249 aa6.55□□□□□ -1.36
TTC27-202ENST00000428527 KCNAB1Q14722 419 aa6.55□□□□□ -1.36
TTC27-202ENST00000428527 FAM187BQ17R55 369 aa6.55□□□□□ -1.36
TTC27-202ENST00000428527 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa6.55□□□□□ -1.36
TTC27-202ENST00000428527 PLAG1Q6DJT9 500 aa6.55□□□□□ -1.36
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