RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427722.2

RFX3-AS1-202, RFX3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene RFX3-AS1, Length 1,088 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX3-AS1-202ENST00000427722 SH3RF2Q8TEC5 729 aa9.77□□□□□ -0.85
RFX3-AS1-202ENST00000427722 SLC35C1Q96A29 364 aa9.77□□□□□ -0.85
RFX3-AS1-202ENST00000427722 MSANTD3Q96H12 275 aa9.77□□□□□ -0.85
RFX3-AS1-202ENST00000427722 CYP2S1Q96SQ9 504 aa9.77□□□□□ -0.85
RFX3-AS1-202ENST00000427722 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
RFX3-AS1-202ENST00000427722 TMUB1Q9BVT8 246 aa9.77□□□□□ -0.85
RFX3-AS1-202ENST00000427722 OSBPL6Q9BZF3 934 aa9.77□□□□□ -0.85
RFX3-AS1-202ENST00000427722 EBF3Q9H4W6 596 aa9.77□□□□□ -0.85
RFX3-AS1-202ENST00000427722 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
RFX3-AS1-202ENST00000427722 TDP1Q9NUW8 608 aa9.77□□□□□ -0.85
RFX3-AS1-202ENST00000427722 SMPD4Q9NXE4 827 aa9.77□□□□□ -0.85
RFX3-AS1-202ENST00000427722 GCNT4Q9P109 453 aa9.77□□□□□ -0.85
RFX3-AS1-202ENST00000427722 MYO10Q9HD67 2058 aa9.76□□□□□ -0.85
RFX3-AS1-202ENST00000427722 SOBPA7XYQ1 873 aa9.76□□□□□ -0.85
RFX3-AS1-202ENST00000427722 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
RFX3-AS1-202ENST00000427722 NCAM2O15394 837 aa9.76□□□□□ -0.85
RFX3-AS1-202ENST00000427722 BEST1O76090 585 aa9.76□□□□□ -0.85
RFX3-AS1-202ENST00000427722 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
RFX3-AS1-202ENST00000427722 HDCP19113 662 aa9.76□□□□□ -0.85
RFX3-AS1-202ENST00000427722 YWHAQP27348 245 aa9.76□□□□□ -0.85
RFX3-AS1-202ENST00000427722 MRE11P49959 708 aa9.76□□□□□ -0.85
RFX3-AS1-202ENST00000427722 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
RFX3-AS1-202ENST00000427722 LRMPQ12912 555 aa9.76□□□□□ -0.85
RFX3-AS1-202ENST00000427722 ZNF77Q15935 545 aa9.76□□□□□ -0.85
RFX3-AS1-202ENST00000427722 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa9.76□□□□□ -0.85
RFX3-AS1-202ENST00000427722 TXNDC11Q6PKC3 985 aa9.76□□□□□ -0.85
RFX3-AS1-202ENST00000427722 FRMD5Q7Z6J6 570 aa9.76□□□□□ -0.85
RFX3-AS1-202ENST00000427722 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
RFX3-AS1-202ENST00000427722 C1orf210Q8IVY1 113 aa9.76□□□□□ -0.85
RFX3-AS1-202ENST00000427722 CRYBG2Q8N1P7 616 aa9.76□□□□□ -0.85
RFX3-AS1-202ENST00000427722 TRIML1Q8N9V2 468 aa9.76□□□□□ -0.85
RFX3-AS1-202ENST00000427722 ZMIZ2Q8NF64 920 aa9.76□□□□□ -0.85
RFX3-AS1-202ENST00000427722 WHAMMQ8TF30 809 aa9.76□□□□□ -0.85
RFX3-AS1-202ENST00000427722 NELL2Q99435 816 aa9.76□□□□□ -0.85
RFX3-AS1-202ENST00000427722 SMOQ99835 787 aa9.76□□□□□ -0.85
RFX3-AS1-202ENST00000427722 DNAI2Q9GZS0 605 aa9.76□□□□□ -0.85
RFX3-AS1-202ENST00000427722 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
RFX3-AS1-202ENST00000427722 HPS4Q9NQG7 708 aa9.76□□□□□ -0.85
RFX3-AS1-202ENST00000427722 GKN1Q9NS71 199 aa9.76□□□□□ -0.85
RFX3-AS1-202ENST00000427722 CISHQ9NSE2 258 aa9.76□□□□□ -0.85
RFX3-AS1-202ENST00000427722 GMIPQ9P107 970 aa9.76□□□□□ -0.85
RFX3-AS1-202ENST00000427722 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa9.76□□□□□ -0.85
RFX3-AS1-202ENST00000427722 WNT6Q9Y6F9 365 aa9.76□□□□□ -0.85
RFX3-AS1-202ENST00000427722 PIEZO1Q92508 2521 aa9.75□□□□□ -0.85
RFX3-AS1-202ENST00000427722 LAMTOR5O43504 91 aa9.75□□□□□ -0.85
RFX3-AS1-202ENST00000427722 OAS1P00973 400 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
RFX3-AS1-202ENST00000427722 MAGEA9P43362 315 aa9.75□□□□□ -0.85
RFX3-AS1-202ENST00000427722 PPP3CCP48454 512 aa9.75□□□□□ -0.85
RFX3-AS1-202ENST00000427722 IFNAR2P48551 515 aa9.75□□□□□ -0.85
RFX3-AS1-202ENST00000427722 FMO5P49326 533 aa9.75□□□□□ -0.85
RFX3-AS1-202ENST00000427722 CUL2Q13617 745 aa9.75□□□□□ -0.85
RFX3-AS1-202ENST00000427722 RUNX3Q13761 415 aa9.75□□□□□ -0.85
RFX3-AS1-202ENST00000427722 PON2Q15165 354 aa9.75□□□□□ -0.85
RFX3-AS1-202ENST00000427722 PDGFRLQ15198 375 aa9.75□□□□□ -0.85
RFX3-AS1-202ENST00000427722 C1orf228Q6PIY5 440 aa9.75□□□□□ -0.85
RFX3-AS1-202ENST00000427722 FOXR2Q6PJQ5 311 aa9.75□□□□□ -0.85
RFX3-AS1-202ENST00000427722 CLEC20AQ6ZU45 233 aa9.75□□□□□ -0.85
RFX3-AS1-202ENST00000427722 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa9.75□□□□□ -0.85
RFX3-AS1-202ENST00000427722 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa9.75□□□□□ -0.85
RFX3-AS1-202ENST00000427722 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
RFX3-AS1-202ENST00000427722 SCUBE3Q8IX30 993 aa9.75□□□□□ -0.85
RFX3-AS1-202ENST00000427722 CPA6Q8N4T0 437 aa9.75□□□□□ -0.85
RFX3-AS1-202ENST00000427722 TTC39CQ8N584 583 aa9.75□□□□□ -0.85
RFX3-AS1-202ENST00000427722 PDZD8Q8NEN9 1154 aa9.75□□□□□ -0.85
RFX3-AS1-202ENST00000427722 CLDN23Q96B33 292 aa9.75□□□□□ -0.85
RFX3-AS1-202ENST00000427722 CYFIP2Q96F07 1278 aa9.75□□□□□ -0.85
RFX3-AS1-202ENST00000427722 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
RFX3-AS1-202ENST00000427722 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
RFX3-AS1-202ENST00000427722 FAM83CQ9BQN1 747 aa9.75□□□□□ -0.85
RFX3-AS1-202ENST00000427722 NACA2Q9H009 215 aa9.75□□□□□ -0.85
RFX3-AS1-202ENST00000427722 CHRDQ9H2X0 955 aa9.75□□□□□ -0.85
RFX3-AS1-202ENST00000427722 CLSTN2Q9H4D0 955 aa9.75□□□□□ -0.85
RFX3-AS1-202ENST00000427722 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
RFX3-AS1-202ENST00000427722 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
RFX3-AS1-202ENST00000427722 COQ4Q9Y3A0 265 aa9.75□□□□□ -0.85
RFX3-AS1-202ENST00000427722 CPQQ9Y646 472 aa9.75□□□□□ -0.85
RFX3-AS1-202ENST00000427722 TCHHQ07283 1943 aa9.74□□□□□ -0.85
RFX3-AS1-202ENST00000427722 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
RFX3-AS1-202ENST00000427722 LEFTY2O00292 366 aa9.74□□□□□ -0.85
RFX3-AS1-202ENST00000427722 TNFRSF10BO14763 440 aa9.74□□□□□ -0.85
RFX3-AS1-202ENST00000427722 CYP26A1O43174 497 aa9.74□□□□□ -0.85
RFX3-AS1-202ENST00000427722 COCHO43405 550 aa9.74□□□□□ -0.85
RFX3-AS1-202ENST00000427722 OLFM2O95897 454 aa9.74□□□□□ -0.85
RFX3-AS1-202ENST00000427722 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
RFX3-AS1-202ENST00000427722 PFKLP17858 780 aa9.74□□□□□ -0.85
RFX3-AS1-202ENST00000427722 NBL1P41271 181 aa9.74□□□□□ -0.85
RFX3-AS1-202ENST00000427722 RPS9P46781 194 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
RFX3-AS1-202ENST00000427722 RAD23BP54727 409 aa9.74□□□□□ -0.85
RFX3-AS1-202ENST00000427722 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
RFX3-AS1-202ENST00000427722 SLC7A9P82251 487 aa9.74□□□□□ -0.85
RFX3-AS1-202ENST00000427722 MTAPQ13126 283 aa9.74□□□□□ -0.85
RFX3-AS1-202ENST00000427722 FZD5Q13467 585 aa9.74□□□□□ -0.85
RFX3-AS1-202ENST00000427722 LRRC32Q14392 662 aa9.74□□□□□ -0.85
RFX3-AS1-202ENST00000427722 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
RFX3-AS1-202ENST00000427722 Q6ZS52 159 aa9.74□□□□□ -0.85
RFX3-AS1-202ENST00000427722 SLC4A11Q8NBS3 891 aa9.74□□□□□ -0.85
RFX3-AS1-202ENST00000427722 OSCP1Q8WVF1 389 aa9.74□□□□□ -0.85
RFX3-AS1-202ENST00000427722 OVCA2Q8WZ82 227 aa9.74□□□□□ -0.85
RFX3-AS1-202ENST00000427722 FAXDC2Q96IV6 333 aa9.74□□□□□ -0.85
RFX3-AS1-202ENST00000427722 NT5C1BQ96P26 610 aa9.74□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.6 ms