RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427110.6

PTPRC-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 264 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-208ENST00000427110 PPIFP30405 207 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 PRKAR1BP31321 381 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 HSPA7P48741 367 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 MTHFSP49914 203 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 PDE6CP51160 858 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 CLCN2P51788 898 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 DGKEP52429 567 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 ELLP55199 621 aaPredicted RBP2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 SP2Q02086 613 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 MPEG1Q2M385 716 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 DGKKQ5KSL6 1271 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 DEPDC1Q5TB30 811 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 ANO1Q5XXA6 986 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 PLAG1Q6DJT9 500 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 GGT6Q6P531 493 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 ZNF527Q8NB42 609 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 DNAJB14Q8TBM8 379 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 TMEM171Q8WVE6 324 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 DDB2Q92466 427 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 PGBD1Q96JS3 809 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 UROC1Q96N76 676 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 OSBPL9Q96SU4 736 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 NELL2Q99435 816 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 CXorf36Q9H7Y0 433 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 SLC17A6Q9P2U8 582 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 WDR27A2RRH5 827 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 AREL1O15033 823 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 ADAMTS3O15072 1205 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 FFAR2O15552 330 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 COQ9O75208 318 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 TCEA3O75764 348 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 GPD1P21695 349 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 LMO1P25800 156 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 PCSK6P29122 969 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 ADORA2AP29274 412 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 ICA1Q05084 483 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 ITIH3Q06033 890 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 CCNIQ14094 377 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 KCNAB1Q14722 419 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 PTPRRQ15256 657 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 TBCCQ15814 346 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 PTCHD3Q3KNS1 767 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 TMEM119Q4V9L6 283 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 CERCAMQ5T4B2 595 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 MZT2AQ6P582 158 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 CRTC1Q6UUV9 634 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 ZNF788Q6ZQV5 615 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 VGLL2Q8N8G2 317 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 OSCP1Q8WVF1 389 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 ATRIPQ8WXE1 791 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 RFKQ969G6 155 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 FKBP10Q96AY3 582 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 SNX27Q96L92 541 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 HAPLN3Q96S86 360 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 SLC25A32Q9H2D1 315 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 FAM83DQ9H4H8 585 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 PPCSQ9HAB8 311 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 GLOD4Q9HC38 313 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 PTPRHQ9HD43 1115 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 KLC4Q9NSK0 619 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 SLC39A10Q9ULF5 831 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 HPSEQ9Y251 543 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 A0A087WV62 115 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 PLEKHD1A6NEE1 506 aa2.88□□□□□ -1.95
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PTPRC-208ENST00000427110 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 ORC4O43929 436 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 PLA2G6O60733 806 aa2.88□□□□□ -1.95
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PTPRC-208ENST00000427110 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 URI1O94763 535 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 A1BGP04217 495 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 HGFP14210 728 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 JUPP14923 745 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 KCNA3P22001 575 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 ITPKBP27987 946 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 ATICP31939 592 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
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