RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420768.1

TOP3BP1-201, Transcript of DNA topoisomerase III beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene TOP3BP1, Length 1,380 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BP1-201ENST00000420768 BUB1O43683 1085 aa17.79■□□□□ 0.44
TOP3BP1-201ENST00000420768 MOCS3O95396 460 aa17.79■□□□□ 0.44
TOP3BP1-201ENST00000420768 TUBB4AP04350 444 aa17.79■□□□□ 0.44
TOP3BP1-201ENST00000420768 GPR15P49685 360 aa17.79■□□□□ 0.44
TOP3BP1-201ENST00000420768 CLCN4P51793 760 aa17.79■□□□□ 0.44
TOP3BP1-201ENST00000420768 DAOAP59103 153 aa17.79■□□□□ 0.44
TOP3BP1-201ENST00000420768 VEPH1Q14D04 833 aa17.79■□□□□ 0.44
TOP3BP1-201ENST00000420768 LLGL2Q6P1M3 1020 aa17.79■□□□□ 0.44
TOP3BP1-201ENST00000420768 TPCN2Q8NHX9 752 aa17.79■□□□□ 0.44
TOP3BP1-201ENST00000420768 GDPD5Q8WTR4 605 aa17.79■□□□□ 0.44
TOP3BP1-201ENST00000420768 MCEEQ96PE7 176 aa17.79■□□□□ 0.44
TOP3BP1-201ENST00000420768 TRIM62Q9BVG3 475 aa17.79■□□□□ 0.44
TOP3BP1-201ENST00000420768 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP17.79■□□□□ 0.44
TOP3BP1-201ENST00000420768 DPP7Q9UHL4 492 aa17.79■□□□□ 0.44
TOP3BP1-201ENST00000420768 YIPF1Q9Y548 306 aa17.79■□□□□ 0.44
TOP3BP1-201ENST00000420768 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa17.79■□□□□ 0.44
TOP3BP1-201ENST00000420768 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa17.79■□□□□ 0.44
TOP3BP1-201ENST00000420768 TMEM265A0A087WTH1 108 aa17.79■□□□□ 0.44
TOP3BP1-201ENST00000420768 FAM92AA1XBS5 289 aa17.79■□□□□ 0.44
TOP3BP1-201ENST00000420768 MYO1FO00160 1098 aa17.79■□□□□ 0.44
TOP3BP1-201ENST00000420768 HSF2BPO75031 334 aa17.79■□□□□ 0.44
TOP3BP1-201ENST00000420768 SOAT2O75908 522 aa17.79■□□□□ 0.44
TOP3BP1-201ENST00000420768 CSPG5O95196 566 aa17.79■□□□□ 0.44
TOP3BP1-201ENST00000420768 ATF6P18850 670 aa17.79■□□□□ 0.44
TOP3BP1-201ENST00000420768 NYAP1Q6ZVC0 841 aa17.79■□□□□ 0.44
TOP3BP1-201ENST00000420768 SYCE1Q8N0S2 351 aa17.79■□□□□ 0.44
TOP3BP1-201ENST00000420768 KREMEN2Q8NCW0 462 aa17.79■□□□□ 0.44
TOP3BP1-201ENST00000420768 FNIP1Q8TF40 1166 aa17.79■□□□□ 0.44
TOP3BP1-201ENST00000420768 HDAC7Q8WUI4 952 aa17.79■□□□□ 0.44
TOP3BP1-201ENST00000420768 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa17.79■□□□□ 0.44
TOP3BP1-201ENST00000420768 GOLGA1Q92805 767 aa17.79■□□□□ 0.44
TOP3BP1-201ENST00000420768 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP17.79■□□□□ 0.44
TOP3BP1-201ENST00000420768 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa17.79■□□□□ 0.44
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF576Q9H609 170 aa17.79■□□□□ 0.44
TOP3BP1-201ENST00000420768 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP17.79■□□□□ 0.44
TOP3BP1-201ENST00000420768 ANAPC7Q9UJX3 599 aa17.79■□□□□ 0.44
TOP3BP1-201ENST00000420768 TMEM59LQ9UK28 342 aa17.79■□□□□ 0.44
TOP3BP1-201ENST00000420768 SCML2Q9UQR0 700 aa17.79■□□□□ 0.44
TOP3BP1-201ENST00000420768 INSL5Q9Y5Q6 135 aa17.79■□□□□ 0.44
TOP3BP1-201ENST00000420768 EPOPA6NHQ4 379 aa17.78■□□□□ 0.44
TOP3BP1-201ENST00000420768 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP17.78■□□□□ 0.44
TOP3BP1-201ENST00000420768 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP17.78■□□□□ 0.44
TOP3BP1-201ENST00000420768 USP17L7P0C7H9 530 aa17.78■□□□□ 0.44
TOP3BP1-201ENST00000420768 CSH1P0DML2 217 aa17.78■□□□□ 0.44
TOP3BP1-201ENST00000420768 CSH2P0DML3 217 aa17.78■□□□□ 0.44
TOP3BP1-201ENST00000420768 YWHAQP27348 245 aa17.78■□□□□ 0.44
TOP3BP1-201ENST00000420768 EPHB3P54753 998 aa17.78■□□□□ 0.44
TOP3BP1-201ENST00000420768 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP17.78■□□□□ 0.44
TOP3BP1-201ENST00000420768 SDHAF4Q5VUM1 108 aa17.78■□□□□ 0.44
TOP3BP1-201ENST00000420768 C11orf63Q6NUN7 778 aa17.78■□□□□ 0.44
TOP3BP1-201ENST00000420768 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa17.78■□□□□ 0.44
TOP3BP1-201ENST00000420768 ARHGAP18Q8N392 663 aa17.78■□□□□ 0.44
TOP3BP1-201ENST00000420768 SCAMP5Q8TAC9 235 aa17.78■□□□□ 0.44
TOP3BP1-201ENST00000420768 CLEC4CQ8WTT0 213 aa17.78■□□□□ 0.44
TOP3BP1-201ENST00000420768 PPP2R3CQ969Q6 453 aa17.78■□□□□ 0.44
TOP3BP1-201ENST00000420768 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP17.78■□□□□ 0.44
TOP3BP1-201ENST00000420768 TTLL2Q9BWV7 592 aa17.78■□□□□ 0.44
TOP3BP1-201ENST00000420768 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP17.78■□□□□ 0.44
TOP3BP1-201ENST00000420768 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP17.78■□□□□ 0.44
TOP3BP1-201ENST00000420768 ASB3Q9Y575 518 aa17.78■□□□□ 0.44
TOP3BP1-201ENST00000420768 SLC38A8A6NNN8 435 aa17.77■□□□□ 0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP17.77■□□□□ 0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP17.77■□□□□ 0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP17.77■□□□□ 0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 BEND5Q7L4P6 421 aa17.77■□□□□ 0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 ITIH5Q86UX2 942 aa17.77■□□□□ 0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 MON1AQ86VX9 555 aa17.77■□□□□ 0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 SLC7A14Q8TBB6 771 aa17.77■□□□□ 0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP17.77■□□□□ 0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 FAM149B1Q96BN6 582 aa17.77■□□□□ 0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP17.77■□□□□ 0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 POPDC2Q9HBU9 364 aa17.77■□□□□ 0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 IP6K2Q9UHH9 426 aa17.77■□□□□ 0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa17.77■□□□□ 0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 GRID2IPA4D2P6 1211 aa17.76■□□□□ 0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 YJEFN3A6XGL0 299 aa17.76■□□□□ 0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 E7ENQ6 273 aa17.76■□□□□ 0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 DAB1O75553 588 aa17.76■□□□□ 0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 PALMO75781 387 aa17.76■□□□□ 0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 GJB6O95452 261 aa17.76■□□□□ 0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 LRG1P02750 347 aa17.76■□□□□ 0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 LTFP02788 710 aa17.76■□□□□ 0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 C8AP07357 584 aa17.76■□□□□ 0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 SPATA31D3P0C874 917 aa17.76■□□□□ 0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 DESP17661 470 aa17.76■□□□□ 0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 PSEN1P49768 467 aa17.76■□□□□ 0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP17.76■□□□□ 0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 GNG11P61952 73 aa17.76■□□□□ 0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 ETF1P62495 437 aaKnown RBP17.76■□□□□ 0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 TWF1Q12792 350 aa17.76■□□□□ 0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP17.76■□□□□ 0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 ACAP1Q15027 740 aa17.76■□□□□ 0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 TAF5Q15542 800 aa17.76■□□□□ 0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 TAF12Q16514 161 aa17.76■□□□□ 0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF569Q5MCW4 686 aa17.76■□□□□ 0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa17.76■□□□□ 0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 DAAM2Q86T65 1068 aa17.76■□□□□ 0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 LRRC57Q8N9N7 239 aa17.76■□□□□ 0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 JOSD2Q8TAC2 188 aa17.76■□□□□ 0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 GPR152Q8TDT2 470 aa17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.1 ms