RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416021.5

SH3BP4-204, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 593 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-204ENST00000416021 DTWD2Q8NBA8 298 aa22.27■■□□□ 1.16
SH3BP4-204ENST00000416021 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa22.27■■□□□ 1.16
SH3BP4-204ENST00000416021 EBF3Q9H4W6 596 aa22.27■■□□□ 1.16
SH3BP4-204ENST00000416021 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
SH3BP4-204ENST00000416021 ANO10Q9NW15 660 aa22.27■■□□□ 1.16
SH3BP4-204ENST00000416021 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa22.27■■□□□ 1.16
SH3BP4-204ENST00000416021 HESX1Q9UBX0 185 aa22.27■■□□□ 1.16
SH3BP4-204ENST00000416021 TSPAN16Q9UKR8 245 aa22.27■■□□□ 1.16
SH3BP4-204ENST00000416021 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa22.27■■□□□ 1.16
SH3BP4-204ENST00000416021 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa22.27■■□□□ 1.16
SH3BP4-204ENST00000416021 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
SH3BP4-204ENST00000416021 KCNJ18B7U540 433 aa22.26■■□□□ 1.15
SH3BP4-204ENST00000416021 LEFTY2O00292 366 aa22.26■■□□□ 1.15
SH3BP4-204ENST00000416021 COCHO43405 550 aa22.26■■□□□ 1.15
SH3BP4-204ENST00000416021 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
SH3BP4-204ENST00000416021 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
SH3BP4-204ENST00000416021 TARSP26639 723 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
SH3BP4-204ENST00000416021 SOX9P48436 509 aa22.26■■□□□ 1.15
SH3BP4-204ENST00000416021 RUNX3Q13761 415 aa22.26■■□□□ 1.15
SH3BP4-204ENST00000416021 KCNJ12Q14500 433 aa22.26■■□□□ 1.15
SH3BP4-204ENST00000416021 PDGFRLQ15198 375 aa22.26■■□□□ 1.15
SH3BP4-204ENST00000416021 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa22.26■■□□□ 1.15
SH3BP4-204ENST00000416021 TRIM65Q6PJ69 517 aa22.26■■□□□ 1.15
SH3BP4-204ENST00000416021 PIGZQ86VD9 579 aa22.26■■□□□ 1.15
SH3BP4-204ENST00000416021 CCDC105Q8IYK2 499 aa22.26■■□□□ 1.15
SH3BP4-204ENST00000416021 UBA3Q8TBC4 463 aa22.26■■□□□ 1.15
SH3BP4-204ENST00000416021 OSCP1Q8WVF1 389 aa22.26■■□□□ 1.15
SH3BP4-204ENST00000416021 TFAP2BQ92481 460 aa22.26■■□□□ 1.15
SH3BP4-204ENST00000416021 LINC00597Q9H2U6 94 aa22.26■■□□□ 1.15
SH3BP4-204ENST00000416021 NDST4Q9H3R1 872 aa22.26■■□□□ 1.15
SH3BP4-204ENST00000416021 CCSER2Q9H7U1 834 aa22.26■■□□□ 1.15
SH3BP4-204ENST00000416021 HPS4Q9NQG7 708 aa22.26■■□□□ 1.15
SH3BP4-204ENST00000416021 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
SH3BP4-204ENST00000416021 SMPD4Q9NXE4 827 aa22.26■■□□□ 1.15
SH3BP4-204ENST00000416021 CPQQ9Y646 472 aa22.26■■□□□ 1.15
SH3BP4-204ENST00000416021 USP3Q9Y6I4 520 aa22.26■■□□□ 1.15
SH3BP4-204ENST00000416021 PTPRDP23468 1912 aa22.25■■□□□ 1.15
SH3BP4-204ENST00000416021 O00370 1275 aa22.25■■□□□ 1.15
SH3BP4-204ENST00000416021 NCAM2O15394 837 aa22.25■■□□□ 1.15
SH3BP4-204ENST00000416021 CYP26A1O43174 497 aa22.25■■□□□ 1.15
SH3BP4-204ENST00000416021 PON1P27169 355 aa22.25■■□□□ 1.15
SH3BP4-204ENST00000416021 TUBP50607 506 aa22.25■■□□□ 1.15
SH3BP4-204ENST00000416021 MFAP3P55082 362 aa22.25■■□□□ 1.15
SH3BP4-204ENST00000416021 PDE4CQ08493 712 aa22.25■■□□□ 1.15
SH3BP4-204ENST00000416021 TCF15Q12870 199 aa22.25■■□□□ 1.15
SH3BP4-204ENST00000416021 USP4Q13107 963 aa22.25■■□□□ 1.15
SH3BP4-204ENST00000416021 CNGA2Q16280 664 aa22.25■■□□□ 1.15
SH3BP4-204ENST00000416021 TCP11X2Q5H9J9 407 aa22.25■■□□□ 1.15
SH3BP4-204ENST00000416021 GJB7Q6PEY0 223 aa22.25■■□□□ 1.15
SH3BP4-204ENST00000416021 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa22.25■■□□□ 1.15
SH3BP4-204ENST00000416021 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
SH3BP4-204ENST00000416021 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
SH3BP4-204ENST00000416021 MSANTD3Q96H12 275 aa22.25■■□□□ 1.15
SH3BP4-204ENST00000416021 TMEM63CQ9P1W3 806 aa22.25■■□□□ 1.15
SH3BP4-204ENST00000416021 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
SH3BP4-204ENST00000416021 CNTN6Q9UQ52 1028 aa22.25■■□□□ 1.15
SH3BP4-204ENST00000416021 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
SH3BP4-204ENST00000416021 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa22.24■■□□□ 1.15
SH3BP4-204ENST00000416021 CALCAP01258 141 aa22.24■■□□□ 1.15
SH3BP4-204ENST00000416021 ARSAP15289 507 aa22.24■■□□□ 1.15
SH3BP4-204ENST00000416021 BCAT1P54687 386 aa22.24■■□□□ 1.15
SH3BP4-204ENST00000416021 PTPN5P54829 565 aa22.24■■□□□ 1.15
SH3BP4-204ENST00000416021 APBA1Q02410 837 aa22.24■■□□□ 1.15
SH3BP4-204ENST00000416021 FZD5Q13467 585 aa22.24■■□□□ 1.15
SH3BP4-204ENST00000416021 STX1AQ16623 288 aa22.24■■□□□ 1.15
SH3BP4-204ENST00000416021 MIIPQ5JXC2 388 aa22.24■■□□□ 1.15
SH3BP4-204ENST00000416021 C1orf228Q6PIY5 440 aa22.24■■□□□ 1.15
SH3BP4-204ENST00000416021 LCLAT1Q6UWP7 414 aa22.24■■□□□ 1.15
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF687Q8N1G0 1237 aa22.24■■□□□ 1.15
SH3BP4-204ENST00000416021 FAM81BQ96LP2 452 aa22.24■■□□□ 1.15
SH3BP4-204ENST00000416021 ZSWIM1Q9BR11 485 aa22.24■■□□□ 1.15
SH3BP4-204ENST00000416021 OSER1Q9NX31 292 aa22.24■■□□□ 1.15
SH3BP4-204ENST00000416021 WNT6Q9Y6F9 365 aa22.24■■□□□ 1.15
SH3BP4-204ENST00000416021 A0A1W2PQH9 124 aa22.23■■□□□ 1.15
SH3BP4-204ENST00000416021 TULP2O00295 520 aa22.23■■□□□ 1.15
SH3BP4-204ENST00000416021 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
SH3BP4-204ENST00000416021 TLR5O60602 858 aa22.23■■□□□ 1.15
SH3BP4-204ENST00000416021 TBX18O95935 607 aa22.23■■□□□ 1.15
SH3BP4-204ENST00000416021 KRT5P13647 590 aa22.23■■□□□ 1.15
SH3BP4-204ENST00000416021 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
SH3BP4-204ENST00000416021 IFNAR2P48551 515 aa22.23■■□□□ 1.15
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF132P52740 706 aa22.23■■□□□ 1.15
SH3BP4-204ENST00000416021 BST2Q10589 180 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
SH3BP4-204ENST00000416021 RAB41Q5JT25 222 aa22.23■■□□□ 1.15
SH3BP4-204ENST00000416021 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
SH3BP4-204ENST00000416021 CCDC186Q7Z3E2 898 aa22.23■■□□□ 1.15
SH3BP4-204ENST00000416021 SCD5Q86SK9 330 aa22.23■■□□□ 1.15
SH3BP4-204ENST00000416021 CLDN23Q96B33 292 aa22.23■■□□□ 1.15
SH3BP4-204ENST00000416021 NACA2Q9H009 215 aa22.23■■□□□ 1.15
SH3BP4-204ENST00000416021 NMUR1Q9HB89 426 aa22.23■■□□□ 1.15
SH3BP4-204ENST00000416021 CFAP97Q9P2B7 532 aa22.23■■□□□ 1.15
SH3BP4-204ENST00000416021 APEX2Q9UBZ4 518 aa22.23■■□□□ 1.15
SH3BP4-204ENST00000416021 GREB1Q4ZG55 1949 aa22.22■■□□□ 1.15
SH3BP4-204ENST00000416021 H0Y858 1186 aa22.22■■□□□ 1.15
SH3BP4-204ENST00000416021 PES1O00541 588 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
SH3BP4-204ENST00000416021 BRD2P25440 801 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
SH3BP4-204ENST00000416021 CTHP32929 405 aa22.22■■□□□ 1.15
SH3BP4-204ENST00000416021 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
SH3BP4-204ENST00000416021 TKTL1P51854 596 aa22.22■■□□□ 1.15
SH3BP4-204ENST00000416021 STILQ15468 1287 aa22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.6 ms