RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395322.3

CTXN3-202, Transcript of cortexin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTXN3, Length 1,458 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3-202ENST00000395322 VCPP55072 806 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
CTXN3-202ENST00000395322 IFFO1Q0D2I5 559 aa11.66□□□□□ -0.54
CTXN3-202ENST00000395322 TFDP2Q14188 446 aa11.66□□□□□ -0.54
CTXN3-202ENST00000395322 DSC3Q14574 896 aa11.66□□□□□ -0.54
CTXN3-202ENST00000395322 LPIN1Q14693 890 aa11.66□□□□□ -0.54
CTXN3-202ENST00000395322 PDK2Q15119 407 aa11.66□□□□□ -0.54
CTXN3-202ENST00000395322 TAZQ16635 292 aa11.66□□□□□ -0.54
CTXN3-202ENST00000395322 TUBB8Q3ZCM7 444 aa11.66□□□□□ -0.54
CTXN3-202ENST00000395322 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa11.66□□□□□ -0.54
CTXN3-202ENST00000395322 BOLA3Q53S33 107 aa11.66□□□□□ -0.54
CTXN3-202ENST00000395322 EFHC1Q5JVL4 640 aa11.66□□□□□ -0.54
CTXN3-202ENST00000395322 CEP85LQ5SZL2 805 aa11.66□□□□□ -0.54
CTXN3-202ENST00000395322 DENND2CQ68D51 928 aa11.66□□□□□ -0.54
CTXN3-202ENST00000395322 DSTYKQ6XUX3 929 aa11.66□□□□□ -0.54
CTXN3-202ENST00000395322 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
CTXN3-202ENST00000395322 BBS12Q6ZW61 710 aa11.66□□□□□ -0.54
CTXN3-202ENST00000395322 HOOK3Q86VS8 718 aa11.66□□□□□ -0.54
CTXN3-202ENST00000395322 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
CTXN3-202ENST00000395322 SLC2A14Q8TDB8 520 aa11.66□□□□□ -0.54
CTXN3-202ENST00000395322 TEKT4Q8WW24 435 aa11.66□□□□□ -0.54
CTXN3-202ENST00000395322 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
CTXN3-202ENST00000395322 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
CTXN3-202ENST00000395322 SENP8Q96LD8 212 aa11.66□□□□□ -0.54
CTXN3-202ENST00000395322 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
CTXN3-202ENST00000395322 TXLNGYQ9BZA5 131 aa11.66□□□□□ -0.54
CTXN3-202ENST00000395322 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
CTXN3-202ENST00000395322 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
CTXN3-202ENST00000395322 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
CTXN3-202ENST00000395322 ZNF148Q9UQR1 794 aa11.66□□□□□ -0.54
CTXN3-202ENST00000395322 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
CTXN3-202ENST00000395322 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
CTXN3-202ENST00000395322 KRT14P02533 472 aa11.65□□□□□ -0.54
CTXN3-202ENST00000395322 NUDT17P0C025 328 aa11.65□□□□□ -0.54
CTXN3-202ENST00000395322 RARGP13631 454 aa11.65□□□□□ -0.54
CTXN3-202ENST00000395322 NPR3P17342 541 aa11.65□□□□□ -0.54
CTXN3-202ENST00000395322 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
CTXN3-202ENST00000395322 LMO2P25791 158 aa11.65□□□□□ -0.54
CTXN3-202ENST00000395322 IL1R2P27930 398 aa11.65□□□□□ -0.54
CTXN3-202ENST00000395322 PCSK1P29120 753 aa11.65□□□□□ -0.54
CTXN3-202ENST00000395322 FLT3P36888 993 aa11.65□□□□□ -0.54
CTXN3-202ENST00000395322 SCNN1GP51170 649 aa11.65□□□□□ -0.54
CTXN3-202ENST00000395322 PLCB3Q01970 1234 aa11.65□□□□□ -0.54
CTXN3-202ENST00000395322 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
CTXN3-202ENST00000395322 SMTNL2Q2TAL5 461 aa11.65□□□□□ -0.54
CTXN3-202ENST00000395322 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa11.65□□□□□ -0.54
CTXN3-202ENST00000395322 AGMOQ6ZNB7 445 aa11.65□□□□□ -0.54
CTXN3-202ENST00000395322 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
CTXN3-202ENST00000395322 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa11.65□□□□□ -0.54
CTXN3-202ENST00000395322 GSTCDQ8NEC7 633 aa11.65□□□□□ -0.54
CTXN3-202ENST00000395322 ANKK1Q8NFD2 765 aa11.65□□□□□ -0.54
CTXN3-202ENST00000395322 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
CTXN3-202ENST00000395322 PIK3R5Q8WYR1 880 aa11.65□□□□□ -0.54
CTXN3-202ENST00000395322 DUSP16Q9BY84 665 aa11.65□□□□□ -0.54
CTXN3-202ENST00000395322 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
CTXN3-202ENST00000395322 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
CTXN3-202ENST00000395322 RNF19AQ9NV58 838 aa11.65□□□□□ -0.54
CTXN3-202ENST00000395322 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
CTXN3-202ENST00000395322 PCSK1NQ9UHG2 260 aa11.65□□□□□ -0.54
CTXN3-202ENST00000395322 DSEQ9UL01 958 aa11.65□□□□□ -0.54
CTXN3-202ENST00000395322 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
CTXN3-202ENST00000395322 ZNF487B1APH4 448 aa11.64□□□□□ -0.55
CTXN3-202ENST00000395322 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa11.64□□□□□ -0.55
CTXN3-202ENST00000395322 PIK3R2O00459 728 aa11.64□□□□□ -0.55
CTXN3-202ENST00000395322 MCF2LO15068 1137 aa11.64□□□□□ -0.55
CTXN3-202ENST00000395322 MDM4O15151 490 aa11.64□□□□□ -0.55
CTXN3-202ENST00000395322 APOC2P02655 101 aa11.64□□□□□ -0.55
CTXN3-202ENST00000395322 INHAP05111 366 aa11.64□□□□□ -0.55
CTXN3-202ENST00000395322 FAM200BP0CF97 657 aa11.64□□□□□ -0.55
CTXN3-202ENST00000395322 CLCNKBP51801 687 aa11.64□□□□□ -0.55
CTXN3-202ENST00000395322 KRT81Q14533 505 aa11.64□□□□□ -0.55
CTXN3-202ENST00000395322 CDO1Q16878 200 aa11.64□□□□□ -0.55
CTXN3-202ENST00000395322 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
CTXN3-202ENST00000395322 CCDC14Q49A88 953 aa11.64□□□□□ -0.55
CTXN3-202ENST00000395322 KCNT1Q5JUK3 1230 aa11.64□□□□□ -0.55
CTXN3-202ENST00000395322 ZNF618Q5T7W0 954 aa11.64□□□□□ -0.55
CTXN3-202ENST00000395322 WSCD1Q658N2 575 aa11.64□□□□□ -0.55
CTXN3-202ENST00000395322 OSTM1Q86WC4 334 aa11.64□□□□□ -0.55
CTXN3-202ENST00000395322 METTL23Q86XA0 190 aa11.64□□□□□ -0.55
CTXN3-202ENST00000395322 RFX6Q8HWS3 928 aa11.64□□□□□ -0.55
CTXN3-202ENST00000395322 SCUBE3Q8IX30 993 aa11.64□□□□□ -0.55
CTXN3-202ENST00000395322 ALLCQ8N6M5 410 aa11.64□□□□□ -0.55
CTXN3-202ENST00000395322 FAM172AQ8WUF8 416 aa11.64□□□□□ -0.55
CTXN3-202ENST00000395322 KCTD13Q8WZ19 329 aa11.64□□□□□ -0.55
CTXN3-202ENST00000395322 HSPH1Q92598 858 aa11.64□□□□□ -0.55
CTXN3-202ENST00000395322 LPPQ93052 612 aa11.64□□□□□ -0.55
CTXN3-202ENST00000395322 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
CTXN3-202ENST00000395322 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa11.64□□□□□ -0.55
CTXN3-202ENST00000395322 ADAM2Q99965 735 aa11.64□□□□□ -0.55
CTXN3-202ENST00000395322 SYT15Q9BQS2 421 aa11.64□□□□□ -0.55
CTXN3-202ENST00000395322 MED10Q9BTT4 135 aa11.64□□□□□ -0.55
CTXN3-202ENST00000395322 CALN1Q9BXU9 219 aa11.64□□□□□ -0.55
CTXN3-202ENST00000395322 LRRC4Q9HBW1 653 aa11.64□□□□□ -0.55
CTXN3-202ENST00000395322 PCDH9Q9HC56 1237 aa11.64□□□□□ -0.55
CTXN3-202ENST00000395322 STARD7Q9NQZ5 370 aa11.64□□□□□ -0.55
CTXN3-202ENST00000395322 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP11.64□□□□□ -0.55
CTXN3-202ENST00000395322 ANAPC5Q9UJX4 755 aa11.64□□□□□ -0.55
CTXN3-202ENST00000395322 DNPEPQ9ULA0 475 aa11.64□□□□□ -0.55
CTXN3-202ENST00000395322 CDH9Q9ULB4 789 aa11.64□□□□□ -0.55
CTXN3-202ENST00000395322 NEU2Q9Y3R4 380 aa11.64□□□□□ -0.55
CTXN3-202ENST00000395322 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.4 ms