RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000378979.8

C20orf196-202, Transcript of Uncharacterized protein C20orf196, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene C20orf196, Length 585 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C20orf196-202ENST00000378979 KIF11P52732 1056 aa21.47■■□□□ 1.03
C20orf196-202ENST00000378979 SLC7A9P82251 487 aa21.47■■□□□ 1.03
C20orf196-202ENST00000378979 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
C20orf196-202ENST00000378979 ZNF852Q6ZMS4 543 aa21.47■■□□□ 1.03
C20orf196-202ENST00000378979 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa21.47■■□□□ 1.03
C20orf196-202ENST00000378979 TTC30AQ86WT1 665 aa21.47■■□□□ 1.03
C20orf196-202ENST00000378979 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP21.47■■□□□ 1.03
C20orf196-202ENST00000378979 MSANTD3Q96H12 275 aa21.47■■□□□ 1.03
C20orf196-202ENST00000378979 PRRX2Q99811 253 aa21.47■■□□□ 1.03
C20orf196-202ENST00000378979 NACA2Q9H009 215 aa21.47■■□□□ 1.03
C20orf196-202ENST00000378979 KCNH6Q9H252 994 aa21.47■■□□□ 1.03
C20orf196-202ENST00000378979 FANCLQ9NW38 375 aa21.47■■□□□ 1.03
C20orf196-202ENST00000378979 CNTN6Q9UQ52 1028 aa21.47■■□□□ 1.03
C20orf196-202ENST00000378979 KMT2EQ8IZD2 1858 aa21.46■■□□□ 1.03
C20orf196-202ENST00000378979 KANSL1LA0AUZ9 987 aa21.46■■□□□ 1.03
C20orf196-202ENST00000378979 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
C20orf196-202ENST00000378979 ARNTLO00327 626 aa21.46■■□□□ 1.03
C20orf196-202ENST00000378979 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
C20orf196-202ENST00000378979 OLFM2O95897 454 aa21.46■■□□□ 1.03
C20orf196-202ENST00000378979 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa21.46■■□□□ 1.03
C20orf196-202ENST00000378979 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
C20orf196-202ENST00000378979 PSEN1P49768 467 aa21.46■■□□□ 1.03
C20orf196-202ENST00000378979 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
C20orf196-202ENST00000378979 ZNF132P52740 706 aa21.46■■□□□ 1.03
C20orf196-202ENST00000378979 NUBP1P53384 320 aa21.46■■□□□ 1.03
C20orf196-202ENST00000378979 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
C20orf196-202ENST00000378979 USP4Q13107 963 aa21.46■■□□□ 1.03
C20orf196-202ENST00000378979 MTF1Q14872 753 aa21.46■■□□□ 1.03
C20orf196-202ENST00000378979 PDGFRLQ15198 375 aa21.46■■□□□ 1.03
C20orf196-202ENST00000378979 ZNF77Q15935 545 aa21.46■■□□□ 1.03
C20orf196-202ENST00000378979 CNGA2Q16280 664 aa21.46■■□□□ 1.03
C20orf196-202ENST00000378979 C1orf228Q6PIY5 440 aa21.46■■□□□ 1.03
C20orf196-202ENST00000378979 LCLAT1Q6UWP7 414 aa21.46■■□□□ 1.03
C20orf196-202ENST00000378979 CCDC186Q7Z3E2 898 aa21.46■■□□□ 1.03
C20orf196-202ENST00000378979 PIGZQ86VD9 579 aa21.46■■□□□ 1.03
C20orf196-202ENST00000378979 SH3RF2Q8TEC5 729 aa21.46■■□□□ 1.03
C20orf196-202ENST00000378979 ZFYVE19Q96K21 471 aa21.46■■□□□ 1.03
C20orf196-202ENST00000378979 NELL2Q99435 816 aa21.46■■□□□ 1.03
C20orf196-202ENST00000378979 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
C20orf196-202ENST00000378979 GKN1Q9NS71 199 aa21.46■■□□□ 1.03
C20orf196-202ENST00000378979 TAB2Q9NYJ8 693 aa21.46■■□□□ 1.03
C20orf196-202ENST00000378979 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP21.46■■□□□ 1.03
C20orf196-202ENST00000378979 PIAS3Q9Y6X2 628 aa21.46■■□□□ 1.03
C20orf196-202ENST00000378979 COL4A2P08572 1712 aa21.46■■□□□ 1.03
C20orf196-202ENST00000378979 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
C20orf196-202ENST00000378979 CYP26A1O43174 497 aa21.45■■□□□ 1.02
C20orf196-202ENST00000378979 MED7O43513 233 aa21.45■■□□□ 1.02
C20orf196-202ENST00000378979 USP8P40818 1118 aa21.45■■□□□ 1.02
C20orf196-202ENST00000378979 VCPP55072 806 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
C20orf196-202ENST00000378979 PDE4CQ08493 712 aa21.45■■□□□ 1.02
C20orf196-202ENST00000378979 ARHGAP44Q17R89 818 aa21.45■■□□□ 1.02
C20orf196-202ENST00000378979 ANO6Q4KMQ2 910 aa21.45■■□□□ 1.02
C20orf196-202ENST00000378979 FKBP15Q5T1M5 1219 aa21.45■■□□□ 1.02
C20orf196-202ENST00000378979 IER5LQ5T953 404 aa21.45■■□□□ 1.02
C20orf196-202ENST00000378979 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
C20orf196-202ENST00000378979 RNF38Q9H0F5 515 aa21.45■■□□□ 1.02
C20orf196-202ENST00000378979 LRRC4Q9HBW1 653 aa21.45■■□□□ 1.02
C20orf196-202ENST00000378979 SIT1Q9Y3P8 196 aa21.45■■□□□ 1.02
C20orf196-202ENST00000378979 CPQQ9Y646 472 aa21.45■■□□□ 1.02
C20orf196-202ENST00000378979 M0QYV0 167 aa21.44■■□□□ 1.02
C20orf196-202ENST00000378979 COCHO43405 550 aa21.44■■□□□ 1.02
C20orf196-202ENST00000378979 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
C20orf196-202ENST00000378979 BRD2P25440 801 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
C20orf196-202ENST00000378979 IFNAR2P48551 515 aa21.44■■□□□ 1.02
C20orf196-202ENST00000378979 UBXN2BQ14CS0 331 aa21.44■■□□□ 1.02
C20orf196-202ENST00000378979 KRT31Q15323 416 aa21.44■■□□□ 1.02
C20orf196-202ENST00000378979 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
C20orf196-202ENST00000378979 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa21.44■■□□□ 1.02
C20orf196-202ENST00000378979 GJB7Q6PEY0 223 aa21.44■■□□□ 1.02
C20orf196-202ENST00000378979 TADA2BQ86TJ2 420 aa21.44■■□□□ 1.02
C20orf196-202ENST00000378979 ARHGAP18Q8N392 663 aa21.44■■□□□ 1.02
C20orf196-202ENST00000378979 AOPEPQ8N6M6 819 aa21.44■■□□□ 1.02
C20orf196-202ENST00000378979 KIAA1958Q8N8K9 716 aa21.44■■□□□ 1.02
C20orf196-202ENST00000378979 TMEM105Q8N8V8 129 aa21.44■■□□□ 1.02
C20orf196-202ENST00000378979 PJA1Q8NG27 643 aa21.44■■□□□ 1.02
C20orf196-202ENST00000378979 UBA3Q8TBC4 463 aa21.44■■□□□ 1.02
C20orf196-202ENST00000378979 OSCP1Q8WVF1 389 aa21.44■■□□□ 1.02
C20orf196-202ENST00000378979 TFAP2BQ92481 460 aa21.44■■□□□ 1.02
C20orf196-202ENST00000378979 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
C20orf196-202ENST00000378979 FAM83CQ9BQN1 747 aa21.44■■□□□ 1.02
C20orf196-202ENST00000378979 BPIFA3Q9BQP9 254 aa21.44■■□□□ 1.02
C20orf196-202ENST00000378979 OSBPL6Q9BZF3 934 aa21.44■■□□□ 1.02
C20orf196-202ENST00000378979 VPS16Q9H269 839 aa21.44■■□□□ 1.02
C20orf196-202ENST00000378979 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
C20orf196-202ENST00000378979 USP3Q9Y6I4 520 aa21.44■■□□□ 1.02
C20orf196-202ENST00000378979 SMTNL1A8MU46 457 aa21.43■■□□□ 1.02
C20orf196-202ENST00000378979 LEFTY2O00292 366 aa21.43■■□□□ 1.02
C20orf196-202ENST00000378979 NCAM2O15394 837 aa21.43■■□□□ 1.02
C20orf196-202ENST00000378979 TLR5O60602 858 aa21.43■■□□□ 1.02
C20orf196-202ENST00000378979 PLA2G4AP47712 749 aa21.43■■□□□ 1.02
C20orf196-202ENST00000378979 TKTL1P51854 596 aa21.43■■□□□ 1.02
C20orf196-202ENST00000378979 RUNX3Q13761 415 aa21.43■■□□□ 1.02
C20orf196-202ENST00000378979 RAB41Q5JT25 222 aa21.43■■□□□ 1.02
C20orf196-202ENST00000378979 SHC3Q92529 594 aa21.43■■□□□ 1.02
C20orf196-202ENST00000378979 ATP2A3Q93084 1043 aa21.43■■□□□ 1.02
C20orf196-202ENST00000378979 FOXQ1Q9C009 403 aa21.43■■□□□ 1.02
C20orf196-202ENST00000378979 CCSER2Q9H7U1 834 aa21.43■■□□□ 1.02
C20orf196-202ENST00000378979 LTB4R2Q9NPC1 389 aa21.43■■□□□ 1.02
C20orf196-202ENST00000378979 SIX2Q9NPC8 291 aa21.43■■□□□ 1.02
C20orf196-202ENST00000378979 CYLDQ9NQC7 956 aa21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36 ms