RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000378543.2

FAAP20-201, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 2

Gene FAAP20, Length 569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-201ENST00000378543 AMPD2Q01433 879 aa24.92■■□□□ 1.58
FAAP20-201ENST00000378543 DMWDQ09019 674 aa24.92■■□□□ 1.58
FAAP20-201ENST00000378543 INCA1Q0VD86 236 aa24.92■■□□□ 1.58
FAAP20-201ENST00000378543 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP24.92■■□□□ 1.58
FAAP20-201ENST00000378543 PKN3Q6P5Z2 889 aa24.92■■□□□ 1.58
FAAP20-201ENST00000378543 ATP2A3Q93084 1043 aa24.92■■□□□ 1.58
FAAP20-201ENST00000378543 SMOQ99835 787 aa24.92■■□□□ 1.58
FAAP20-201ENST00000378543 HINFPQ9BQA5 517 aa24.92■■□□□ 1.58
FAAP20-201ENST00000378543 CYP3A43Q9HB55 503 aa24.92■■□□□ 1.58
FAAP20-201ENST00000378543 FAM49BQ9NUQ9 324 aa24.92■■□□□ 1.58
FAAP20-201ENST00000378543 IL37Q9NZH6 218 aa24.92■■□□□ 1.58
FAAP20-201ENST00000378543 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
FAAP20-201ENST00000378543 ZNF292O60281 2723 aa24.92■■□□□ 1.58
FAAP20-201ENST00000378543 SPTBN4Q9H254 2564 aa24.91■■□□□ 1.58
FAAP20-201ENST00000378543 EGFP01133 1207 aa24.91■■□□□ 1.58
FAAP20-201ENST00000378543 TTC39CQ8N584 583 aa24.91■■□□□ 1.58
FAAP20-201ENST00000378543 PDZD8Q8NEN9 1154 aa24.91■■□□□ 1.58
FAAP20-201ENST00000378543 SMPD4Q9NXE4 827 aa24.91■■□□□ 1.58
FAAP20-201ENST00000378543 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
FAAP20-201ENST00000378543 MYO16Q9Y6X6 1858 aa24.91■■□□□ 1.58
FAAP20-201ENST00000378543 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa24.9■■□□□ 1.58
FAAP20-201ENST00000378543 FNTBP49356 437 aa24.9■■□□□ 1.58
FAAP20-201ENST00000378543 MXI1P50539 228 aa24.9■■□□□ 1.58
FAAP20-201ENST00000378543 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa24.9■■□□□ 1.58
FAAP20-201ENST00000378543 FBXL13Q8NEE6 735 aa24.9■■□□□ 1.58
FAAP20-201ENST00000378543 OVCA2Q8WZ82 227 aa24.9■■□□□ 1.58
FAAP20-201ENST00000378543 SEMA4DQ92854 862 aa24.9■■□□□ 1.58
FAAP20-201ENST00000378543 P2RY13Q9BPV8 354 aa24.9■■□□□ 1.58
FAAP20-201ENST00000378543 NIF3L1Q9GZT8 377 aa24.9■■□□□ 1.58
FAAP20-201ENST00000378543 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa24.9■■□□□ 1.58
FAAP20-201ENST00000378543 KIAA1468Q9P260 1216 aa24.9■■□□□ 1.58
FAAP20-201ENST00000378543 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
FAAP20-201ENST00000378543 MYOFQ9NZM1 2061 aa24.89■■□□□ 1.58
FAAP20-201ENST00000378543 CD58P19256 250 aa24.89■■□□□ 1.58
FAAP20-201ENST00000378543 ADORA2BP29275 332 aa24.89■■□□□ 1.58
FAAP20-201ENST00000378543 PMS1P54277 932 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.58
FAAP20-201ENST00000378543 MAP3K7CLP57077 242 aa24.89■■□□□ 1.58
FAAP20-201ENST00000378543 WHAMMQ8TF30 809 aa24.89■■□□□ 1.58
FAAP20-201ENST00000378543 NT5C1AQ9BXI3 368 aa24.89■■□□□ 1.58
FAAP20-201ENST00000378543 GMIPQ9P107 970 aa24.89■■□□□ 1.58
FAAP20-201ENST00000378543 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa24.89■■□□□ 1.57
FAAP20-201ENST00000378543 FAM92AA1XBS5 289 aa24.88■■□□□ 1.57
FAAP20-201ENST00000378543 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa24.88■■□□□ 1.57
FAAP20-201ENST00000378543 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
FAAP20-201ENST00000378543 RNF40O75150 1001 aa24.88■■□□□ 1.57
FAAP20-201ENST00000378543 CILPO75339 1184 aa24.88■■□□□ 1.57
FAAP20-201ENST00000378543 NFATC1O95644 943 aa24.88■■□□□ 1.57
FAAP20-201ENST00000378543 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
FAAP20-201ENST00000378543 DRD1P21728 446 aa24.88■■□□□ 1.57
FAAP20-201ENST00000378543 NR1H3Q13133 447 aa24.88■■□□□ 1.57
FAAP20-201ENST00000378543 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
FAAP20-201ENST00000378543 KIAA2013Q8IYS2 634 aa24.88■■□□□ 1.57
FAAP20-201ENST00000378543 CD101Q93033 1021 aa24.88■■□□□ 1.57
FAAP20-201ENST00000378543 CYFIP2Q96F07 1278 aa24.88■■□□□ 1.57
FAAP20-201ENST00000378543 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
FAAP20-201ENST00000378543 COMMD8Q9NX08 183 aa24.88■■□□□ 1.57
FAAP20-201ENST00000378543 NCDNQ9UBB6 729 aa24.88■■□□□ 1.57
FAAP20-201ENST00000378543 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa24.88■■□□□ 1.57
FAAP20-201ENST00000378543 COCHO43405 550 aa24.87■■□□□ 1.57
FAAP20-201ENST00000378543 GNA14O95837 355 aa24.87■■□□□ 1.57
FAAP20-201ENST00000378543 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa24.87■■□□□ 1.57
FAAP20-201ENST00000378543 FAM200BP0CF97 657 aa24.87■■□□□ 1.57
FAAP20-201ENST00000378543 CD44P16070 742 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
FAAP20-201ENST00000378543 BMP6P22004 513 aa24.87■■□□□ 1.57
FAAP20-201ENST00000378543 HECTD3Q5T447 861 aa24.87■■□□□ 1.57
FAAP20-201ENST00000378543 SNX30Q5VWJ9 437 aa24.87■■□□□ 1.57
FAAP20-201ENST00000378543 NELFBQ8WX92 580 aa24.87■■□□□ 1.57
FAAP20-201ENST00000378543 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
FAAP20-201ENST00000378543 CCSER2Q9H7U1 834 aa24.87■■□□□ 1.57
FAAP20-201ENST00000378543 RAB20Q9NX57 234 aa24.87■■□□□ 1.57
FAAP20-201ENST00000378543 CFAP97Q9P2B7 532 aa24.87■■□□□ 1.57
FAAP20-201ENST00000378543 COQ4Q9Y3A0 265 aa24.87■■□□□ 1.57
FAAP20-201ENST00000378543 TRIM49BA6NDI0 452 aa24.86■■□□□ 1.57
FAAP20-201ENST00000378543 PMM2O15305 246 aa24.86■■□□□ 1.57
FAAP20-201ENST00000378543 HRO43593 1189 aa24.86■■□□□ 1.57
FAAP20-201ENST00000378543 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
FAAP20-201ENST00000378543 PGFP49763 221 aa24.86■■□□□ 1.57
FAAP20-201ENST00000378543 PAK1Q13153 545 aa24.86■■□□□ 1.57
FAAP20-201ENST00000378543 GAB4Q2WGN9 574 aa24.86■■□□□ 1.57
FAAP20-201ENST00000378543 TCERG1LQ5VWI1 586 aa24.86■■□□□ 1.57
FAAP20-201ENST00000378543 ISM2Q6H9L7 571 aa24.86■■□□□ 1.57
FAAP20-201ENST00000378543 TTI2Q6NXR4 508 aa24.86■■□□□ 1.57
FAAP20-201ENST00000378543 CLEC20AQ6ZU45 233 aa24.86■■□□□ 1.57
FAAP20-201ENST00000378543 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa24.86■■□□□ 1.57
FAAP20-201ENST00000378543 LONP2Q86WA8 852 aa24.86■■□□□ 1.57
FAAP20-201ENST00000378543 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa24.86■■□□□ 1.57
FAAP20-201ENST00000378543 KIAA1958Q8N8K9 716 aa24.86■■□□□ 1.57
FAAP20-201ENST00000378543 EXOC4Q96A65 974 aa24.86■■□□□ 1.57
FAAP20-201ENST00000378543 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
FAAP20-201ENST00000378543 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
FAAP20-201ENST00000378543 HHLA1C9JL84 531 aa24.85■■□□□ 1.57
FAAP20-201ENST00000378543 CYP17A1P05093 508 aa24.85■■□□□ 1.57
FAAP20-201ENST00000378543 HOXA6P31267 233 aa24.85■■□□□ 1.57
FAAP20-201ENST00000378543 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
FAAP20-201ENST00000378543 LPAL2Q16609 132 aa24.85■■□□□ 1.57
FAAP20-201ENST00000378543 ZNF394Q53GI3 561 aa24.85■■□□□ 1.57
FAAP20-201ENST00000378543 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
FAAP20-201ENST00000378543 JAKMIP2Q96AA8 810 aa24.85■■□□□ 1.57
FAAP20-201ENST00000378543 GBP4Q96PP9 640 aa24.85■■□□□ 1.57
FAAP20-201ENST00000378543 BIN1O00499 593 aa24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.4 ms