RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375391.5

TMCO3-201, Transcript of transmembrane and coiled-coil domains 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TMCO3, Length 2,132 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO3-201ENST00000375391 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa21.32■■□□□ 1
TMCO3-201ENST00000375391 TMEM191CA6NGB0 347 aa21.32■■□□□ 1
TMCO3-201ENST00000375391 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
TMCO3-201ENST00000375391 MYBL1P10243 752 aa21.32■■□□□ 1
TMCO3-201ENST00000375391 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
TMCO3-201ENST00000375391 ATF2P15336 505 aa21.32■■□□□ 1
TMCO3-201ENST00000375391 SLC6A3Q01959 620 aa21.32■■□□□ 1
TMCO3-201ENST00000375391 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
TMCO3-201ENST00000375391 RHOT2Q8IXI1 618 aa21.32■■□□□ 1
TMCO3-201ENST00000375391 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa21.32■■□□□ 1
TMCO3-201ENST00000375391 KCTD13Q8WZ19 329 aa21.32■■□□□ 1
TMCO3-201ENST00000375391 DOCK6Q96HP0 2047 aa21.32■■□□□ 1
TMCO3-201ENST00000375391 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP21.32■■□□□ 11e-9■■■■■ 38.1
TMCO3-201ENST00000375391 CFAP57Q96MR6 1250 aa21.32■■□□□ 1
TMCO3-201ENST00000375391 KLHL5Q96PQ7 755 aa21.32■■□□□ 1
TMCO3-201ENST00000375391 PRO3102Q9H379 93 aa21.32■■□□□ 1
TMCO3-201ENST00000375391 SLC28A3Q9HAS3 691 aa21.32■■□□□ 1
TMCO3-201ENST00000375391 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa21.32■■□□□ 1
TMCO3-201ENST00000375391 TMEM59LQ9UK28 342 aa21.32■■□□□ 1
TMCO3-201ENST00000375391 NUDT5Q9UKK9 219 aa21.32■■□□□ 1
TMCO3-201ENST00000375391 DYNC1I1O14576 645 aa21.31■■□□□ 1
TMCO3-201ENST00000375391 RAB33AQ14088 237 aa21.31■■□□□ 1
TMCO3-201ENST00000375391 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
TMCO3-201ENST00000375391 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa21.31■■□□□ 1
TMCO3-201ENST00000375391 FAM149B1Q96BN6 582 aa21.31■■□□□ 1
TMCO3-201ENST00000375391 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
TMCO3-201ENST00000375391 RXFP1Q9HBX9 757 aa21.31■■□□□ 1
TMCO3-201ENST00000375391 SIGLEC16A6NMB1 481 aa21.31■■□□□ 1
TMCO3-201ENST00000375391 BMP8BP34820 402 aa21.31■■□□□ 1
TMCO3-201ENST00000375391 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
TMCO3-201ENST00000375391 SYPL2Q5VXT5 272 aa21.31■■□□□ 1
TMCO3-201ENST00000375391 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
TMCO3-201ENST00000375391 SPPL2BQ8TCT7 592 aa21.31■■□□□ 1
TMCO3-201ENST00000375391 EDEM1Q92611 657 aa21.31■■□□□ 1
TMCO3-201ENST00000375391 TRIM11Q96F44 468 aa21.31■■□□□ 1
TMCO3-201ENST00000375391 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
TMCO3-201ENST00000375391 MSRAQ9UJ68 235 aa21.31■■□□□ 1
TMCO3-201ENST00000375391 STRIP2Q9ULQ0 834 aa21.31■■□□□ 1
TMCO3-201ENST00000375391 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
TMCO3-201ENST00000375391 USTQ9Y2C2 406 aa21.31■■□□□ 1
TMCO3-201ENST00000375391 ALG6Q9Y672 507 aa21.31■■□□□ 1
TMCO3-201ENST00000375391 H3BNC9 293 aa21.3■■□□□ 1
TMCO3-201ENST00000375391 FYNP06241 537 aa21.3■■□□□ 1
TMCO3-201ENST00000375391 KLRC2P26717 231 aa21.3■■□□□ 1
TMCO3-201ENST00000375391 MARCKSL1P49006 195 aa21.3■■□□□ 1
TMCO3-201ENST00000375391 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
TMCO3-201ENST00000375391 VSTM1Q6UX27 236 aa21.3■■□□□ 1
TMCO3-201ENST00000375391 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa21.3■■□□□ 1
TMCO3-201ENST00000375391 OSER1Q9NX31 292 aa21.3■■□□□ 1
TMCO3-201ENST00000375391 UVRAGQ9P2Y5 699 aa21.3■■□□□ 1
TMCO3-201ENST00000375391 SRGAP2O75044 1071 aa21.29■■□□□ 1
TMCO3-201ENST00000375391 ZBED1O96006 694 aa21.29■■□□□ 1
TMCO3-201ENST00000375391 COMTP21964 271 aa21.29■■□□□ 1
TMCO3-201ENST00000375391 CXCR5P32302 372 aa21.29■■□□□ 1
TMCO3-201ENST00000375391 DAOAP59103 153 aa21.29■■□□□ 1
TMCO3-201ENST00000375391 ATP11AP98196 1134 aa21.29■■□□□ 1
TMCO3-201ENST00000375391 CDO1Q16878 200 aa21.29■■□□□ 1
TMCO3-201ENST00000375391 ADAM32Q8TC27 787 aa21.29■■□□□ 1
TMCO3-201ENST00000375391 RXFP2Q8WXD0 754 aa21.29■■□□□ 1
TMCO3-201ENST00000375391 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa21.29■■□□□ 1
TMCO3-201ENST00000375391 ATP8B3O60423 1300 aa21.29■■□□□ 1
TMCO3-201ENST00000375391 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP21.29■■□□□ 1
TMCO3-201ENST00000375391 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
TMCO3-201ENST00000375391 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa21.29■■□□□ 1
TMCO3-201ENST00000375391 ZMYND15Q9H091 742 aa21.29■■□□□ 1
TMCO3-201ENST00000375391 NMUR1Q9HB89 426 aa21.29■■□□□ 1
TMCO3-201ENST00000375391 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
TMCO3-201ENST00000375391 FNIP2Q9P278 1114 aa21.29■■□□□ 1
TMCO3-201ENST00000375391 LZTS1Q9Y250 596 aa21.29■■□□□ 1
TMCO3-201ENST00000375391 RWDD3Q9Y3V2 267 aa21.29■■□□□ 1
TMCO3-201ENST00000375391 USP3Q9Y6I4 520 aa21.29■■□□□ 1
TMCO3-201ENST00000375391 COL6A3P12111 3177 aa21.29■■□□□ 1
TMCO3-201ENST00000375391 MYO1FO00160 1098 aa21.28■■□□□ 1
TMCO3-201ENST00000375391 MTA2O94776 668 aa21.28■■□□□ 1
TMCO3-201ENST00000375391 ACADSBP45954 432 aa21.28■■□□□ 1
TMCO3-201ENST00000375391 KRT35Q92764 455 aa21.28■■□□□ 1
TMCO3-201ENST00000375391 C8orf48Q96LL4 319 aa21.28■■□□□ 1
TMCO3-201ENST00000375391 TLR10Q9BXR5 811 aa21.28■■□□□ 1
TMCO3-201ENST00000375391 ABCB6Q9NP58 842 aa21.28■■□□□ 1
TMCO3-201ENST00000375391 SCINQ9Y6U3 715 aa21.28■■□□□ 1
TMCO3-201ENST00000375391 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
TMCO3-201ENST00000375391 C2CD4BA6NLJ0 364 aa21.28■■□□□ 1
TMCO3-201ENST00000375391 PRRG1O14668 218 aa21.28■■□□□ 1
TMCO3-201ENST00000375391 RB1P06400 928 aa21.28■■□□□ 1
TMCO3-201ENST00000375391 PDGFRAP16234 1089 aa21.28■■□□□ 1
TMCO3-201ENST00000375391 MAGEA11P43364 429 aa21.28■■□□□ 1
TMCO3-201ENST00000375391 GSCP56915 257 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
TMCO3-201ENST00000375391 TWF1Q12792 350 aa21.28■■□□□ 1
TMCO3-201ENST00000375391 TCEAL1Q15170 157 aa21.28■■□□□ 1
TMCO3-201ENST00000375391 LLGL1Q15334 1064 aa21.28■■□□□ 1
TMCO3-201ENST00000375391 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa21.28■■□□□ 1
TMCO3-201ENST00000375391 NT5DC3Q86UY8 548 aa21.28■■□□□ 1
TMCO3-201ENST00000375391 DEFB106AQ8N104 65 aa21.28■■□□□ 1
TMCO3-201ENST00000375391 NUP93Q8N1F7 819 aa21.28■■□□□ 1
TMCO3-201ENST00000375391 TXLNBQ8N3L3 684 aa21.28■■□□□ 1
TMCO3-201ENST00000375391 MSANTD4Q8NCY6 345 aa21.28■■□□□ 1
TMCO3-201ENST00000375391 TRIM58Q8NG06 486 aa21.28■■□□□ 1
TMCO3-201ENST00000375391 SLC7A14Q8TBB6 771 aa21.28■■□□□ 1
TMCO3-201ENST00000375391 TIFAQ96CG3 184 aa21.28■■□□□ 1
TMCO3-201ENST00000375391 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.3 ms