RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368547.3

ECHS1-201, Transcript of enoyl-CoA hydratase, short chain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHS1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1-201ENST00000368547 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP31.12■■■□□ 2.57
ECHS1-201ENST00000368547 TMEM110Q86TL2 294 aa31.12■■■□□ 2.57
ECHS1-201ENST00000368547 DNAAF5Q86Y56 855 aa31.12■■■□□ 2.57
ECHS1-201ENST00000368547 ELMOD1Q8N336 334 aa31.12■■■□□ 2.57
ECHS1-201ENST00000368547 PSMG2Q969U7 264 aa31.12■■■□□ 2.57
ECHS1-201ENST00000368547 SYNCQ9H7C4 482 aa31.12■■■□□ 2.57
ECHS1-201ENST00000368547 CYLDQ9NQC7 956 aa31.12■■■□□ 2.57
ECHS1-201ENST00000368547 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP31.12■■■□□ 2.57
ECHS1-201ENST00000368547 ASB3Q9Y575 518 aa31.12■■■□□ 2.57
ECHS1-201ENST00000368547 MYO16Q9Y6X6 1858 aa31.12■■■□□ 2.57
ECHS1-201ENST00000368547 MMP8P22894 467 aa31.11■■■□□ 2.57
ECHS1-201ENST00000368547 ACADSBP45954 432 aa31.11■■■□□ 2.57
ECHS1-201ENST00000368547 C2CD6Q53TS8 623 aa31.11■■■□□ 2.57
ECHS1-201ENST00000368547 CCDC122Q5T0U0 273 aa31.11■■■□□ 2.57
ECHS1-201ENST00000368547 ANKRD54Q6NXT1 300 aa31.11■■■□□ 2.57
ECHS1-201ENST00000368547 ITIH5Q86UX2 942 aa31.11■■■□□ 2.57
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP31.11■■■□□ 2.57
ECHS1-201ENST00000368547 PRKD2Q9BZL6 878 aa31.11■■■□□ 2.57
ECHS1-201ENST00000368547 EYSQ5T1H1 3165 aa31.11■■■□□ 2.57
ECHS1-201ENST00000368547 PJA2O43164 708 aa31.1■■■□□ 2.57
ECHS1-201ENST00000368547 KRT86O43790 486 aa31.1■■■□□ 2.57
ECHS1-201ENST00000368547 RTN2O75298 545 aa31.1■■■□□ 2.57
ECHS1-201ENST00000368547 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP31.1■■■□□ 2.57
ECHS1-201ENST00000368547 ERBB2P04626 1255 aa31.1■■■□□ 2.57
ECHS1-201ENST00000368547 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP31.1■■■□□ 2.57
ECHS1-201ENST00000368547 MAGEA1P43355 309 aa31.1■■■□□ 2.57
ECHS1-201ENST00000368547 COL19A1Q14993 1142 aa31.1■■■□□ 2.57
ECHS1-201ENST00000368547 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa31.1■■■□□ 2.57
ECHS1-201ENST00000368547 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP31.1■■■□□ 2.57
ECHS1-201ENST00000368547 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa31.1■■■□□ 2.57
ECHS1-201ENST00000368547 MSANTD4Q8NCY6 345 aa31.1■■■□□ 2.57
ECHS1-201ENST00000368547 FEZF2Q8TBJ5 459 aa31.1■■■□□ 2.57
ECHS1-201ENST00000368547 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP31.1■■■□□ 2.57
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP31.1■■■□□ 2.57
ECHS1-201ENST00000368547 C11orf70Q9BRQ4 267 aa31.1■■■□□ 2.57
ECHS1-201ENST00000368547 CLEC1BQ9P126 229 aa31.1■■■□□ 2.57
ECHS1-201ENST00000368547 MYO1AQ9UBC5 1043 aa31.1■■■□□ 2.57
ECHS1-201ENST00000368547 XYLBO75191 536 aa31.09■■■□□ 2.57
ECHS1-201ENST00000368547 TBX10O75333 385 aa31.09■■■□□ 2.57
ECHS1-201ENST00000368547 FTLP02792 175 aaPredicted RBP31.09■■■□□ 2.57
ECHS1-201ENST00000368547 ETF1P62495 437 aaKnown RBP31.09■■■□□ 2.57
ECHS1-201ENST00000368547 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP31.09■■■□□ 2.57
ECHS1-201ENST00000368547 TMC5Q6UXY8 1006 aa31.09■■■□□ 2.57
ECHS1-201ENST00000368547 SCUBE3Q8IX30 993 aa31.09■■■□□ 2.57
ECHS1-201ENST00000368547 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP31.09■■■□□ 2.57
ECHS1-201ENST00000368547 MIS12Q9H081 205 aa31.09■■■□□ 2.57
ECHS1-201ENST00000368547 ISCUQ9H1K1 167 aa31.09■■■□□ 2.57
ECHS1-201ENST00000368547 LZTFL1Q9NQ48 299 aa31.09■■■□□ 2.57
ECHS1-201ENST00000368547 IL37Q9NZH6 218 aa31.09■■■□□ 2.57
ECHS1-201ENST00000368547 USP3Q9Y6I4 520 aa31.09■■■□□ 2.57
ECHS1-201ENST00000368547 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP31.09■■■□□ 2.57
ECHS1-201ENST00000368547 KIF5AQ12840 1032 aa31.09■■■□□ 2.57
ECHS1-201ENST00000368547 CYP4A22Q5TCH4 519 aa31.09■■■□□ 2.57
ECHS1-201ENST00000368547 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa31.09■■■□□ 2.57
ECHS1-201ENST00000368547 MON1BQ7L1V2 547 aa31.09■■■□□ 2.57
ECHS1-201ENST00000368547 C18orf8Q96DM3 657 aa31.09■■■□□ 2.57
ECHS1-201ENST00000368547 TTLL2Q9BWV7 592 aa31.09■■■□□ 2.57
ECHS1-201ENST00000368547 ULBP1Q9BZM6 244 aa31.09■■■□□ 2.57
ECHS1-201ENST00000368547 FBXO44Q9H4M3 255 aa31.09■■■□□ 2.57
ECHS1-201ENST00000368547 ADAM22Q9P0K1 906 aa31.09■■■□□ 2.57
ECHS1-201ENST00000368547 USP17L7P0C7H9 530 aa31.08■■■□□ 2.57
ECHS1-201ENST00000368547 YWHAQP27348 245 aa31.08■■■□□ 2.57
ECHS1-201ENST00000368547 GABRB2P47870 512 aa31.08■■■□□ 2.57
ECHS1-201ENST00000368547 SNX16P57768 344 aa31.08■■■□□ 2.57
ECHS1-201ENST00000368547 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP31.08■■■□□ 2.57
ECHS1-201ENST00000368547 SYCE2Q6PIF2 218 aa31.08■■■□□ 2.57
ECHS1-201ENST00000368547 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP31.08■■■□□ 2.57
ECHS1-201ENST00000368547 APOL5Q9BWW9 433 aa31.08■■■□□ 2.57
ECHS1-201ENST00000368547 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa31.08■■■□□ 2.57
ECHS1-201ENST00000368547 COMMD8Q9NX08 183 aa31.08■■■□□ 2.57
ECHS1-201ENST00000368547 EHD2Q9NZN4 543 aa31.08■■■□□ 2.57
ECHS1-201ENST00000368547 C2orf16Q68DN1 1984 aa31.08■■■□□ 2.57
ECHS1-201ENST00000368547 PAPLNO95428 1278 aa31.07■■■□□ 2.56
ECHS1-201ENST00000368547 LTBRP36941 435 aa31.07■■■□□ 2.56
ECHS1-201ENST00000368547 PTP4A2Q12974 167 aa31.07■■■□□ 2.56
ECHS1-201ENST00000368547 MCOLN2Q8IZK6 566 aa31.07■■■□□ 2.56
ECHS1-201ENST00000368547 CLEC4CQ8WTT0 213 aa31.07■■■□□ 2.56
ECHS1-201ENST00000368547 PPM1EQ8WY54 764 aa31.07■■■□□ 2.56
ECHS1-201ENST00000368547 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP31.07■■■□□ 2.56
ECHS1-201ENST00000368547 MYRFLQ96LU7 910 aa31.07■■■□□ 2.56
ECHS1-201ENST00000368547 CORO1BQ9BR76 489 aa31.07■■■□□ 2.56
ECHS1-201ENST00000368547 CNGB3Q9NQW8 809 aa31.07■■■□□ 2.56
ECHS1-201ENST00000368547 DOCK6Q96HP0 2047 aa31.06■■■□□ 2.56
ECHS1-201ENST00000368547 A0A0U1RQJ8 604 aa31.06■■■□□ 2.56
ECHS1-201ENST00000368547 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP31.06■■■□□ 2.56
ECHS1-201ENST00000368547 KIF5CO60282 957 aa31.06■■■□□ 2.56
ECHS1-201ENST00000368547 ZBED1O96006 694 aa31.06■■■□□ 2.56
ECHS1-201ENST00000368547 POU2F2P09086 479 aa31.06■■■□□ 2.56
ECHS1-201ENST00000368547 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP31.06■■■□□ 2.56
ECHS1-201ENST00000368547 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP31.06■■■□□ 2.56
ECHS1-201ENST00000368547 HS6ST3Q8IZP7 471 aa31.06■■■□□ 2.56
ECHS1-201ENST00000368547 ATRIPQ8WXE1 791 aa31.06■■■□□ 2.56
ECHS1-201ENST00000368547 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP31.06■■■□□ 2.56
ECHS1-201ENST00000368547 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP31.06■■■□□ 2.56
ECHS1-201ENST00000368547 PIDD1Q9HB75 910 aa31.06■■■□□ 2.56
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP31.06■■■□□ 2.56
ECHS1-201ENST00000368547 INTUQ9ULD6 942 aa31.06■■■□□ 2.56
ECHS1-201ENST00000368547 FAM92AA1XBS5 289 aa31.06■■■□□ 2.56
ECHS1-201ENST00000368547 RCCD1A6NED2 376 aa31.06■■■□□ 2.56
ECHS1-201ENST00000368547 PTPN2P17706 415 aa31.06■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70.9 ms