RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000354662.5

LMO3-204, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene LMO3, Length 3,574 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-204ENST00000354662 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
LMO3-204ENST00000354662 SMU1Q2TAY7 513 aa8.56□□□□□ -1.04
LMO3-204ENST00000354662 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa8.56□□□□□ -1.04
LMO3-204ENST00000354662 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
LMO3-204ENST00000354662 JAMLQ86YT9 394 aa8.56□□□□□ -1.04
LMO3-204ENST00000354662 FBXL6Q8N531 539 aa8.56□□□□□ -1.04
LMO3-204ENST00000354662 SLAIN1Q8ND83 568 aa8.56□□□□□ -1.04
LMO3-204ENST00000354662 TSPAN14Q8NG11 270 aa8.56□□□□□ -1.04
LMO3-204ENST00000354662 ZFPM2Q8WW38 1151 aa8.56□□□□□ -1.04
LMO3-204ENST00000354662 CEP170P1Q96L14 293 aa8.56□□□□□ -1.04
LMO3-204ENST00000354662 ZBED2Q9BTP6 218 aa8.56□□□□□ -1.04
LMO3-204ENST00000354662 PI4KBQ9UBF8 816 aa8.56□□□□□ -1.04
LMO3-204ENST00000354662 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
LMO3-204ENST00000354662 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa8.56□□□□□ -1.04
LMO3-204ENST00000354662 NENFQ9UMX5 172 aa8.56□□□□□ -1.04
LMO3-204ENST00000354662 AP3M1Q9Y2T2 418 aa8.56□□□□□ -1.04
LMO3-204ENST00000354662 PI4KAP2A4QPH2 592 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-204ENST00000354662 C2orf81A6NN90 581 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-204ENST00000354662 hCG_2039718K7EN88 272 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-204ENST00000354662 CIAO1O76071 339 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-204ENST00000354662 BAG2O95816 211 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-204ENST00000354662 RPN1P04843 607 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
LMO3-204ENST00000354662 SRGAP2BP0DMP2 458 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-204ENST00000354662 RRM2P31350 389 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-204ENST00000354662 TTKP33981 857 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-204ENST00000354662 EVI2BP34910 448 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-204ENST00000354662 CASP5P51878 434 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-204ENST00000354662 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
LMO3-204ENST00000354662 CTBSQ01459 385 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-204ENST00000354662 RAD51Q06609 339 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-204ENST00000354662 GCKRQ14397 625 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-204ENST00000354662 TBCCQ15814 346 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-204ENST00000354662 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-204ENST00000354662 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
LMO3-204ENST00000354662 GALNT4Q8N4A0 578 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-204ENST00000354662 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-204ENST00000354662 VPS33AQ96AX1 596 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-204ENST00000354662 DCUN1D1Q96GG9 259 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-204ENST00000354662 TRIM47Q96LD4 638 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-204ENST00000354662 CCDC77Q9BR77 488 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-204ENST00000354662 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
LMO3-204ENST00000354662 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
LMO3-204ENST00000354662 PCDHGB4Q9UN71 923 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-204ENST00000354662 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
LMO3-204ENST00000354662 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-204ENST00000354662 ATRNO75882 1429 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-204ENST00000354662 ITGB3P05106 788 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-204ENST00000354662 CASP1P29466 404 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-204ENST00000354662 GRIK1P39086 918 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-204ENST00000354662 PPP1R2P41236 205 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-204ENST00000354662 CENPAP49450 140 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-204ENST00000354662 PLTPP55058 493 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-204ENST00000354662 STX3Q13277 289 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-204ENST00000354662 DSC3Q14574 896 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-204ENST00000354662 LONRF1Q17RB8 773 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-204ENST00000354662 CAVIN4Q5BKX8 364 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-204ENST00000354662 NEK5Q6P3R8 708 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-204ENST00000354662 APOA5Q6Q788 366 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-204ENST00000354662 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
LMO3-204ENST00000354662 TAS2R42Q7RTR8 314 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-204ENST00000354662 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
LMO3-204ENST00000354662 RELL1Q8IUW5 271 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-204ENST00000354662 CAPSLQ8WWF8 208 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-204ENST00000354662 NLRP7Q8WX94 980 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-204ENST00000354662 MTBPQ96DY7 904 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-204ENST00000354662 THAP11Q96EK4 314 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-204ENST00000354662 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
LMO3-204ENST00000354662 WNK4Q96J92 1243 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-204ENST00000354662 SPOCK3Q9BQ16 436 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-204ENST00000354662 BOLA2Q9H3K6 86 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-204ENST00000354662 DPEP3Q9H4B8 488 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-204ENST00000354662 KCNK13Q9HB14 408 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-204ENST00000354662 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-204ENST00000354662 GDAP2Q9NXN4 497 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-204ENST00000354662 TMEM9Q9P0T7 183 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-204ENST00000354662 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
LMO3-204ENST00000354662 MKL2Q9ULH7 1088 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-204ENST00000354662 POLHQ9Y253 713 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-204ENST00000354662 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-204ENST00000354662 DTNAQ9Y4J8 743 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-204ENST00000354662 TRAF6Q9Y4K3 522 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-204ENST00000354662 CORINQ9Y5Q5 1042 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-204ENST00000354662 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
LMO3-204ENST00000354662 A0A087WZG4 1122 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-204ENST00000354662 EPHB6O15197 1021 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-204ENST00000354662 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
LMO3-204ENST00000354662 CDH16O75309 829 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-204ENST00000354662 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
LMO3-204ENST00000354662 PHC1P78364 1004 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-204ENST00000354662 GALK2Q01415 458 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-204ENST00000354662 AMPD3Q01432 767 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-204ENST00000354662 SP140Q13342 867 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-204ENST00000354662 FAM205BPQ63HN1 556 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-204ENST00000354662 PGM2L1Q6PCE3 622 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-204ENST00000354662 IGFN1Q86VF2 1251 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-204ENST00000354662 CLYBLQ8N0X4 340 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-204ENST00000354662 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-204ENST00000354662 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
LMO3-204ENST00000354662 TMIGD2Q96BF3 282 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-204ENST00000354662 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.7 ms