RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000349984.6

CCR6-202, Transcript of C-C motif chemokine receptor 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCR6, Length 2,980 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR6-202ENST00000349984 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP7.55□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 ANO4Q32M45 955 aa7.55□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 C8orf74Q6P047 294 aa7.55□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 UNC5DQ6UXZ4 953 aa7.55□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa7.55□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 ELMOD1Q8N336 334 aa7.55□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 AADATQ8N5Z0 425 aa7.55□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa7.55□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 MAML1Q92585 1016 aa7.55□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 ABCG4Q9H172 646 aa7.55□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 RIC8AQ9NPQ8 531 aa7.55□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 GMIPQ9P107 970 aa7.55□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa7.55□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 TANC1Q9C0D5 1861 aa7.55□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 KAT6AQ92794 2004 aa7.55□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 TTC26A0AVF1 554 aa7.55□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 ANO9A1A5B4 782 aa7.55□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa7.55□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 VILLO15195 856 aa7.55□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 KRT75O95678 551 aa7.55□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 OAS1P00973 400 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 GH1P01241 217 aa7.55□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 SHBGP04278 402 aa7.55□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 MYOGP15173 224 aa7.55□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 M6PRP20645 277 aa7.55□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 PBX2P40425 430 aa7.55□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 CBX5P45973 191 aa7.55□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 CARSP49589 748 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 CLK2P49760 499 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 UBXN1Q04323 297 aa7.55□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 ACAP1Q15027 740 aa7.55□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 WDR72Q3MJ13 1102 aa7.55□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 HAUS3Q68CZ6 603 aa7.55□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 BEND5Q7L4P6 421 aa7.55□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 OTOP2Q7RTS6 562 aa7.55□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 CARNMT1Q8N4J0 409 aa7.55□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 FAM13CQ8NE31 585 aa7.55□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 SH2D3AQ9BRG2 576 aa7.55□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 C16orf70Q9BSU1 422 aa7.55□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 RNPEPQ9H4A4 650 aa7.55□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 MLXIPQ9HAP2 919 aa7.55□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 UBN1Q9NPG3 1134 aa7.55□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 C8orf4Q9NR00 106 aa7.55□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa7.55□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 SNX12Q9UMY4 172 aa7.55□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 CTNND2Q9UQB3 1225 aa7.55□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa7.55□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 EVPLQ92817 2033 aa7.54□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 GOLGA8JA6NMD2 632 aa7.54□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 OR5K4A6NMS3 321 aa7.54□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa7.54□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 H0YC42 278 aa7.54□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 MAP3K6O95382 1288 aa7.54□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 EVI2BP34910 448 aa7.54□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 CPT1AP50416 773 aa7.54□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 SP140Q13342 867 aa7.54□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 TRIM14Q14142 442 aa7.54□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 TMEM266Q2M3C6 531 aa7.54□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 USP49Q70CQ1 688 aa7.54□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 SATL1Q86VE3 508 aa7.54□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 TDHQ8IZJ6 230 aa7.54□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP7.54□□□□□ -1.21e-10■■■■■ 29.4
CCR6-202ENST00000349984 NRG4Q8WWG1 115 aa7.54□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 HIPK3Q9H422 1215 aa7.54□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 PLGRKTQ9HBL7 147 aa7.54□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 WDFY4Q6ZS81 3184 aa7.54□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 SMIM23A6NLE4 172 aa7.54□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 DCDC2CA8MYV0 355 aa7.54□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 SNX3O60493 162 aa7.54□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 OR6B1O95007 311 aa7.54□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 UNC5CO95185 931 aa7.54□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 TSPAN7P41732 249 aa7.54□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 COPB1P53618 953 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 PLCB3Q01970 1234 aa7.54□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 CYP27A1Q02318 531 aa7.54□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 AP1B1Q10567 949 aa7.54□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 NR5A1Q13285 461 aa7.54□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 MTMR1Q13613 665 aa7.54□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 GPNMBQ14956 572 aa7.54□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 KCNJ8Q15842 424 aa7.54□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 DENND2CQ68D51 928 aa7.54□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 PDZD8Q8NEN9 1154 aa7.54□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.3 ms