RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345425.6

GIPC1-201, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GIPC1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-201ENST00000345425 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa29.21■■■□□ 2.27
GIPC1-201ENST00000345425 ZNF263O14978 683 aa29.21■■■□□ 2.27
GIPC1-201ENST00000345425 SART1O43290 800 aaKnown RBP29.21■■■□□ 2.27
GIPC1-201ENST00000345425 ZBED1O96006 694 aa29.21■■■□□ 2.27
GIPC1-201ENST00000345425 MYBL1P10243 752 aa29.21■■■□□ 2.27
GIPC1-201ENST00000345425 USP46P62068 366 aa29.21■■■□□ 2.27
GIPC1-201ENST00000345425 KRT83P78385 493 aa29.21■■■□□ 2.27
GIPC1-201ENST00000345425 PTP4A2Q12974 167 aa29.21■■■□□ 2.27
GIPC1-201ENST00000345425 MYRFLQ96LU7 910 aa29.21■■■□□ 2.27
GIPC1-201ENST00000345425 KCNF1Q9H3M0 494 aa29.21■■■□□ 2.27
GIPC1-201ENST00000345425 ANKRD62A6NC57 917 aa29.21■■■□□ 2.27
GIPC1-201ENST00000345425 PAPLNO95428 1278 aa29.21■■■□□ 2.27
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GIPC1-201ENST00000345425 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP29.21■■■□□ 2.27
GIPC1-201ENST00000345425 CTC1Q2NKJ3 1217 aa29.21■■■□□ 2.27
GIPC1-201ENST00000345425 CYP4A22Q5TCH4 519 aa29.21■■■□□ 2.27
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GIPC1-201ENST00000345425 ANKRD54Q6NXT1 300 aa29.21■■■□□ 2.27
GIPC1-201ENST00000345425 SCUBE3Q8IX30 993 aa29.21■■■□□ 2.27
GIPC1-201ENST00000345425 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP29.21■■■□□ 2.27
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GIPC1-201ENST00000345425 FAM92AA1XBS5 289 aa29.2■■■□□ 2.26
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GIPC1-201ENST00000345425 C2CD6Q53TS8 623 aa29.2■■■□□ 2.26
GIPC1-201ENST00000345425 PM20D1Q6GTS8 502 aa29.2■■■□□ 2.26
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GIPC1-201ENST00000345425 H2AFVQ71UI9 128 aa29.2■■■□□ 2.26
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GIPC1-201ENST00000345425 COL19A1Q14993 1142 aa29.19■■■□□ 2.26
GIPC1-201ENST00000345425 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa29.19■■■□□ 2.26
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GIPC1-201ENST00000345425 IRGQQ8WZA9 623 aa29.19■■■□□ 2.26
GIPC1-201ENST00000345425 ZNF653Q96CK0 615 aa29.19■■■□□ 2.26
GIPC1-201ENST00000345425 INTUQ9ULD6 942 aa29.19■■■□□ 2.26
GIPC1-201ENST00000345425 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP29.19■■■□□ 2.26
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GIPC1-201ENST00000345425 ABCB4P21439 1286 aa29.18■■■□□ 2.26
GIPC1-201ENST00000345425 GALCP54803 685 aa29.18■■■□□ 2.26
GIPC1-201ENST00000345425 DAOAP59103 153 aa29.18■■■□□ 2.26
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GIPC1-201ENST00000345425 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa29.18■■■□□ 2.26
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GIPC1-201ENST00000345425 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP29.18■■■□□ 2.26
GIPC1-201ENST00000345425 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP29.18■■■□□ 2.26
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GIPC1-201ENST00000345425 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP29.16■■■□□ 2.26
GIPC1-201ENST00000345425 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP29.16■■■□□ 2.26
GIPC1-201ENST00000345425 SYCE2Q6PIF2 218 aa29.16■■■□□ 2.26
GIPC1-201ENST00000345425 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP29.16■■■□□ 2.26
GIPC1-201ENST00000345425 ASNSD1Q9NWL6 643 aa29.16■■■□□ 2.26
GIPC1-201ENST00000345425 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP29.16■■■□□ 2.26
GIPC1-201ENST00000345425 SCINQ9Y6U3 715 aa29.16■■■□□ 2.26
GIPC1-201ENST00000345425 GOLGA8SH3BPF8 625 aa29.15■■■□□ 2.26
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