RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000328560.12

ATP2C1-201, Transcript of ATPase secretory pathway Ca2+ transporting 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene ATP2C1, Length 3,484 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1-201ENST00000328560 EBF2Q9HAK2 575 aa14.65□□□□□ -0.06
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ATP2C1-201ENST00000328560 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP14.64□□□□□ -0.072e-9■□□□□ 10.7
ATP2C1-201ENST00000328560 C7orf31Q8N865 590 aa14.64□□□□□ -0.07
ATP2C1-201ENST00000328560 CCDC110Q8TBZ0 833 aa14.64□□□□□ -0.07
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ATP2C1-201ENST00000328560 TXNRD2Q9NNW7 524 aa14.64□□□□□ -0.07
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ATP2C1-201ENST00000328560 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa14.63□□□□□ -0.07
ATP2C1-201ENST00000328560 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa14.63□□□□□ -0.07
ATP2C1-201ENST00000328560 RGS9BPQ6ZS82 235 aa14.63□□□□□ -0.07
ATP2C1-201ENST00000328560 CLNKQ7Z7G1 428 aa14.63□□□□□ -0.07
ATP2C1-201ENST00000328560 ACOT1Q86TX2 421 aa14.63□□□□□ -0.07
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ATP2C1-201ENST00000328560 COPEO14579 308 aa14.62□□□□□ -0.07
ATP2C1-201ENST00000328560 HBP1O60381 514 aa14.62□□□□□ -0.07
ATP2C1-201ENST00000328560 KITP10721 976 aa14.62□□□□□ -0.07
ATP2C1-201ENST00000328560 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
ATP2C1-201ENST00000328560 VDRP11473 427 aa14.62□□□□□ -0.07
ATP2C1-201ENST00000328560 STIP1P31948 543 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
ATP2C1-201ENST00000328560 SLC18A1P54219 525 aa14.62□□□□□ -0.07
ATP2C1-201ENST00000328560 SLC10A6Q3KNW5 377 aa14.62□□□□□ -0.07
ATP2C1-201ENST00000328560 MAP7D3Q8IWC1 876 aa14.62□□□□□ -0.07
ATP2C1-201ENST00000328560 KIF12Q96FN5 646 aa14.62□□□□□ -0.07
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