RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000323374.8

SPHK1-201, Transcript of sphingosine kinase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPHK1, Length 2,138 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK1-201ENST00000323374 VSTM1Q6UX27 236 aa22.72■■□□□ 1.23
SPHK1-201ENST00000323374 CYP4X1Q8N118 509 aa22.72■■□□□ 1.23
SPHK1-201ENST00000323374 NAT8LQ8N9F0 302 aa22.72■■□□□ 1.23
SPHK1-201ENST00000323374 FAM71DQ8N9W8 422 aa22.72■■□□□ 1.23
SPHK1-201ENST00000323374 RNF157Q96PX1 679 aa22.72■■□□□ 1.23
SPHK1-201ENST00000323374 APBA2Q99767 749 aa22.72■■□□□ 1.23
SPHK1-201ENST00000323374 LPIN3Q9BQK8 851 aa22.72■■□□□ 1.23
SPHK1-201ENST00000323374 IPPQ9Y573 584 aa22.72■■□□□ 1.23
SPHK1-201ENST00000323374 SPTLC1O15269 473 aa22.71■■□□□ 1.23
SPHK1-201ENST00000323374 HCRTO43612 131 aa22.71■■□□□ 1.23
SPHK1-201ENST00000323374 FGFR1P11362 822 aa22.71■■□□□ 1.23
SPHK1-201ENST00000323374 MAGEA9P43362 315 aa22.71■■□□□ 1.23
SPHK1-201ENST00000323374 ROR1Q01973 937 aa22.71■■□□□ 1.23
SPHK1-201ENST00000323374 SV2CQ496J9 727 aa22.71■■□□□ 1.23
SPHK1-201ENST00000323374 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa22.71■■□□□ 1.23
SPHK1-201ENST00000323374 APPL2Q8NEU8 664 aa22.71■■□□□ 1.23
SPHK1-201ENST00000323374 B3GNT5Q9BYG0 378 aa22.71■■□□□ 1.23
SPHK1-201ENST00000323374 VPS37BQ9H9H4 285 aa22.71■■□□□ 1.23
SPHK1-201ENST00000323374 KCNK9Q9NPC2 374 aa22.71■■□□□ 1.23
SPHK1-201ENST00000323374 EURLQ9NYK6 297 aa22.71■■□□□ 1.23
SPHK1-201ENST00000323374 ACTL7BQ9Y614 415 aa22.71■■□□□ 1.23
SPHK1-201ENST00000323374 GOLGA8MH3BSY2 632 aa22.7■■□□□ 1.23
SPHK1-201ENST00000323374 GABBR2O75899 941 aa22.7■■□□□ 1.23
SPHK1-201ENST00000323374 BRAFP15056 766 aa22.7■■□□□ 1.23
SPHK1-201ENST00000323374 CREB1P16220 341 aa22.7■■□□□ 1.23
SPHK1-201ENST00000323374 ADORA2BP29275 332 aa22.7■■□□□ 1.23
SPHK1-201ENST00000323374 ARL4CP56559 192 aa22.7■■□□□ 1.23
SPHK1-201ENST00000323374 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.23
SPHK1-201ENST00000323374 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.23
SPHK1-201ENST00000323374 C6orf89Q6UWU4 347 aa22.7■■□□□ 1.23
SPHK1-201ENST00000323374 OTUD6BQ8N6M0 293 aa22.7■■□□□ 1.23
SPHK1-201ENST00000323374 SOCS4Q8WXH5 440 aa22.7■■□□□ 1.23
SPHK1-201ENST00000323374 DCAF8L1A6NGE4 600 aa22.7■■□□□ 1.22
SPHK1-201ENST00000323374 CCDC130P13994 396 aa22.7■■□□□ 1.22
SPHK1-201ENST00000323374 LMO2P25791 158 aa22.7■■□□□ 1.22
SPHK1-201ENST00000323374 HOXC8P31273 242 aa22.7■■□□□ 1.22
SPHK1-201ENST00000323374 PURAQ00577 322 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
SPHK1-201ENST00000323374 ANKRD22Q5VYY1 191 aa22.7■■□□□ 1.22
SPHK1-201ENST00000323374 NPNTQ6UXI9 565 aa22.7■■□□□ 1.22
SPHK1-201ENST00000323374 DYDC1Q8WWB3 177 aa22.7■■□□□ 1.22
SPHK1-201ENST00000323374 CABS1Q96KC9 395 aa22.7■■□□□ 1.22
SPHK1-201ENST00000323374 CYLDQ9NQC7 956 aa22.7■■□□□ 1.22
SPHK1-201ENST00000323374 IFNAR2P48551 515 aa22.69■■□□□ 1.22
SPHK1-201ENST00000323374 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
SPHK1-201ENST00000323374 IFT88Q13099 833 aa22.69■■□□□ 1.22
SPHK1-201ENST00000323374 LIMS2Q7Z4I7 341 aa22.69■■□□□ 1.22
SPHK1-201ENST00000323374 TADA2BQ86TJ2 420 aa22.69■■□□□ 1.22
SPHK1-201ENST00000323374 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
SPHK1-201ENST00000323374 VSIG1Q86XK7 387 aa22.69■■□□□ 1.22
SPHK1-201ENST00000323374 TDRPQ86YL5 185 aa22.69■■□□□ 1.22
SPHK1-201ENST00000323374 CCDC13Q8IYE1 715 aa22.69■■□□□ 1.22
SPHK1-201ENST00000323374 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
SPHK1-201ENST00000323374 RASSF4Q9H2L5 321 aa22.69■■□□□ 1.22
SPHK1-201ENST00000323374 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa22.69■■□□□ 1.22
SPHK1-201ENST00000323374 MDM4O15151 490 aa22.69■■□□□ 1.22
SPHK1-201ENST00000323374 HUS1O60921 280 aa22.69■■□□□ 1.22
SPHK1-201ENST00000323374 IL4RP24394 825 aa22.69■■□□□ 1.22
SPHK1-201ENST00000323374 SCNN1AP37088 669 aa22.69■■□□□ 1.22
SPHK1-201ENST00000323374 NR1H3Q13133 447 aa22.69■■□□□ 1.22
SPHK1-201ENST00000323374 TMED2Q15363 201 aa22.69■■□□□ 1.22
SPHK1-201ENST00000323374 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
SPHK1-201ENST00000323374 SLC26A9Q7LBE3 791 aa22.69■■□□□ 1.22
SPHK1-201ENST00000323374 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
SPHK1-201ENST00000323374 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
SPHK1-201ENST00000323374 PPCSQ9HAB8 311 aa22.69■■□□□ 1.22
SPHK1-201ENST00000323374 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa22.69■■□□□ 1.22
SPHK1-201ENST00000323374 FOXO6A8MYZ6 492 aa22.68■■□□□ 1.22
SPHK1-201ENST00000323374 IGHA2P01877 340 aa22.68■■□□□ 1.22
SPHK1-201ENST00000323374 TGM2P21980 687 aa22.68■■□□□ 1.22
SPHK1-201ENST00000323374 PTPN9P43378 593 aa22.68■■□□□ 1.22
SPHK1-201ENST00000323374 ACADSBP45954 432 aa22.68■■□□□ 1.22
SPHK1-201ENST00000323374 RPL34P49207 117 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
SPHK1-201ENST00000323374 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa22.68■■□□□ 1.22
SPHK1-201ENST00000323374 ZNF618Q5T7W0 954 aa22.68■■□□□ 1.22
SPHK1-201ENST00000323374 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
SPHK1-201ENST00000323374 TAF2Q6P1X5 1199 aa22.68■■□□□ 1.22
SPHK1-201ENST00000323374 C1orf228Q6PIY5 440 aa22.68■■□□□ 1.22
SPHK1-201ENST00000323374 LRRC34Q8IZ02 419 aa22.68■■□□□ 1.22
SPHK1-201ENST00000323374 MGARPQ8TDB4 240 aa22.68■■□□□ 1.22
SPHK1-201ENST00000323374 MAML1Q92585 1016 aa22.68■■□□□ 1.22
SPHK1-201ENST00000323374 TNIP3Q96KP6 325 aa22.68■■□□□ 1.22
SPHK1-201ENST00000323374 PCDH18Q9HCL0 1135 aa22.68■■□□□ 1.22
SPHK1-201ENST00000323374 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
SPHK1-201ENST00000323374 H7C0C1 242 aa22.67■■□□□ 1.22
SPHK1-201ENST00000323374 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
SPHK1-201ENST00000323374 APOL1O14791 398 aa22.67■■□□□ 1.22
SPHK1-201ENST00000323374 AKR1A1P14550 325 aa22.67■■□□□ 1.22
SPHK1-201ENST00000323374 GCAP28676 217 aa22.67■■□□□ 1.22
SPHK1-201ENST00000323374 ATP5OP48047 213 aa22.67■■□□□ 1.22
SPHK1-201ENST00000323374 HDAC4P56524 1084 aa22.67■■□□□ 1.22
SPHK1-201ENST00000323374 BASP1P80723 227 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
SPHK1-201ENST00000323374 LRRC14Q15048 493 aa22.67■■□□□ 1.22
SPHK1-201ENST00000323374 ARCQ7LC44 396 aa22.67■■□□□ 1.22
SPHK1-201ENST00000323374 IFNL1Q8IU54 200 aa22.67■■□□□ 1.22
SPHK1-201ENST00000323374 ADGRF2Q8IZF7 708 aa22.67■■□□□ 1.22
SPHK1-201ENST00000323374 PLD5Q8N7P1 536 aa22.67■■□□□ 1.22
SPHK1-201ENST00000323374 ARRDC4Q8NCT1 418 aa22.67■■□□□ 1.22
SPHK1-201ENST00000323374 PYROXD1Q8WU10 500 aa22.67■■□□□ 1.22
SPHK1-201ENST00000323374 HSFY1Q96LI6 401 aa22.67■■□□□ 1.22
SPHK1-201ENST00000323374 RASA4BC9J798 803 aa22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.2 ms