RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000313173.5

HOXD8-201, Transcript of homeobox D8, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-201ENST00000313173 GSTA5Q7RTV2 222 aa28.07■■■□□ 2.08
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP28.07■■■□□ 2.08
HOXD8-201ENST00000313173 PIGZQ86VD9 579 aa28.07■■■□□ 2.08
HOXD8-201ENST00000313173 SYT15Q9BQS2 421 aa28.07■■■□□ 2.08
HOXD8-201ENST00000313173 PAAF1Q9BRP4 392 aa28.07■■■□□ 2.08
HOXD8-201ENST00000313173 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP28.07■■■□□ 2.08
HOXD8-201ENST00000313173 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa28.07■■■□□ 2.08
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF148Q9UQR1 794 aa28.07■■■□□ 2.08
HOXD8-201ENST00000313173 CST8O60676 142 aa28.06■■■□□ 2.08
HOXD8-201ENST00000313173 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP28.06■■■□□ 2.08
HOXD8-201ENST00000313173 ADCY8P40145 1251 aa28.06■■■□□ 2.08
HOXD8-201ENST00000313173 PLCB3Q01970 1234 aa28.06■■■□□ 2.08
HOXD8-201ENST00000313173 SLMAPQ14BN4 828 aa28.06■■■□□ 2.08
HOXD8-201ENST00000313173 ALLCQ8N6M5 410 aa28.06■■■□□ 2.08
HOXD8-201ENST00000313173 BBOF1Q8ND07 529 aa28.06■■■□□ 2.08
HOXD8-201ENST00000313173 SLC35B2Q8TB61 432 aa28.06■■■□□ 2.08
HOXD8-201ENST00000313173 CCHCR1Q8TD31 782 aa28.06■■■□□ 2.08
HOXD8-201ENST00000313173 TEKT4Q8WW24 435 aa28.06■■■□□ 2.08
HOXD8-201ENST00000313173 HAUS1Q96CS2 278 aa28.06■■■□□ 2.08
HOXD8-201ENST00000313173 CRTAC1Q9NQ79 661 aa28.06■■■□□ 2.08
HOXD8-201ENST00000313173 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP28.06■■■□□ 2.08
HOXD8-201ENST00000313173 CLDN5O00501 218 aa28.06■■■□□ 2.08
HOXD8-201ENST00000313173 ARSEP51690 589 aa28.06■■■□□ 2.08
HOXD8-201ENST00000313173 TIGD5Q53EQ6 642 aa28.06■■■□□ 2.08
HOXD8-201ENST00000313173 BOLA3Q53S33 107 aa28.06■■■□□ 2.08
HOXD8-201ENST00000313173 CEP85LQ5SZL2 805 aa28.06■■■□□ 2.08
HOXD8-201ENST00000313173 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa28.06■■■□□ 2.08
HOXD8-201ENST00000313173 TBCBQ99426 244 aa28.06■■■□□ 2.08
HOXD8-201ENST00000313173 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP28.06■■■□□ 2.08
HOXD8-201ENST00000313173 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP28.06■■■□□ 2.08
HOXD8-201ENST00000313173 TSC2P49815 1807 aa28.06■■■□□ 2.08
HOXD8-201ENST00000313173 INPPL1O15357 1258 aa28.05■■■□□ 2.08
HOXD8-201ENST00000313173 ITGAVP06756 1048 aa28.05■■■□□ 2.08
HOXD8-201ENST00000313173 DYNLT1P63172 113 aa28.05■■■□□ 2.08
HOXD8-201ENST00000313173 TUSC3Q13454 348 aa28.05■■■□□ 2.08
HOXD8-201ENST00000313173 RFX6Q8HWS3 928 aa28.05■■■□□ 2.08
HOXD8-201ENST00000313173 SPATA18Q8TC71 538 aa28.05■■■□□ 2.08
HOXD8-201ENST00000313173 KCTD13Q8WZ19 329 aa28.05■■■□□ 2.08
HOXD8-201ENST00000313173 UROC1Q96N76 676 aa28.05■■■□□ 2.08
HOXD8-201ENST00000313173 MED10Q9BTT4 135 aa28.05■■■□□ 2.08
HOXD8-201ENST00000313173 CALN1Q9BXU9 219 aa28.05■■■□□ 2.08
HOXD8-201ENST00000313173 RGS18Q9NS28 235 aa28.05■■■□□ 2.08
HOXD8-201ENST00000313173 CDH9Q9ULB4 789 aa28.05■■■□□ 2.08
HOXD8-201ENST00000313173 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP28.05■■■□□ 2.08
HOXD8-201ENST00000313173 ODC1P11926 461 aa28.04■■■□□ 2.08
HOXD8-201ENST00000313173 PAX3P23760 479 aa28.04■■■□□ 2.08
HOXD8-201ENST00000313173 ITGA8P53708 1063 aa28.04■■■□□ 2.08
HOXD8-201ENST00000313173 CDH6P55285 790 aa28.04■■■□□ 2.08
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF844Q08AG5 666 aa28.04■■■□□ 2.08
HOXD8-201ENST00000313173 MBTPS1Q14703 1052 aa28.04■■■□□ 2.08
HOXD8-201ENST00000313173 EFHC1Q5JVL4 640 aa28.04■■■□□ 2.08
HOXD8-201ENST00000313173 FAM76AQ8TAV0 307 aa28.04■■■□□ 2.08
HOXD8-201ENST00000313173 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP28.04■■■□□ 2.08
HOXD8-201ENST00000313173 EPB41L4BQ9H329 900 aa28.04■■■□□ 2.08
HOXD8-201ENST00000313173 PHF24Q9UPV7 400 aa28.04■■■□□ 2.08
HOXD8-201ENST00000313173 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa28.04■■■□□ 2.08
HOXD8-201ENST00000313173 FAM200BP0CF97 657 aa28.04■■■□□ 2.08
HOXD8-201ENST00000313173 VPS41P49754 854 aa28.04■■■□□ 2.08
HOXD8-201ENST00000313173 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP28.04■■■□□ 2.08
HOXD8-201ENST00000313173 CLEC20AQ6ZU45 233 aa28.04■■■□□ 2.08
HOXD8-201ENST00000313173 OR2W6PQ8NHA6 318 aa28.04■■■□□ 2.08
HOXD8-201ENST00000313173 ACTL9Q8TC94 416 aa28.04■■■□□ 2.08
HOXD8-201ENST00000313173 PSD3Q9NYI0 1048 aa28.04■■■□□ 2.08
HOXD8-201ENST00000313173 ARVCFO00192 962 aa28.03■■■□□ 2.08
HOXD8-201ENST00000313173 RARGP13631 454 aa28.03■■■□□ 2.08
HOXD8-201ENST00000313173 HDAC4P56524 1084 aa28.03■■■□□ 2.08
HOXD8-201ENST00000313173 ADIGQ0VDE8 80 aa28.03■■■□□ 2.08
HOXD8-201ENST00000313173 PDK2Q15119 407 aa28.03■■■□□ 2.08
HOXD8-201ENST00000313173 SCYL2Q6P3W7 929 aa28.03■■■□□ 2.08
HOXD8-201ENST00000313173 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP28.03■■■□□ 2.08
HOXD8-201ENST00000313173 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP28.03■■■□□ 2.08
HOXD8-201ENST00000313173 UNC93B1Q9H1C4 597 aa28.03■■■□□ 2.08
HOXD8-201ENST00000313173 KRT82Q9NSB4 513 aa28.03■■■□□ 2.08
HOXD8-201ENST00000313173 ANAPC5Q9UJX4 755 aa28.03■■■□□ 2.08
HOXD8-201ENST00000313173 GOLGA6L10A6NI86 522 aa28.02■■■□□ 2.08
HOXD8-201ENST00000313173 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa28.02■■■□□ 2.08
HOXD8-201ENST00000313173 B3GAT3O94766 335 aa28.02■■■□□ 2.08
HOXD8-201ENST00000313173 MYCP01106 439 aaPredicted RBP28.02■■■□□ 2.08
HOXD8-201ENST00000313173 APOC2P02655 101 aa28.02■■■□□ 2.08
HOXD8-201ENST00000313173 PCSK1P29120 753 aa28.02■■■□□ 2.08
HOXD8-201ENST00000313173 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP28.02■■■□□ 2.08
HOXD8-201ENST00000313173 DPYSL3Q14195 570 aa28.02■■■□□ 2.08
HOXD8-201ENST00000313173 MAP7D3Q8IWC1 876 aa28.02■■■□□ 2.08
HOXD8-201ENST00000313173 TMBIM4Q9HC24 238 aa28.02■■■□□ 2.08
HOXD8-201ENST00000313173 C9IYK1 514 aa28.02■■■□□ 2.08
HOXD8-201ENST00000313173 BEST1O76090 585 aa28.02■■■□□ 2.08
HOXD8-201ENST00000313173 NUDT17P0C025 328 aa28.02■■■□□ 2.08
HOXD8-201ENST00000313173 ADCY1Q08828 1119 aa28.02■■■□□ 2.08
HOXD8-201ENST00000313173 KRT81Q14533 505 aa28.02■■■□□ 2.08
HOXD8-201ENST00000313173 CD300LGQ6UXG3 332 aa28.02■■■□□ 2.08
HOXD8-201ENST00000313173 FAM35AQ86V20 835 aa28.02■■■□□ 2.08
HOXD8-201ENST00000313173 TSPYL1Q9H0U9 437 aa28.02■■■□□ 2.08
HOXD8-201ENST00000313173 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP28.02■■■□□ 2.08
HOXD8-201ENST00000313173 MDM4O15151 490 aa28.01■■■□□ 2.07
HOXD8-201ENST00000313173 CYP11A1P05108 521 aa28.01■■■□□ 2.07
HOXD8-201ENST00000313173 MYZAPP0CAP1 466 aa28.01■■■□□ 2.07
HOXD8-201ENST00000313173 IZUMO3Q5VZ72 239 aa28.01■■■□□ 2.07
HOXD8-201ENST00000313173 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP28.01■■■□□ 2.07
HOXD8-201ENST00000313173 VSIG1Q86XK7 387 aa28.01■■■□□ 2.07
HOXD8-201ENST00000313173 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.6 ms