RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000312060.9

CTU2-201, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene CTU2, Length 1,672 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-201ENST00000312060 CAMK1Q14012 370 aa23.26■■□□□ 1.31
CTU2-201ENST00000312060 MESDQ14696 234 aa23.26■■□□□ 1.31
CTU2-201ENST00000312060 SYT10Q6XYQ8 523 aa23.26■■□□□ 1.31
CTU2-201ENST00000312060 DAAM2Q86T65 1068 aa23.26■■□□□ 1.31
CTU2-201ENST00000312060 WDR24Q96S15 920 aa23.26■■□□□ 1.31
CTU2-201ENST00000312060 CYP4F11Q9HBI6 524 aa23.26■■□□□ 1.31
CTU2-201ENST00000312060 HSFX1Q9UBD0 423 aa23.26■■□□□ 1.31
CTU2-201ENST00000312060 DNAI1Q9UI46 699 aa23.26■■□□□ 1.31
CTU2-201ENST00000312060 CHD7Q9P2D1 2997 aa23.26■■□□□ 1.31
CTU2-201ENST00000312060 HIDE1A8MVS5 230 aa23.25■■□□□ 1.31
CTU2-201ENST00000312060 LPXNO60711 386 aa23.25■■□□□ 1.31
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CTU2-201ENST00000312060 ELF1P32519 619 aa23.25■■□□□ 1.31
CTU2-201ENST00000312060 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
CTU2-201ENST00000312060 SLC5A3P53794 718 aa23.25■■□□□ 1.31
CTU2-201ENST00000312060 TAF5Q15542 800 aa23.25■■□□□ 1.31
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CTU2-201ENST00000312060 JOSD2Q8TAC2 188 aa23.25■■□□□ 1.31
CTU2-201ENST00000312060 ARNTL2Q8WYA1 636 aa23.25■■□□□ 1.31
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CTU2-201ENST00000312060 USP3Q9Y6I4 520 aa23.25■■□□□ 1.31
CTU2-201ENST00000312060 FSCN2O14926 492 aa23.25■■□□□ 1.31
CTU2-201ENST00000312060 GRAP2O75791 330 aa23.25■■□□□ 1.31
CTU2-201ENST00000312060 ZBED1O96006 694 aa23.25■■□□□ 1.31
CTU2-201ENST00000312060 USP17L7P0C7H9 530 aa23.25■■□□□ 1.31
CTU2-201ENST00000312060 KLRC2P26717 231 aa23.25■■□□□ 1.31
CTU2-201ENST00000312060 IRS1P35568 1242 aa23.25■■□□□ 1.31
CTU2-201ENST00000312060 SCNN1AP37088 669 aa23.25■■□□□ 1.31
CTU2-201ENST00000312060 EFHC1Q5JVL4 640 aa23.25■■□□□ 1.31
CTU2-201ENST00000312060 SLC26A9Q7LBE3 791 aa23.25■■□□□ 1.31
CTU2-201ENST00000312060 SYCE1Q8N0S2 351 aa23.25■■□□□ 1.31
CTU2-201ENST00000312060 EMC1Q8N766 993 aa23.25■■□□□ 1.31
CTU2-201ENST00000312060 LRRC57Q8N9N7 239 aa23.25■■□□□ 1.31
CTU2-201ENST00000312060 SCAMP5Q8TAC9 235 aa23.25■■□□□ 1.31
CTU2-201ENST00000312060 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP23.25■■□□□ 1.31
CTU2-201ENST00000312060 SPATA17Q96L03 361 aa23.25■■□□□ 1.31
CTU2-201ENST00000312060 GOLPH3Q9H4A6 298 aa23.25■■□□□ 1.31
CTU2-201ENST00000312060 TMEM59LQ9UK28 342 aa23.25■■□□□ 1.31
CTU2-201ENST00000312060 MAFFQ9ULX9 164 aa23.25■■□□□ 1.31
CTU2-201ENST00000312060 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa23.24■■□□□ 1.31
CTU2-201ENST00000312060 DAOAP59103 153 aa23.24■■□□□ 1.31
CTU2-201ENST00000312060 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
CTU2-201ENST00000312060 PM20D1Q6GTS8 502 aa23.24■■□□□ 1.31
CTU2-201ENST00000312060 SLFN11Q7Z7L1 901 aa23.24■■□□□ 1.31
CTU2-201ENST00000312060 GPR152Q8TDT2 470 aa23.24■■□□□ 1.31
CTU2-201ENST00000312060 PRO3102Q9H379 93 aa23.24■■□□□ 1.31
CTU2-201ENST00000312060 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa23.24■■□□□ 1.31
CTU2-201ENST00000312060 CHD9Q3L8U1 2897 aa23.24■■□□□ 1.31
CTU2-201ENST00000312060 SART1O43290 800 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
CTU2-201ENST00000312060 TGM5O43548 720 aa23.23■■□□□ 1.31
CTU2-201ENST00000312060 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
CTU2-201ENST00000312060 C11orf63Q6NUN7 778 aa23.23■■□□□ 1.31
CTU2-201ENST00000312060 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa23.23■■□□□ 1.31
CTU2-201ENST00000312060 STKLD1Q8NE28 680 aa23.23■■□□□ 1.31
CTU2-201ENST00000312060 ZNF592Q92610 1267 aa23.23■■□□□ 1.31
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CTU2-201ENST00000312060 PRRG1O14668 218 aa23.22■■□□□ 1.31
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CTU2-201ENST00000312060 SCML4Q8N228 414 aa23.22■■□□□ 1.31
CTU2-201ENST00000312060 IRGQQ8WZA9 623 aa23.22■■□□□ 1.31
CTU2-201ENST00000312060 FAM149B1Q96BN6 582 aa23.22■■□□□ 1.31
CTU2-201ENST00000312060 TIFAQ96CG3 184 aa23.22■■□□□ 1.31
CTU2-201ENST00000312060 CEP295NLQ96MC4 621 aa23.22■■□□□ 1.31
CTU2-201ENST00000312060 LCMT1Q9UIC8 334 aa23.22■■□□□ 1.31
CTU2-201ENST00000312060 JRKLQ9Y4A0 524 aa23.22■■□□□ 1.31
CTU2-201ENST00000312060 FTCDO95954 541 aa23.22■■□□□ 1.31
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CTU2-201ENST00000312060 FLT3P36888 993 aa23.22■■□□□ 1.31
CTU2-201ENST00000312060 ALDH1A3P47895 512 aa23.22■■□□□ 1.31
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CTU2-201ENST00000312060 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
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CTU2-201ENST00000312060 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa23.22■■□□□ 1.31
CTU2-201ENST00000312060 ARCQ7LC44 396 aa23.22■■□□□ 1.31
CTU2-201ENST00000312060 FNIP1Q8TF40 1166 aa23.22■■□□□ 1.31
CTU2-201ENST00000312060 GIPC2Q8TF65 315 aa23.22■■□□□ 1.31
CTU2-201ENST00000312060 FBXO44Q9H4M3 255 aa23.22■■□□□ 1.31
CTU2-201ENST00000312060 ASNSD1Q9NWL6 643 aa23.22■■□□□ 1.31
CTU2-201ENST00000312060 C2CD4BA6NLJ0 364 aa23.21■■□□□ 1.31
CTU2-201ENST00000312060 YJEFN3A6XGL0 299 aa23.21■■□□□ 1.31
CTU2-201ENST00000312060 E7ENQ6 273 aa23.21■■□□□ 1.31
CTU2-201ENST00000312060 FANCGO15287 622 aa23.21■■□□□ 1.31
CTU2-201ENST00000312060 HSF2BPO75031 334 aa23.21■■□□□ 1.31
CTU2-201ENST00000312060 PROSCO94903 275 aa23.21■■□□□ 1.31
CTU2-201ENST00000312060 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
CTU2-201ENST00000312060 GLI1P08151 1106 aa23.21■■□□□ 1.31
CTU2-201ENST00000312060 PSMA2P25787 234 aa23.21■■□□□ 1.31
CTU2-201ENST00000312060 PTPROQ16827 1216 aa23.21■■□□□ 1.31
CTU2-201ENST00000312060 PEX26Q7Z412 305 aa23.21■■□□□ 1.31
CTU2-201ENST00000312060 RXFP2Q8WXD0 754 aa23.21■■□□□ 1.31
CTU2-201ENST00000312060 IL37Q9NZH6 218 aa23.21■■□□□ 1.31
CTU2-201ENST00000312060 AMFRQ9UKV5 643 aa23.21■■□□□ 1.31
CTU2-201ENST00000312060 HYOU1Q9Y4L1 999 aa23.21■■□□□ 1.31
CTU2-201ENST00000312060 YIPF1Q9Y548 306 aa23.21■■□□□ 1.31
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