RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000301886.3

ARL2-SNX15-201, Transcript of ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene ARL2-SNX15, Length 2,392 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SLC16A4O15374 487 aa23.61■■□□□ 1.37
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MAGEB3O15480 346 aa23.61■■□□□ 1.37
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SPAG6O75602 509 aa23.61■■□□□ 1.37
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TMEM63AO94886 807 aa23.61■■□□□ 1.37
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MPP3Q13368 585 aa23.61■■□□□ 1.37
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CEP55Q53EZ4 464 aa23.61■■□□□ 1.37
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SMIM5Q71RC9 77 aa23.61■■□□□ 1.37
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ZNF410Q86VK4 478 aa23.61■■□□□ 1.37
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ABRAQ8N0Z2 381 aa23.61■■□□□ 1.37
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 BBS5Q8N3I7 341 aa23.61■■□□□ 1.37
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CEP70Q8NHQ1 597 aa23.61■■□□□ 1.37
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SIKE1Q9BRV8 207 aa23.61■■□□□ 1.37
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ALDH1A3P47895 512 aa23.6■■□□□ 1.37
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 COPAP53621 1224 aa23.6■■□□□ 1.37
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KRT81Q14533 505 aa23.6■■□□□ 1.37
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SLC26A11Q86WA9 606 aa23.6■■□□□ 1.37
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CCDC33Q8N5R6 958 aa23.6■■□□□ 1.37
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SLC35B4Q969S0 331 aa23.6■■□□□ 1.37
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 DCUN1D1Q96GG9 259 aa23.6■■□□□ 1.37
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MKS1Q9NXB0 559 aa23.6■■□□□ 1.37
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ELK3P41970 407 aa23.6■■□□□ 1.37
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 GDF10P55107 478 aa23.6■■□□□ 1.37
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TUBB3Q13509 450 aa23.6■■□□□ 1.37
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PLA2G4FQ68DD2 849 aa23.6■■□□□ 1.37
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa23.6■■□□□ 1.37
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 IGDCC3Q8IVU1 814 aa23.6■■□□□ 1.37
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 POMGNT1Q8WZA1 660 aa23.6■■□□□ 1.37
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 EBF4Q9BQW3 602 aa23.6■■□□□ 1.37
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TMEM191CA6NGB0 347 aa23.59■■□□□ 1.37
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 BIRC5O15392 142 aa23.59■■□□□ 1.37
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CFHP08603 1231 aa23.59■■□□□ 1.37
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TMEM191BP0C7N4 346 aa23.59■■□□□ 1.37
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ARP10275 920 aa23.59■■□□□ 1.37
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CD151P48509 253 aa23.59■■□□□ 1.37
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PSMC5P62195 406 aa23.59■■□□□ 1.37
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MYBPC1Q00872 1141 aa23.59■■□□□ 1.37
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SLC44A4Q53GD3 710 aa23.59■■□□□ 1.37
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RABGAP1LQ5R372 815 aa23.59■■□□□ 1.37
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TRIM67Q6ZTA4 783 aa23.59■■□□□ 1.37
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 GMCL1Q96IK5 515 aa23.59■■□□□ 1.37
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PICK1Q9NRD5 415 aa23.59■■□□□ 1.37
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 GGA1Q9UJY5 639 aa23.59■■□□□ 1.37
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa23.59■■□□□ 1.37
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KRT37O76014 449 aa23.59■■□□□ 1.37
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PDE5AO76074 875 aa23.59■■□□□ 1.37
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 WEE2P0C1S8 567 aa23.59■■□□□ 1.37
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CYP24A1Q07973 514 aa23.59■■□□□ 1.37
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MTM1Q13496 603 aa23.59■■□□□ 1.37
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 LPIN1Q14693 890 aa23.59■■□□□ 1.37
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CROCCP3Q8IVE0 287 aa23.59■■□□□ 1.37
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RSAD2Q8WXG1 361 aa23.59■■□□□ 1.37
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 APBB2Q92870 758 aa23.59■■□□□ 1.37
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SUPT3HO75486 399 aa23.58■■□□□ 1.37
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 VIL1P09327 827 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 NR1H2P55055 460 aa23.58■■□□□ 1.37
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PEX3P56589 373 aa23.58■■□□□ 1.37
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MTMR2Q13614 643 aa23.58■■□□□ 1.37
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 Q6ZNX1 250 aa23.58■■□□□ 1.37
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SIAH1Q8IUQ4 282 aa23.58■■□□□ 1.37
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 FBXL18Q96ME1 805 aa23.58■■□□□ 1.37
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CEPT1Q9Y6K0 416 aa23.58■■□□□ 1.37
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 NRAPQ86VF7 1730 aa23.58■■□□□ 1.37
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KBTBD13C9JR72 458 aa23.58■■□□□ 1.37
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SLURP2P0DP57 97 aa23.58■■□□□ 1.37
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RARRES1P49788 294 aa23.58■■□□□ 1.37
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa23.58■■□□□ 1.37
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ACTL9Q8TC94 416 aa23.58■■□□□ 1.37
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PNPLA8Q9NP80 782 aa23.58■■□□□ 1.37
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PSMD13Q9UNM6 376 aa23.58■■□□□ 1.37
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 AK5Q9Y6K8 562 aa23.58■■□□□ 1.37
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CFBP00751 764 aa23.57■■□□□ 1.36
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PROCP04070 461 aa23.57■■□□□ 1.36
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 L1CAMP32004 1257 aa23.57■■□□□ 1.36
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP23.57■■□□□ 1.36
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 STX3Q13277 289 aa23.57■■□□□ 1.36
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 LGSNQ5TDP6 509 aa23.57■■□□□ 1.36
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 LRRC8BQ6P9F7 803 aa23.57■■□□□ 1.36
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PQLC1Q8N2U9 271 aa23.57■■□□□ 1.36
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
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