RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296098.4

TRIM54-201, Transcript of tripartite motif containing 54, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRIM54, Length 2,027 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54-201ENST00000296098 CD4P01730 458 aa25.03■■□□□ 1.6
TRIM54-201ENST00000296098 ITIH4Q14624 930 aa25.03■■□□□ 1.6
TRIM54-201ENST00000296098 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
TRIM54-201ENST00000296098 BOLA3Q53S33 107 aa25.03■■□□□ 1.6
TRIM54-201ENST00000296098 SCYL2Q6P3W7 929 aa25.03■■□□□ 1.6
TRIM54-201ENST00000296098 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
TRIM54-201ENST00000296098 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa25.03■■□□□ 1.6
TRIM54-201ENST00000296098 TMEM40Q8WWA1 233 aa25.03■■□□□ 1.6
TRIM54-201ENST00000296098 USP6NLQ92738 828 aa25.03■■□□□ 1.6
TRIM54-201ENST00000296098 ZNF560Q96MR9 790 aa25.03■■□□□ 1.6
TRIM54-201ENST00000296098 RNF157Q96PX1 679 aa25.03■■□□□ 1.6
TRIM54-201ENST00000296098 MLXIPLQ9NP71 852 aa25.03■■□□□ 1.6
TRIM54-201ENST00000296098 FLRT1Q9NZU1 646 aa25.03■■□□□ 1.6
TRIM54-201ENST00000296098 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
TRIM54-201ENST00000296098 ADAM17P78536 824 aa25.02■■□□□ 1.6
TRIM54-201ENST00000296098 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa25.02■■□□□ 1.6
TRIM54-201ENST00000296098 TRABD2AQ86V40 505 aa25.02■■□□□ 1.6
TRIM54-201ENST00000296098 SCUBE3Q8IX30 993 aa25.02■■□□□ 1.6
TRIM54-201ENST00000296098 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
TRIM54-201ENST00000296098 ATP11CQ8NB49 1132 aa25.02■■□□□ 1.6
TRIM54-201ENST00000296098 CKAP2Q8WWK9 683 aa25.02■■□□□ 1.6
TRIM54-201ENST00000296098 TBCBQ99426 244 aa25.02■■□□□ 1.6
TRIM54-201ENST00000296098 OSBPL7Q9BZF2 842 aa25.02■■□□□ 1.6
TRIM54-201ENST00000296098 UBN1Q9NPG3 1134 aa25.02■■□□□ 1.6
TRIM54-201ENST00000296098 RNF19AQ9NV58 838 aa25.02■■□□□ 1.6
TRIM54-201ENST00000296098 CAPN7Q9Y6W3 813 aa25.02■■□□□ 1.6
TRIM54-201ENST00000296098 TMEM63AO94886 807 aa25.02■■□□□ 1.6
TRIM54-201ENST00000296098 STIP1P31948 543 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
TRIM54-201ENST00000296098 PHBP35232 272 aa25.02■■□□□ 1.6
TRIM54-201ENST00000296098 BASP1P80723 227 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
TRIM54-201ENST00000296098 FNBP1LQ5T0N5 605 aa25.02■■□□□ 1.6
TRIM54-201ENST00000296098 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
TRIM54-201ENST00000296098 GDAP1Q8TB36 358 aa25.02■■□□□ 1.6
TRIM54-201ENST00000296098 PYROXD1Q8WU10 500 aa25.02■■□□□ 1.6
TRIM54-201ENST00000296098 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP25.02■■□□□ 1.6
TRIM54-201ENST00000296098 NCAPGQ9BPX3 1015 aa25.02■■□□□ 1.6
TRIM54-201ENST00000296098 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
TRIM54-201ENST00000296098 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
TRIM54-201ENST00000296098 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa25.02■■□□□ 1.6
TRIM54-201ENST00000296098 SLC24A2Q9UI40 661 aa25.02■■□□□ 1.6
TRIM54-201ENST00000296098 CLUHO75153 1309 aa25.01■■□□□ 1.59
TRIM54-201ENST00000296098 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa25.01■■□□□ 1.59
TRIM54-201ENST00000296098 TCP11X1B4DZS4 312 aa25.01■■□□□ 1.59
TRIM54-201ENST00000296098 E7ESA3 106 aa25.01■■□□□ 1.59
TRIM54-201ENST00000296098 HAS3O00219 553 aa25.01■■□□□ 1.59
TRIM54-201ENST00000296098 PIRO00625 290 aa25.01■■□□□ 1.59
TRIM54-201ENST00000296098 XPOTO43592 962 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
TRIM54-201ENST00000296098 STX2P32856 288 aa25.01■■□□□ 1.59
TRIM54-201ENST00000296098 CPT1AP50416 773 aa25.01■■□□□ 1.59
TRIM54-201ENST00000296098 GPX6P59796 221 aa25.01■■□□□ 1.59
TRIM54-201ENST00000296098 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
TRIM54-201ENST00000296098 BST2Q10589 180 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
TRIM54-201ENST00000296098 MSS51Q4VC12 460 aa25.01■■□□□ 1.59
TRIM54-201ENST00000296098 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa25.01■■□□□ 1.59
TRIM54-201ENST00000296098 KLK14Q9P0G3 267 aa25.01■■□□□ 1.59
TRIM54-201ENST00000296098 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
TRIM54-201ENST00000296098 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa25■■□□□ 1.59
TRIM54-201ENST00000296098 HCRTO43612 131 aa25■■□□□ 1.59
TRIM54-201ENST00000296098 GABBR2O75899 941 aa25■■□□□ 1.59
TRIM54-201ENST00000296098 BCAT1P54687 386 aa25■■□□□ 1.59
TRIM54-201ENST00000296098 ADCY1Q08828 1119 aa25■■□□□ 1.59
TRIM54-201ENST00000296098 RASA2Q15283 850 aa25■■□□□ 1.59
TRIM54-201ENST00000296098 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa25■■□□□ 1.59
TRIM54-201ENST00000296098 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
TRIM54-201ENST00000296098 C1orf228Q6PIY5 440 aa25■■□□□ 1.59
TRIM54-201ENST00000296098 LPIN3Q9BQK8 851 aa25■■□□□ 1.59
TRIM54-201ENST00000296098 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
TRIM54-201ENST00000296098 PCDH18Q9HCL0 1135 aa25■■□□□ 1.59
TRIM54-201ENST00000296098 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
TRIM54-201ENST00000296098 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
TRIM54-201ENST00000296098 FAM47DPA6NHR8 397 aa25■■□□□ 1.59
TRIM54-201ENST00000296098 KPNA7A9QM74 516 aa25■■□□□ 1.59
TRIM54-201ENST00000296098 H7C0C1 242 aa25■■□□□ 1.59
TRIM54-201ENST00000296098 MDM4O15151 490 aa25■■□□□ 1.59
TRIM54-201ENST00000296098 TREHO43280 583 aa25■■□□□ 1.59
TRIM54-201ENST00000296098 MYL3P08590 195 aa25■■□□□ 1.59
TRIM54-201ENST00000296098 CCDC130P13994 396 aa25■■□□□ 1.59
TRIM54-201ENST00000296098 TGM2P21980 687 aa25■■□□□ 1.59
TRIM54-201ENST00000296098 PNPLA4P41247 253 aa25■■□□□ 1.59
TRIM54-201ENST00000296098 ATP5OP48047 213 aa25■■□□□ 1.59
TRIM54-201ENST00000296098 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
TRIM54-201ENST00000296098 EFHC2Q5JST6 749 aa25■■□□□ 1.59
TRIM54-201ENST00000296098 PACS2Q86VP3 889 aa25■■□□□ 1.59
TRIM54-201ENST00000296098 VSIG1Q86XK7 387 aa25■■□□□ 1.59
TRIM54-201ENST00000296098 PDIK1LQ8N165 341 aa25■■□□□ 1.59
TRIM54-201ENST00000296098 C7orf31Q8N865 590 aa25■■□□□ 1.59
TRIM54-201ENST00000296098 TSPAN18Q96SJ8 248 aa25■■□□□ 1.59
TRIM54-201ENST00000296098 B3GNT5Q9BYG0 378 aa25■■□□□ 1.59
TRIM54-201ENST00000296098 SENP1Q9P0U3 644 aa25■■□□□ 1.59
TRIM54-201ENST00000296098 APOL1O14791 398 aa24.99■■□□□ 1.59
TRIM54-201ENST00000296098 FGFR1P11362 822 aa24.99■■□□□ 1.59
TRIM54-201ENST00000296098 KCNE1P15382 129 aa24.99■■□□□ 1.59
TRIM54-201ENST00000296098 ADORA2BP29275 332 aa24.99■■□□□ 1.59
TRIM54-201ENST00000296098 PLD5Q8N7P1 536 aa24.99■■□□□ 1.59
TRIM54-201ENST00000296098 ANKRD52Q8NB46 1076 aa24.99■■□□□ 1.59
TRIM54-201ENST00000296098 CCT6BQ92526 530 aa24.99■■□□□ 1.59
TRIM54-201ENST00000296098 SGSM3Q96HU1 749 aa24.99■■□□□ 1.59
TRIM54-201ENST00000296098 SNX25Q9H3E2 840 aa24.99■■□□□ 1.59
TRIM54-201ENST00000296098 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa24.99■■□□□ 1.59
TRIM54-201ENST00000296098 GDAP2Q9NXN4 497 aa24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24 ms