RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000267176.8

SBNO1-201, Transcript of strawberry notch homolog 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene SBNO1, Length 11,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO1-201ENST00000267176 ARIH2O95376 493 aa6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 GIT2Q14161 759 aa6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 MTMR12Q9C0I1 747 aa6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 WDCPQ9H6R7 721 aa6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 PNMA3Q9UL41 463 aa6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 A0A087X0B3 334 aa6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 MSH4O15457 936 aa6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 RPS6KA5O75582 802 aa6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 PROCP04070 461 aa6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 GRK2P25098 689 aa6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 FDFT1P37268 417 aa6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 NCKAP1LP55160 1127 aa6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 SGO1Q5FBB7 561 aa6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 ZNF720Q7Z2F6 126 aa6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 POU5F2Q8N7G0 328 aa6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 RIC8BQ9NVN3 520 aa6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 DEPDC5O75140 1603 aa6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 SHBGP04278 402 aa6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 CNTFP26441 200 aa6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 SERPINB8P50452 374 aa6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 ADARP55265 1226 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 RAB14P61106 215 aa6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 PKN1Q16512 942 aa6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 LINC00523Q86TU6 105 aa6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 CATSPER2Q96P56 530 aa6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 EPS8L2Q9H6S3 715 aa6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 SHROOM3Q8TF72 1996 aa6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 DCXO43602 365 aa6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 PMPCBO75439 489 aa6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 CHRNB3Q05901 458 aa6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 EMC2Q15006 297 aa6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 CBWD2Q8IUF1 395 aa6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 MIER2Q8N344 545 aa6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 TERB1Q8NA31 727 aa6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 SCFD2Q8WU76 684 aa6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 DAPK2Q9UIK4 370 aa6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 FMN2Q9NZ56 1722 aa6.54□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 GSTT1P30711 240 aa6.54□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 PTK6Q13882 451 aa6.54□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 VPS37AQ8NEZ2 397 aa6.54□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 SEMA4DQ92854 862 aa6.54□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 SALL3Q9BXA9 1300 aa6.54□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 OPLAHO14841 1288 aa6.54□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 SNX3O60493 162 aa6.54□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 BAIAP3O94812 1187 aa6.54□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 BCL10O95999 233 aa6.54□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 FBXW4P57775 412 aa6.54□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 COG2Q14746 738 aa6.54□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 MTFR1Q15390 333 aa6.54□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 OR8H2Q8N162 312 aa6.54□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 LRRC4BQ9NT99 713 aa6.54□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 SPAG17Q6Q759 2223 aa6.54□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 KANSL1LA0AUZ9 987 aa6.54□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 ZNF263O14978 683 aa6.54□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 PARNO95453 639 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
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SBNO1-201ENST00000267176 LRRC71Q8N4P6 559 aa6.54□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 KAZALD1Q96I82 304 aa6.54□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 MCM8Q9UJA3 840 aa6.54□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 C5orf58C9J3I9 102 aa6.54□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 PGM3O95394 542 aa6.54□□□□□ -1.36
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SBNO1-201ENST00000267176 MYBL2P10244 700 aa6.54□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 NUMBP49757 651 aa6.54□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 SAR1AQ9NR31 198 aa6.54□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa6.54□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 SDR42E2A6NKP2 422 aa6.54□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 M0QYT0 321 aa6.54□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 FDX1P10109 184 aa6.54□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 HMGCS2P54868 508 aa6.54□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 BMPR2Q13873 1038 aa6.54□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 BOLA3Q53S33 107 aa6.54□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 ATF7IP2Q5U623 682 aa6.54□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 KYQ8NBH2 561 aa6.54□□□□□ -1.36
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