RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264640.8

SMARCE1-201, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 631 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-201ENST00000264640 NFU1Q9UMS0 254 aa7.46□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 NENFQ9UMX5 172 aa7.46□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 AKT3Q9Y243 479 aa7.46□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 USP20Q9Y2K6 914 aa7.46□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 COL4A2P08572 1712 aa7.46□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa7.46□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 LAMA1P25391 3075 aa7.45□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 EBAG9O00559 213 aa7.45□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP7.45□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 RAD51CO43502 376 aa7.45□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 HBP1O60381 514 aa7.45□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 CCNE2O96020 404 aa7.45□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 GLUD1P00367 558 aa7.45□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 MYZAPP0CAP1 466 aa7.45□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 MYBL2P10244 700 aa7.45□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 GZMAP12544 262 aa7.45□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 TARSP26639 723 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 CARSP49589 748 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 BPIFB4P59827 614 aa7.45□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 SHC2P98077 582 aa7.45□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 GTF2BQ00403 316 aa7.45□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 MTAPQ13126 283 aa7.45□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 AGBL2Q5U5Z8 902 aa7.45□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 IL31Q6EBC2 164 aa7.45□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 LAIR1Q6GTX8 287 aa7.45□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 C11orf63Q6NUN7 778 aa7.45□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa7.45□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 TPRG1Q6ZUI0 275 aa7.45□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa7.45□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 KLHL7Q8IXQ5 586 aa7.45□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 LRRC71Q8N4P6 559 aa7.45□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC30A5Q8TAD4 765 aa7.45□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa7.45□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 NXPE3Q969Y0 559 aa7.45□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 TRIM11Q96F44 468 aa7.45□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 HES6Q96HZ4 224 aa7.45□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 MS4A14Q96JA4 679 aa7.45□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 ZFP42Q96MM3 310 aa7.45□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 SCLT1Q96NL6 688 aa7.45□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 RPS6KC1Q96S38 1066 aa7.45□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 STRA6Q9BX79 667 aa7.45□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 KIAA1586Q9HCI6 787 aa7.45□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 KCNH7Q9NS40 1196 aa7.45□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 COL1A2P08123 1366 aa7.45□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 EML5Q05BV3 1969 aa7.44□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 A0A0U1RQF3 1178 aa7.44□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 SOBPA7XYQ1 873 aa7.44□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 AGPSO00116 658 aa7.44□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 PODXLO00592 558 aa7.44□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 TEX28O15482 410 aa7.44□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 SART1O43290 800 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 LILRB3O75022 631 aa7.44□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 GLI1P08151 1106 aa7.44□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 SPINK2P20155 84 aa7.44□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 ATP4AP20648 1035 aa7.44□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 YWHABP31946 246 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 MXI1P50539 228 aa7.44□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 NCKAP1LP55160 1127 aa7.44□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 GNGT1P63211 74 aa7.44□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 NTHL1P78549 312 aa7.44□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 CCDC6Q16204 474 aa7.44□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 ARHGAP44Q17R89 818 aa7.44□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC44A4Q53GD3 710 aa7.44□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 XKR9Q5GH70 373 aa7.44□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa7.44□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 LRRC31Q6UY01 552 aa7.44□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 KDM7AQ6ZMT4 941 aa7.44□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 TAS1R1Q7RTX1 841 aa7.44□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 HAUS6Q7Z4H7 955 aa7.44□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 NT5DC3Q86UY8 548 aa7.44□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 HOOK3Q86VS8 718 aa7.44□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 PALB2Q86YC2 1186 aa7.44□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF280BQ86YH2 543 aa7.44□□□□□ -1.22
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SMARCE1-201ENST00000264640 IQCKQ8N0W5 287 aa7.44□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 MCPH1Q8NEM0 835 aa7.44□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC35G2Q8TBE7 412 aa7.44□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 HDAC7Q8WUI4 952 aa7.44□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 SPIRE2Q8WWL2 714 aa7.44□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 B3GALT6Q96L58 329 aa7.44□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 IFT74Q96LB3 600 aa7.44□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa7.44□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 NT5C1BQ96P26 610 aa7.44□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 ZIM3Q96PE6 472 aa7.44□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 FIZ1Q96SL8 496 aa7.44□□□□□ -1.22
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