RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261266.9

PTPRB-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 6,110 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-201ENST00000261266 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
PTPRB-201ENST00000261266 KLC1Q07866 573 aa9.35□□□□□ -0.91
PTPRB-201ENST00000261266 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
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PTPRB-201ENST00000261266 OOSP2Q86WS3 158 aa9.35□□□□□ -0.91
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PTPRB-201ENST00000261266 POLIQ9UNA4 740 aa9.34□□□□□ -0.91
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PTPRB-201ENST00000261266 MSCO60682 206 aa9.34□□□□□ -0.91
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PTPRB-201ENST00000261266 KATNAL2Q8IYT4 538 aa9.34□□□□□ -0.91
PTPRB-201ENST00000261266 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP9.34□□□□□ -0.91
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PTPRB-201ENST00000261266 S100A5P33763 92 aa9.34□□□□□ -0.91
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PTPRB-201ENST00000261266 CRLS1Q9UJA2 301 aa9.34□□□□□ -0.91
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PTPRB-201ENST00000261266 ARIH2O95376 493 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRB-201ENST00000261266 FGF19O95750 216 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRB-201ENST00000261266 HMGCRP04035 888 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRB-201ENST00000261266 ABHD2P08910 425 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRB-201ENST00000261266 MAPK8P45983 427 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRB-201ENST00000261266 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
PTPRB-201ENST00000261266 CORO7P57737 925 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRB-201ENST00000261266 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
PTPRB-201ENST00000261266 FAM182BQ5T319 152 aa9.33□□□□□ -0.92
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