RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000259008.6

BRIP1-201, Transcript of BRCA1 interacting protein C-terminal helicase 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene BRIP1, Length 6,048 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1-201ENST00000259008 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
BRIP1-201ENST00000259008 NUF2Q9BZD4 464 aa6.6□□□□□ -1.35
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BRIP1-201ENST00000259008 UBP1Q9NZI7 540 aa6.6□□□□□ -1.35
BRIP1-201ENST00000259008 GPSM3Q9Y4H4 160 aa6.6□□□□□ -1.35
BRIP1-201ENST00000259008 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
BRIP1-201ENST00000259008 EBAG9O00559 213 aa6.6□□□□□ -1.35
BRIP1-201ENST00000259008 CFLARO15519 480 aa6.6□□□□□ -1.35
BRIP1-201ENST00000259008 KRT37O76014 449 aa6.6□□□□□ -1.35
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BRIP1-201ENST00000259008 P3H1Q32P28 736 aa6.6□□□□□ -1.35
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BRIP1-201ENST00000259008 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
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BRIP1-201ENST00000259008 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa6.6□□□□□ -1.35
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BRIP1-201ENST00000259008 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
BRIP1-201ENST00000259008 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
BRIP1-201ENST00000259008 ACAD10Q6JQN1 1059 aa6.6□□□□□ -1.35
BRIP1-201ENST00000259008 PKN3Q6P5Z2 889 aa6.6□□□□□ -1.35
BRIP1-201ENST00000259008 NT5DC4Q86YG4 428 aa6.6□□□□□ -1.35
BRIP1-201ENST00000259008 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
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BRIP1-201ENST00000259008 B3GALT6Q96L58 329 aa6.6□□□□□ -1.35
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BRIP1-201ENST00000259008 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa6.6□□□□□ -1.35
BRIP1-201ENST00000259008 CNTNAP1P78357 1384 aa6.6□□□□□ -1.35
BRIP1-201ENST00000259008 RGPD2P0DJD1 1756 aa6.6□□□□□ -1.35
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BRIP1-201ENST00000259008 SNAP47Q5SQN1 464 aa6.6□□□□□ -1.35
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BRIP1-201ENST00000259008 MTFR1Q15390 333 aa6.59□□□□□ -1.35
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BRIP1-201ENST00000259008 ABRAQ8N0Z2 381 aa6.59□□□□□ -1.35
BRIP1-201ENST00000259008 NUP93Q8N1F7 819 aa6.59□□□□□ -1.35
BRIP1-201ENST00000259008 FICDQ9BVA6 458 aa6.59□□□□□ -1.35
BRIP1-201ENST00000259008 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
BRIP1-201ENST00000259008 TKTL2Q9H0I9 626 aa6.59□□□□□ -1.35
BRIP1-201ENST00000259008 TMEM134Q9H6X4 195 aa6.59□□□□□ -1.35
BRIP1-201ENST00000259008 SOHLH2Q9NX45 425 aa6.59□□□□□ -1.35
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