RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258424.2

COX5B-201, Transcript of cytochrome c oxidase subunit 5B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene COX5B, Length 712 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX5B-201ENST00000258424 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
COX5B-201ENST00000258424 COMMD8Q9NX08 183 aa22.21■■□□□ 1.15
COX5B-201ENST00000258424 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa22.21■■□□□ 1.15
COX5B-201ENST00000258424 GMIPQ9P107 970 aa22.21■■□□□ 1.15
COX5B-201ENST00000258424 HESX1Q9UBX0 185 aa22.21■■□□□ 1.15
COX5B-201ENST00000258424 DUSP12Q9UNI6 340 aa22.21■■□□□ 1.15
COX5B-201ENST00000258424 PIEZO1Q92508 2521 aa22.21■■□□□ 1.15
COX5B-201ENST00000258424 ZNF840PA6NDX5 716 aa22.2■■□□□ 1.14
COX5B-201ENST00000258424 H0Y858 1186 aa22.2■■□□□ 1.14
COX5B-201ENST00000258424 M0QYV0 167 aa22.2■■□□□ 1.14
COX5B-201ENST00000258424 CYP26A1O43174 497 aa22.2■■□□□ 1.14
COX5B-201ENST00000258424 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
COX5B-201ENST00000258424 RFX1P22670 979 aa22.2■■□□□ 1.14
COX5B-201ENST00000258424 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP22.2■■□□□ 1.149e-9■■■□□ 17.6
COX5B-201ENST00000258424 PGFP49763 221 aa22.2■■□□□ 1.14
COX5B-201ENST00000258424 CLCN5P51795 746 aa22.2■■□□□ 1.14
COX5B-201ENST00000258424 KIF11P52732 1056 aa22.2■■□□□ 1.14
COX5B-201ENST00000258424 CNGA2Q16280 664 aa22.2■■□□□ 1.14
COX5B-201ENST00000258424 CMTM8Q8IZV2 173 aa22.2■■□□□ 1.14
COX5B-201ENST00000258424 TMEM105Q8N8V8 129 aa22.2■■□□□ 1.14
COX5B-201ENST00000258424 ELSPBP1Q96BH3 223 aa22.2■■□□□ 1.14
COX5B-201ENST00000258424 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
COX5B-201ENST00000258424 TSPY26PQ9H489 355 aa22.2■■□□□ 1.14
COX5B-201ENST00000258424 ZFP14Q9HCL3 533 aa22.2■■□□□ 1.14
COX5B-201ENST00000258424 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
COX5B-201ENST00000258424 CFHP08603 1231 aa22.19■■□□□ 1.14
COX5B-201ENST00000258424 WEE1P30291 646 aa22.19■■□□□ 1.14
COX5B-201ENST00000258424 GNA15P30679 374 aa22.19■■□□□ 1.14
COX5B-201ENST00000258424 STILQ15468 1287 aa22.19■■□□□ 1.14
COX5B-201ENST00000258424 VITQ6UXI7 678 aa22.19■■□□□ 1.14
COX5B-201ENST00000258424 FAM71AQ8IYT1 594 aa22.19■■□□□ 1.14
COX5B-201ENST00000258424 FLCNQ8NFG4 579 aa22.19■■□□□ 1.14
COX5B-201ENST00000258424 OVCA2Q8WZ82 227 aa22.19■■□□□ 1.14
COX5B-201ENST00000258424 LRRC3BQ96PB8 259 aa22.19■■□□□ 1.14
COX5B-201ENST00000258424 CYP2S1Q96SQ9 504 aa22.19■■□□□ 1.14
COX5B-201ENST00000258424 UBXN6Q9BZV1 441 aa22.19■■□□□ 1.14
COX5B-201ENST00000258424 FBXO44Q9H4M3 255 aa22.19■■□□□ 1.14
COX5B-201ENST00000258424 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
COX5B-201ENST00000258424 FBXL21Q9UKT6 434 aa22.19■■□□□ 1.14
COX5B-201ENST00000258424 CCL26Q9Y258 94 aa22.19■■□□□ 1.14
COX5B-201ENST00000258424 COL4A2P08572 1712 aa22.19■■□□□ 1.14
COX5B-201ENST00000258424 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa22.18■■□□□ 1.14
COX5B-201ENST00000258424 A0A1B0GTH6 734 aa22.18■■□□□ 1.14
COX5B-201ENST00000258424 SOBPA7XYQ1 873 aa22.18■■□□□ 1.14
COX5B-201ENST00000258424 HEPACAM2A8MVW5 462 aa22.18■■□□□ 1.14
COX5B-201ENST00000258424 THAP12O43422 761 aa22.18■■□□□ 1.14
COX5B-201ENST00000258424 ABL1P00519 1130 aa22.18■■□□□ 1.14
COX5B-201ENST00000258424 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa22.18■■□□□ 1.14
COX5B-201ENST00000258424 SETSIPP0DME0 302 aa22.18■■□□□ 1.14
COX5B-201ENST00000258424 CLCN1P35523 988 aa22.18■■□□□ 1.14
COX5B-201ENST00000258424 PLA2G4AP47712 749 aa22.18■■□□□ 1.14
COX5B-201ENST00000258424 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
COX5B-201ENST00000258424 GRM2Q14416 872 aa22.18■■□□□ 1.14
COX5B-201ENST00000258424 RAB41Q5JT25 222 aa22.18■■□□□ 1.14
COX5B-201ENST00000258424 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
COX5B-201ENST00000258424 PDZD8Q8NEN9 1154 aa22.18■■□□□ 1.14
COX5B-201ENST00000258424 RIN3Q8TB24 985 aa22.18■■□□□ 1.14
COX5B-201ENST00000258424 ZNF606Q8WXB4 792 aa22.18■■□□□ 1.14
COX5B-201ENST00000258424 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
COX5B-201ENST00000258424 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
COX5B-201ENST00000258424 STK33Q9BYT3 514 aa22.18■■□□□ 1.14
COX5B-201ENST00000258424 FAM86C1Q9NVL1 165 aa22.18■■□□□ 1.14
COX5B-201ENST00000258424 ZMYM5Q9UJ78 669 aa22.18■■□□□ 1.14
COX5B-201ENST00000258424 SCML2Q9UQR0 700 aa22.18■■□□□ 1.14
COX5B-201ENST00000258424 USP3Q9Y6I4 520 aa22.18■■□□□ 1.14
COX5B-201ENST00000258424 F8VZ95 297 aa22.17■■□□□ 1.14
COX5B-201ENST00000258424 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa22.17■■□□□ 1.14
COX5B-201ENST00000258424 GABBR2O75899 941 aa22.17■■□□□ 1.14
COX5B-201ENST00000258424 OAS1P00973 400 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
COX5B-201ENST00000258424 AVPR1AP37288 418 aa22.17■■□□□ 1.14
COX5B-201ENST00000258424 PPP3CCP48454 512 aa22.17■■□□□ 1.14
COX5B-201ENST00000258424 SLC8A3P57103 927 aa22.17■■□□□ 1.14
COX5B-201ENST00000258424 TPM4P67936 248 aa22.17■■□□□ 1.14
COX5B-201ENST00000258424 FANCCQ00597 558 aa22.17■■□□□ 1.14
COX5B-201ENST00000258424 DENND1BQ6P3S1 775 aa22.17■■□□□ 1.14
COX5B-201ENST00000258424 SLC47A2Q86VL8 602 aa22.17■■□□□ 1.14
COX5B-201ENST00000258424 NEK11Q8NG66 645 aa22.17■■□□□ 1.14
COX5B-201ENST00000258424 SLC35F5Q8WV83 523 aa22.17■■□□□ 1.14
COX5B-201ENST00000258424 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
COX5B-201ENST00000258424 NMUR1Q9HB89 426 aa22.17■■□□□ 1.14
COX5B-201ENST00000258424 NLRC4Q9NPP4 1024 aa22.17■■□□□ 1.14
COX5B-201ENST00000258424 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa22.17■■□□□ 1.14
COX5B-201ENST00000258424 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa22.16■■□□□ 1.14
COX5B-201ENST00000258424 OLFM2O95897 454 aa22.16■■□□□ 1.14
COX5B-201ENST00000258424 CKMP06732 381 aa22.16■■□□□ 1.14
COX5B-201ENST00000258424 SRFP11831 508 aa22.16■■□□□ 1.14
COX5B-201ENST00000258424 RGS7P49802 495 aa22.16■■□□□ 1.14
COX5B-201ENST00000258424 TKTL1P51854 596 aa22.16■■□□□ 1.14
COX5B-201ENST00000258424 JAM2P57087 298 aa22.16■■□□□ 1.14
COX5B-201ENST00000258424 ZNF445P59923 1031 aa22.16■■□□□ 1.14
COX5B-201ENST00000258424 SNX30Q5VWJ9 437 aa22.16■■□□□ 1.14
COX5B-201ENST00000258424 SMYD5Q6GMV2 418 aa22.16■■□□□ 1.14
COX5B-201ENST00000258424 PMF1Q6P1K2 205 aa22.16■■□□□ 1.14
COX5B-201ENST00000258424 CCDC186Q7Z3E2 898 aa22.16■■□□□ 1.14
COX5B-201ENST00000258424 RNF38Q9H0F5 515 aa22.16■■□□□ 1.14
COX5B-201ENST00000258424 OSER1Q9NX31 292 aa22.16■■□□□ 1.14
COX5B-201ENST00000258424 COL4A3Q01955 1670 aa22.16■■□□□ 1.14
COX5B-201ENST00000258424 SERPINC1P01008 464 aa22.15■■□□□ 1.14
COX5B-201ENST00000258424 USP17L7P0C7H9 530 aa22.15■■□□□ 1.14
COX5B-201ENST00000258424 HDCP19113 662 aa22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.1 ms