RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258148.11

MDM2-201, Transcript of MDM2 proto-oncogene, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene MDM2, Length 1,361 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2-201ENST00000258148 HARS2P49590 506 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
MDM2-201ENST00000258148 PLIN5Q00G26 463 aa6.62□□□□□ -1.35
MDM2-201ENST00000258148 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP6.62□□□□□ -1.355e-7■■■□□ 15
MDM2-201ENST00000258148 CHAF1BQ13112 559 aa6.62□□□□□ -1.35
MDM2-201ENST00000258148 PDPRQ8NCN5 879 aa6.62□□□□□ -1.35
MDM2-201ENST00000258148 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
MDM2-201ENST00000258148 MCRS1Q96EZ8 462 aa6.62□□□□□ -1.35
MDM2-201ENST00000258148 FEM1CQ96JP0 617 aa6.62□□□□□ -1.35
MDM2-201ENST00000258148 CDHR1Q96JP9 859 aa6.62□□□□□ -1.35
MDM2-201ENST00000258148 WDR24Q96S15 920 aa6.62□□□□□ -1.35
MDM2-201ENST00000258148 NUDT22Q9BRQ3 303 aa6.62□□□□□ -1.35
MDM2-201ENST00000258148 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa6.62□□□□□ -1.35
MDM2-201ENST00000258148 SIK2Q9H0K1 926 aa6.62□□□□□ -1.35
MDM2-201ENST00000258148 OR10A4Q9H209 315 aa6.62□□□□□ -1.35
MDM2-201ENST00000258148 PDCL3Q9H2J4 239 aa6.62□□□□□ -1.35
MDM2-201ENST00000258148 GSTO2Q9H4Y5 243 aa6.62□□□□□ -1.35
MDM2-201ENST00000258148 PLEKHA2Q9HB19 425 aa6.62□□□□□ -1.35
MDM2-201ENST00000258148 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
MDM2-201ENST00000258148 ERVK-5Q9HDB9 667 aa6.62□□□□□ -1.35
MDM2-201ENST00000258148 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa6.62□□□□□ -1.35
MDM2-201ENST00000258148 ZSCAN32Q9NX65 697 aa6.62□□□□□ -1.35
MDM2-201ENST00000258148 ETAA1Q9NY74 926 aa6.62□□□□□ -1.35
MDM2-201ENST00000258148 CROTQ9UKG9 612 aa6.62□□□□□ -1.35
MDM2-201ENST00000258148 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
MDM2-201ENST00000258148 TMEM5Q9Y2B1 443 aa6.62□□□□□ -1.35
MDM2-201ENST00000258148 SNX5Q9Y5X3 404 aa6.62□□□□□ -1.35
MDM2-201ENST00000258148 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
MDM2-201ENST00000258148 CDHR4A6H8M9 788 aa6.61□□□□□ -1.35
MDM2-201ENST00000258148 SLC38A8A6NNN8 435 aa6.61□□□□□ -1.35
MDM2-201ENST00000258148 NRP1O14786 923 aa6.61□□□□□ -1.35
MDM2-201ENST00000258148 TGFB1I1O43294 461 aa6.61□□□□□ -1.35
MDM2-201ENST00000258148 CBFA2T3O75081 653 aa6.61□□□□□ -1.35
MDM2-201ENST00000258148 CER1O95813 267 aa6.61□□□□□ -1.35
MDM2-201ENST00000258148 JUNP05412 331 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
MDM2-201ENST00000258148 DPP6P42658 865 aa6.61□□□□□ -1.35
MDM2-201ENST00000258148 PAFAH1B1P43034 410 aa6.61□□□□□ -1.35
MDM2-201ENST00000258148 MRE11P49959 708 aa6.61□□□□□ -1.35
MDM2-201ENST00000258148 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
MDM2-201ENST00000258148 EPS8Q12929 822 aa6.61□□□□□ -1.35
MDM2-201ENST00000258148 ACAP1Q15027 740 aa6.61□□□□□ -1.35
MDM2-201ENST00000258148 LIPMQ5VYY2 423 aa6.61□□□□□ -1.35
MDM2-201ENST00000258148 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
MDM2-201ENST00000258148 NFXL1Q6ZNB6 911 aa6.61□□□□□ -1.35
MDM2-201ENST00000258148 FAM47EQ6ZV65 393 aa6.61□□□□□ -1.35
MDM2-201ENST00000258148 KDELC2Q7Z4H8 507 aa6.61□□□□□ -1.35
MDM2-201ENST00000258148 TRABD2AQ86V40 505 aa6.61□□□□□ -1.35
MDM2-201ENST00000258148 RTKN2Q8IZC4 609 aa6.61□□□□□ -1.35
MDM2-201ENST00000258148 LRRC71Q8N4P6 559 aa6.61□□□□□ -1.35
MDM2-201ENST00000258148 SLC17A8Q8NDX2 589 aa6.61□□□□□ -1.35
MDM2-201ENST00000258148 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa6.61□□□□□ -1.35
MDM2-201ENST00000258148 BPIFB1Q8TDL5 484 aa6.61□□□□□ -1.35
MDM2-201ENST00000258148 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
MDM2-201ENST00000258148 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
MDM2-201ENST00000258148 CALML4Q96GE6 196 aa6.61□□□□□ -1.35
MDM2-201ENST00000258148 ZDHHC12Q96GR4 267 aa6.61□□□□□ -1.35
MDM2-201ENST00000258148 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
MDM2-201ENST00000258148 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
MDM2-201ENST00000258148 SLC46A1Q96NT5 459 aa6.61□□□□□ -1.35
MDM2-201ENST00000258148 SIL1Q9H173 461 aa6.61□□□□□ -1.35
MDM2-201ENST00000258148 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
MDM2-201ENST00000258148 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa6.61□□□□□ -1.35
MDM2-201ENST00000258148 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
MDM2-201ENST00000258148 PJA2O43164 708 aa6.6□□□□□ -1.35
MDM2-201ENST00000258148 TNFSF14O43557 240 aa6.6□□□□□ -1.35
MDM2-201ENST00000258148 TSPAN9O75954 239 aa6.6□□□□□ -1.35
MDM2-201ENST00000258148 RASAL1O95294 804 aa6.6□□□□□ -1.35
MDM2-201ENST00000258148 PRNPP04156 253 aa6.6□□□□□ -1.35
MDM2-201ENST00000258148 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
MDM2-201ENST00000258148 ALAS1P13196 640 aa6.6□□□□□ -1.35
MDM2-201ENST00000258148 ATF2P15336 505 aa6.6□□□□□ -1.35
MDM2-201ENST00000258148 NNMTP40261 264 aa6.6□□□□□ -1.35
MDM2-201ENST00000258148 GATA4P43694 442 aa6.6□□□□□ -1.35
MDM2-201ENST00000258148 GZMKP49863 264 aa6.6□□□□□ -1.35
MDM2-201ENST00000258148 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
MDM2-201ENST00000258148 SNX16P57768 344 aa6.6□□□□□ -1.35
MDM2-201ENST00000258148 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
MDM2-201ENST00000258148 TMEM62Q0P6H9 643 aa6.6□□□□□ -1.35
MDM2-201ENST00000258148 STK4Q13043 487 aa6.6□□□□□ -1.35
MDM2-201ENST00000258148 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
MDM2-201ENST00000258148 CAMK1Q14012 370 aa6.6□□□□□ -1.35
MDM2-201ENST00000258148 DCTN1Q14203 1278 aa6.6□□□□□ -1.35
MDM2-201ENST00000258148 IQCB1Q15051 598 aa6.6□□□□□ -1.35
MDM2-201ENST00000258148 NFIL3Q16649 462 aa6.6□□□□□ -1.35
MDM2-201ENST00000258148 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
MDM2-201ENST00000258148 MSANTD2Q6P1R3 559 aa6.6□□□□□ -1.35
MDM2-201ENST00000258148 NDUFAF2Q8N183 169 aa6.6□□□□□ -1.35
MDM2-201ENST00000258148 FAM71DQ8N9W8 422 aa6.6□□□□□ -1.35
MDM2-201ENST00000258148 AFAP1L1Q8TED9 768 aa6.6□□□□□ -1.35
MDM2-201ENST00000258148 HMGB4Q8WW32 186 aa6.6□□□□□ -1.35
MDM2-201ENST00000258148 LPPQ93052 612 aa6.6□□□□□ -1.35
MDM2-201ENST00000258148 PERPQ96FX8 193 aa6.6□□□□□ -1.35
MDM2-201ENST00000258148 MOGAT1Q96PD6 335 aa6.6□□□□□ -1.35
MDM2-201ENST00000258148 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
MDM2-201ENST00000258148 IMPG2Q9BZV3 1241 aa6.6□□□□□ -1.35
MDM2-201ENST00000258148 TTYH3Q9C0H2 523 aa6.6□□□□□ -1.35
MDM2-201ENST00000258148 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
MDM2-201ENST00000258148 ABCF3Q9NUQ8 709 aa6.6□□□□□ -1.35
MDM2-201ENST00000258148 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
MDM2-201ENST00000258148 DNAJB11Q9UBS4 358 aa6.6□□□□□ -1.35
MDM2-201ENST00000258148 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
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