RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000239223.3

DUSP1-201, Transcript of dual specificity phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene DUSP1, Length 2,019 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1-201ENST00000239223 FGGP02679 453 aa20.12■□□□□ 0.81
DUSP1-201ENST00000239223 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
DUSP1-201ENST00000239223 RWDD2BP57060 319 aa20.12■□□□□ 0.81
DUSP1-201ENST00000239223 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
DUSP1-201ENST00000239223 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
DUSP1-201ENST00000239223 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
DUSP1-201ENST00000239223 SMTNL2Q2TAL5 461 aa20.12■□□□□ 0.81
DUSP1-201ENST00000239223 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa20.12■□□□□ 0.81
DUSP1-201ENST00000239223 C4orf50Q6ZRC1 276 aa20.12■□□□□ 0.81
DUSP1-201ENST00000239223 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
DUSP1-201ENST00000239223 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa20.12■□□□□ 0.81
DUSP1-201ENST00000239223 SCN4BQ8IWT1 228 aa20.12■□□□□ 0.81
DUSP1-201ENST00000239223 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa20.12■□□□□ 0.81
DUSP1-201ENST00000239223 ACTRT1Q8TDG2 376 aa20.12■□□□□ 0.81
DUSP1-201ENST00000239223 AUTS2Q8WXX7 1259 aa20.12■□□□□ 0.81
DUSP1-201ENST00000239223 FAM149B1Q96BN6 582 aa20.12■□□□□ 0.81
DUSP1-201ENST00000239223 PEBP4Q96S96 227 aa20.12■□□□□ 0.81
DUSP1-201ENST00000239223 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa20.12■□□□□ 0.81
DUSP1-201ENST00000239223 PCSK1NQ9UHG2 260 aa20.12■□□□□ 0.81
DUSP1-201ENST00000239223 CDY1Q9Y6F8 540 aa20.12■□□□□ 0.81
DUSP1-201ENST00000239223 MYO16Q9Y6X6 1858 aa20.12■□□□□ 0.81
DUSP1-201ENST00000239223 EFCAB8A8MWE9 144 aa20.12■□□□□ 0.81
DUSP1-201ENST00000239223 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
DUSP1-201ENST00000239223 CPB1P15086 417 aa20.12■□□□□ 0.81
DUSP1-201ENST00000239223 GRIK1P39086 918 aa20.12■□□□□ 0.81
DUSP1-201ENST00000239223 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
DUSP1-201ENST00000239223 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
DUSP1-201ENST00000239223 DDR2Q16832 855 aa20.12■□□□□ 0.81
DUSP1-201ENST00000239223 USP41Q3LFD5 358 aa20.12■□□□□ 0.81
DUSP1-201ENST00000239223 KCNT1Q5JUK3 1230 aa20.12■□□□□ 0.81
DUSP1-201ENST00000239223 RHOT1Q8IXI2 618 aa20.12■□□□□ 0.81
DUSP1-201ENST00000239223 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
DUSP1-201ENST00000239223 CHST7Q9NS84 486 aa20.12■□□□□ 0.81
DUSP1-201ENST00000239223 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa20.12■□□□□ 0.81
DUSP1-201ENST00000239223 REV3LO60673 3130 aa20.11■□□□□ 0.81
DUSP1-201ENST00000239223 OR6C75A6NL08 312 aa20.11■□□□□ 0.81
DUSP1-201ENST00000239223 PI4K2BG5E9Z4 385 aa20.11■□□□□ 0.81
DUSP1-201ENST00000239223 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
DUSP1-201ENST00000239223 PSTPIP1O43586 416 aa20.11■□□□□ 0.81
DUSP1-201ENST00000239223 MIPP30301 263 aa20.11■□□□□ 0.81
DUSP1-201ENST00000239223 PAFAH1B1P43034 410 aa20.11■□□□□ 0.81
DUSP1-201ENST00000239223 DAOAP59103 153 aa20.11■□□□□ 0.81
DUSP1-201ENST00000239223 GPR152Q8TDT2 470 aa20.11■□□□□ 0.81
DUSP1-201ENST00000239223 TMEM169Q96HH4 297 aa20.11■□□□□ 0.81
DUSP1-201ENST00000239223 CNPY3Q9BT09 278 aa20.11■□□□□ 0.81
DUSP1-201ENST00000239223 ZWILCHQ9H900 591 aa20.11■□□□□ 0.81
DUSP1-201ENST00000239223 FYNP06241 537 aa20.1■□□□□ 0.81
DUSP1-201ENST00000239223 PGFP49763 221 aa20.1■□□□□ 0.81
DUSP1-201ENST00000239223 SNX16P57768 344 aa20.1■□□□□ 0.81
DUSP1-201ENST00000239223 PSMD5Q16401 504 aa20.1■□□□□ 0.81
DUSP1-201ENST00000239223 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
DUSP1-201ENST00000239223 ANKS3Q6ZW76 656 aa20.1■□□□□ 0.81
DUSP1-201ENST00000239223 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
DUSP1-201ENST00000239223 SPRED2Q7Z698 418 aa20.1■□□□□ 0.81
DUSP1-201ENST00000239223 DEFB106AQ8N104 65 aa20.1■□□□□ 0.81
DUSP1-201ENST00000239223 GOLGA1Q92805 767 aa20.1■□□□□ 0.81
DUSP1-201ENST00000239223 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
DUSP1-201ENST00000239223 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
DUSP1-201ENST00000239223 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa20.1■□□□□ 0.81
DUSP1-201ENST00000239223 MTMR11A4FU01 709 aa20.1■□□□□ 0.81
DUSP1-201ENST00000239223 TNFRSF10BO14763 440 aa20.1■□□□□ 0.81
DUSP1-201ENST00000239223 LAG3P18627 525 aa20.1■□□□□ 0.81
DUSP1-201ENST00000239223 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
DUSP1-201ENST00000239223 SYPL2Q5VXT5 272 aa20.1■□□□□ 0.81
DUSP1-201ENST00000239223 FBXO22Q8NEZ5 403 aa20.1■□□□□ 0.81
DUSP1-201ENST00000239223 FAM172AQ8WUF8 416 aa20.1■□□□□ 0.81
DUSP1-201ENST00000239223 ZBED2Q9BTP6 218 aa20.1■□□□□ 0.81
DUSP1-201ENST00000239223 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa20.1■□□□□ 0.81
DUSP1-201ENST00000239223 MYO7AQ13402 2215 aa20.1■□□□□ 0.81
DUSP1-201ENST00000239223 WDR27A2RRH5 827 aa20.09■□□□□ 0.81
DUSP1-201ENST00000239223 DPYSL4O14531 572 aa20.09■□□□□ 0.81
DUSP1-201ENST00000239223 SOD2P04179 222 aa20.09■□□□□ 0.81
DUSP1-201ENST00000239223 SDC4P31431 198 aa20.09■□□□□ 0.81
DUSP1-201ENST00000239223 SLC5A3P53794 718 aa20.09■□□□□ 0.81
DUSP1-201ENST00000239223 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
DUSP1-201ENST00000239223 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
DUSP1-201ENST00000239223 HERC6Q8IVU3 1022 aa20.09■□□□□ 0.81
DUSP1-201ENST00000239223 HERVK_113Q902F9 699 aa20.09■□□□□ 0.81
DUSP1-201ENST00000239223 RAPGEF5Q92565 580 aa20.09■□□□□ 0.81
DUSP1-201ENST00000239223 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
DUSP1-201ENST00000239223 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
DUSP1-201ENST00000239223 UBXN6Q9BZV1 441 aa20.09■□□□□ 0.81
DUSP1-201ENST00000239223 SPG21Q9NZD8 308 aa20.09■□□□□ 0.81
DUSP1-201ENST00000239223 MTRRQ9UBK8 725 aa20.09■□□□□ 0.81
DUSP1-201ENST00000239223 ZBED1O96006 694 aa20.09■□□□□ 0.81
DUSP1-201ENST00000239223 RHOXF2BP0C7M4 288 aa20.09■□□□□ 0.81
DUSP1-201ENST00000239223 DNAJB2P25686 324 aa20.09■□□□□ 0.81
DUSP1-201ENST00000239223 OR1D2P34982 312 aa20.09■□□□□ 0.81
DUSP1-201ENST00000239223 SCNN1AP37088 669 aa20.09■□□□□ 0.81
DUSP1-201ENST00000239223 HDAC4P56524 1084 aa20.09■□□□□ 0.81
DUSP1-201ENST00000239223 ROR1Q01973 937 aa20.09■□□□□ 0.81
DUSP1-201ENST00000239223 GPR17Q13304 367 aa20.09■□□□□ 0.81
DUSP1-201ENST00000239223 LONRF2Q1L5Z9 754 aa20.09■□□□□ 0.81
DUSP1-201ENST00000239223 KATNAL2Q8IYT4 538 aa20.09■□□□□ 0.81
DUSP1-201ENST00000239223 PIK3R5Q8WYR1 880 aa20.09■□□□□ 0.81
DUSP1-201ENST00000239223 UBXN4Q92575 508 aa20.09■□□□□ 0.81
DUSP1-201ENST00000239223 TBCBQ99426 244 aa20.09■□□□□ 0.81
DUSP1-201ENST00000239223 HINFPQ9BQA5 517 aa20.09■□□□□ 0.81
DUSP1-201ENST00000239223 RHOXF2Q9BQY4 288 aa20.09■□□□□ 0.81
DUSP1-201ENST00000239223 CNGB3Q9NQW8 809 aa20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.7 ms