RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000155840.9

KCNQ1-201, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCNQ1, Length 3,245 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-201ENST00000155840 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa18.09■□□□□ 0.49
KCNQ1-201ENST00000155840 VSIG10LQ86VR7 867 aa18.09■□□□□ 0.49
KCNQ1-201ENST00000155840 SH3TC2Q8TF17 1288 aa18.09■□□□□ 0.49
KCNQ1-201ENST00000155840 ACSS3Q9H6R3 686 aa18.09■□□□□ 0.49
KCNQ1-201ENST00000155840 FAM49BQ9NUQ9 324 aa18.09■□□□□ 0.49
KCNQ1-201ENST00000155840 ACTL7BQ9Y614 415 aa18.09■□□□□ 0.49
KCNQ1-201ENST00000155840 CCDC160A6NGH7 325 aa18.08■□□□□ 0.49
KCNQ1-201ENST00000155840 A6NHS1 94 aa18.08■□□□□ 0.49
KCNQ1-201ENST00000155840 VWA5AO00534 786 aa18.08■□□□□ 0.49
KCNQ1-201ENST00000155840 KCNA2P16389 499 aa18.08■□□□□ 0.49
KCNQ1-201ENST00000155840 MUTP22033 750 aa18.08■□□□□ 0.49
KCNQ1-201ENST00000155840 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.49
KCNQ1-201ENST00000155840 IL31Q6EBC2 164 aa18.08■□□□□ 0.49
KCNQ1-201ENST00000155840 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa18.08■□□□□ 0.49
KCNQ1-201ENST00000155840 NAT8LQ8N9F0 302 aa18.08■□□□□ 0.49
KCNQ1-201ENST00000155840 SMC1BQ8NDV3 1235 aa18.08■□□□□ 0.49
KCNQ1-201ENST00000155840 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa18.08■□□□□ 0.49
KCNQ1-201ENST00000155840 SIPA1L1O43166 1804 aa18.08■□□□□ 0.49
KCNQ1-201ENST00000155840 KIF13BQ9NQT8 1826 aa18.08■□□□□ 0.49
KCNQ1-201ENST00000155840 RNF8O76064 485 aa18.08■□□□□ 0.48
KCNQ1-201ENST00000155840 ABHD2P08910 425 aa18.08■□□□□ 0.48
KCNQ1-201ENST00000155840 CD1EP15812 388 aa18.08■□□□□ 0.48
KCNQ1-201ENST00000155840 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
KCNQ1-201ENST00000155840 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.48
KCNQ1-201ENST00000155840 CAPSQ13938 189 aa18.08■□□□□ 0.48
KCNQ1-201ENST00000155840 FOXB2Q5VYV0 432 aa18.08■□□□□ 0.48
KCNQ1-201ENST00000155840 GBP5Q96PP8 586 aa18.08■□□□□ 0.48
KCNQ1-201ENST00000155840 PEBP4Q96S96 227 aa18.08■□□□□ 0.48
KCNQ1-201ENST00000155840 ADPGKQ9BRR6 497 aa18.08■□□□□ 0.48
KCNQ1-201ENST00000155840 TRIM4Q9C037 500 aa18.08■□□□□ 0.48
KCNQ1-201ENST00000155840 SMYD2Q9NRG4 433 aa18.08■□□□□ 0.48
KCNQ1-201ENST00000155840 ZNF358Q9NW07 568 aa18.08■□□□□ 0.48
KCNQ1-201ENST00000155840 HMGCRP04035 888 aa18.08■□□□□ 0.48
KCNQ1-201ENST00000155840 DLDP09622 509 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
KCNQ1-201ENST00000155840 SKIP12755 728 aa18.08■□□□□ 0.48
KCNQ1-201ENST00000155840 HSPA1LP34931 641 aa18.08■□□□□ 0.48
KCNQ1-201ENST00000155840 SLC34A1Q06495 639 aa18.08■□□□□ 0.48
KCNQ1-201ENST00000155840 CCDC15Q0P6D6 951 aa18.08■□□□□ 0.48
KCNQ1-201ENST00000155840 HADHQ16836 314 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
KCNQ1-201ENST00000155840 ADGRD1Q6QNK2 874 aa18.08■□□□□ 0.48
KCNQ1-201ENST00000155840 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.48
KCNQ1-201ENST00000155840 FBXO41Q8TF61 875 aa18.08■□□□□ 0.48
KCNQ1-201ENST00000155840 SHOC2Q9UQ13 582 aa18.08■□□□□ 0.48
KCNQ1-201ENST00000155840 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa18.08■□□□□ 0.48
KCNQ1-201ENST00000155840 DGKIO75912 1065 aa18.07■□□□□ 0.48
KCNQ1-201ENST00000155840 CALB1P05937 261 aa18.07■□□□□ 0.48
KCNQ1-201ENST00000155840 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
KCNQ1-201ENST00000155840 SERPINB6P35237 376 aa18.07■□□□□ 0.48
KCNQ1-201ENST00000155840 NUMBP49757 651 aa18.07■□□□□ 0.48
KCNQ1-201ENST00000155840 ROR1Q01973 937 aa18.07■□□□□ 0.48
KCNQ1-201ENST00000155840 EEF1DP3Q658K8 133 aa18.07■□□□□ 0.48
KCNQ1-201ENST00000155840 ZNF276Q8N554 614 aa18.07■□□□□ 0.48
KCNQ1-201ENST00000155840 C7orf31Q8N865 590 aa18.07■□□□□ 0.48
KCNQ1-201ENST00000155840 SLC35B2Q8TB61 432 aa18.07■□□□□ 0.48
KCNQ1-201ENST00000155840 USP18Q9UMW8 372 aa18.07■□□□□ 0.48
KCNQ1-201ENST00000155840 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa18.07■□□□□ 0.48
KCNQ1-201ENST00000155840 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa18.07■□□□□ 0.48
KCNQ1-201ENST00000155840 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa18.07■□□□□ 0.48
KCNQ1-201ENST00000155840 LY6KQ17RY6 165 aa18.07■□□□□ 0.48
KCNQ1-201ENST00000155840 ZNF677Q86XU0 584 aa18.07■□□□□ 0.48
KCNQ1-201ENST00000155840 KRT82Q9NSB4 513 aa18.07■□□□□ 0.48
KCNQ1-201ENST00000155840 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
KCNQ1-201ENST00000155840 SLC24A2Q9UI40 661 aa18.07■□□□□ 0.48
KCNQ1-201ENST00000155840 MAGEB2O15479 319 aa18.06■□□□□ 0.48
KCNQ1-201ENST00000155840 HCRTO43612 131 aa18.06■□□□□ 0.48
KCNQ1-201ENST00000155840 ITM2AO43736 263 aa18.06■□□□□ 0.48
KCNQ1-201ENST00000155840 CSH1P0DML2 217 aa18.06■□□□□ 0.48
KCNQ1-201ENST00000155840 CSH2P0DML3 217 aa18.06■□□□□ 0.48
KCNQ1-201ENST00000155840 PDGFRAP16234 1089 aa18.06■□□□□ 0.48
KCNQ1-201ENST00000155840 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP18.06■□□□□ 0.48
KCNQ1-201ENST00000155840 CA9Q16790 459 aa18.06■□□□□ 0.48
KCNQ1-201ENST00000155840 KLHL38Q2WGJ6 581 aa18.06■□□□□ 0.48
KCNQ1-201ENST00000155840 SPDYE2Q495Y8 402 aa18.06■□□□□ 0.48
KCNQ1-201ENST00000155840 E2F7Q96AV8 911 aa18.06■□□□□ 0.48
KCNQ1-201ENST00000155840 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa18.06■□□□□ 0.48
KCNQ1-201ENST00000155840 CGRRF1Q99675 332 aa18.06■□□□□ 0.48
KCNQ1-201ENST00000155840 B3GNT5Q9BYG0 378 aa18.06■□□□□ 0.48
KCNQ1-201ENST00000155840 DOCK5Q9H7D0 1870 aa18.06■□□□□ 0.48
KCNQ1-201ENST00000155840 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP18.06■□□□□ 0.48
KCNQ1-201ENST00000155840 ADORA2AP29274 412 aa18.06■□□□□ 0.48
KCNQ1-201ENST00000155840 PPM1JQ5JR12 505 aa18.06■□□□□ 0.48
KCNQ1-201ENST00000155840 WASHC2DQ5SRD0 308 aa18.06■□□□□ 0.48
KCNQ1-201ENST00000155840 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP18.06■□□□□ 0.48
KCNQ1-201ENST00000155840 SULF1Q8IWU6 871 aa18.06■□□□□ 0.48
KCNQ1-201ENST00000155840 ADAM32Q8TC27 787 aa18.06■□□□□ 0.48
KCNQ1-201ENST00000155840 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
KCNQ1-201ENST00000155840 FGD4Q96M96 766 aa18.06■□□□□ 0.48
KCNQ1-201ENST00000155840 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa18.06■□□□□ 0.48
KCNQ1-201ENST00000155840 CYLDQ9NQC7 956 aa18.06■□□□□ 0.48
KCNQ1-201ENST00000155840 STBD1O95210 358 aa18.06■□□□□ 0.48
KCNQ1-201ENST00000155840 ITGAVP06756 1048 aa18.06■□□□□ 0.48
KCNQ1-201ENST00000155840 TGFB2P61812 414 aa18.06■□□□□ 0.48
KCNQ1-201ENST00000155840 RAPH1Q70E73 1250 aa18.06■□□□□ 0.48
KCNQ1-201ENST00000155840 MTBPQ96DY7 904 aa18.06■□□□□ 0.48
KCNQ1-201ENST00000155840 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP18.06■□□□□ 0.48
KCNQ1-201ENST00000155840 ITGB3P05106 788 aa18.05■□□□□ 0.48
KCNQ1-201ENST00000155840 CLCN3P51790 818 aa18.05■□□□□ 0.48
KCNQ1-201ENST00000155840 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP18.05■□□□□ 0.48
KCNQ1-201ENST00000155840 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP18.05■□□□□ 0.48
KCNQ1-201ENST00000155840 SCUBE3Q8IX30 993 aa18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.9 ms