RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000039559.8

Thbs1-201, Transcript of Thrombospondin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Thbs1, Length 5,848 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs1-201ENSMUST00000039559 CebpaP53566 359 aa9.63□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Apoa1Q00623 264 aa9.63□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 4930430A15RikQ05AC5 485 aa9.63□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Rgs9bpQ148R9 237 aa9.63□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 WlsQ6DID7 541 aa9.63□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Clca4aQ6Q473 924 aa9.63□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Ccdc63Q8CDV6 558 aa9.63□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Tspan14Q8QZY6 270 aa9.63□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Rps6kl1Q8R2S1 544 aa9.63□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 IrgqQ8VIM9 583 aa9.63□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Nipsnap3bQ9CQE1 247 aa9.63□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Snx10Q9CWT3 201 aa9.63□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 MceeQ9D1I5 178 aa9.63□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Ccdc81Q9D5W4 654 aa9.63□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 ThegQ9JMB1 375 aa9.63□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Uts2Q9QZQ3 123 aa9.63□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 CltcQ68FD5 1675 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Zfp651E9PZ11 729 aa9.63□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Pcdh9F8VPK8 1237 aa9.63□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Vmn2r77L7N2B7 854 aa9.63□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 PigrO70570 771 aa9.63□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Krt6aP50446 553 aa9.63□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Mapk1P63085 358 aa9.63□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Dlgap3Q6PFD5 977 aa9.63□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Olfr212Q7TS33 327 aa9.63□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 SowahdQ8BY98 327 aa9.63□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Prdm8Q8BZ97 687 aa9.63□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Wdr98Q8VC42 657 aa9.63□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Traf7Q922B6 594 aa9.63□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Serbp1Q9CY58 407 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Tubgcp4Q9D4F8 667 aa9.63□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 DcpsQ9DAR7 338 aa9.63□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Psma4Q9R1P0 261 aa9.63□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Ercc6l2Q9JIM3 1537 aa9.63□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Hk2O08528 917 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Rpl36P47964 105 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Fam172aQ3TNH5 417 aa9.62□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 DaglaQ6WQJ1 1044 aa9.62□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Btbd10Q80X66 475 aa9.62□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Teddm1aQ810U2 305 aa9.62□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Mical2Q8BML1 960 aa9.62□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Gprc5cQ8K3J9 440 aa9.62□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Olfr615Q8VGY4 313 aa9.62□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Fam32aQ9CR80 112 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Tssk3Q9D2E1 268 aa9.62□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Oma1Q9D8H7 521 aa9.62□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Prex1Q69ZK0 1650 aa9.62□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Serpinb2P12388 415 aa9.62□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 ItgalP24063 1163 aa9.62□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Atp5bP56480 529 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 SpoplQ2M2N2 392 aa9.62□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Hist2h2acQ64523 129 aa9.62□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Hist2h2aa1Q6GSS7 130 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Olfr698Q7TRN4 311 aa9.62□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Olfr670Q7TRP3 312 aa9.62□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Chtf18Q8BIW9 969 aa9.62□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Dhx32Q8BZS9 744 aa9.62□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 DnerQ8JZM4 737 aa9.62□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Kct2Q8K201 259 aa9.62□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Trappc12Q8K2L8 797 aa9.62□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 ScgnQ91WD9 276 aa9.62□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Serpina3nQ91WP6 418 aa9.62□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Gpatch1Q9DBM1 930 aa9.62□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Ddx21Q9JIK5 851 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Tmem59Q9QY73 323 aa9.62□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Dlc1Q9R0Z9 1092 aa9.62□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 ShprhQ7TPQ3 1674 aa9.62□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Pcna-ps2A0A140T8V5 261 aa9.62□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Erich1E9PY43 332 aa9.62□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Gm8267E9Q207 261 aa9.62□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Slc27a2O35488 620 aa9.62□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Fgl2P12804 432 aa9.62□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Ogfod1Q3U0K8 545 aa9.62□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Fam83fQ3UKU4 495 aa9.62□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Zfp90Q61967 636 aa9.62□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Magee1Q6PCZ4 918 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Pip5kl1Q6U7H8 395 aa9.62□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Chsy1Q6ZQ11 800 aa9.62□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Dusp4Q8BFV3 398 aa9.62□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Slc47a1Q8K0H1 567 aa9.62□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Trmt11Q9CWH5 460 aa9.62□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Ttc30bQ9CY00 664 aa9.62□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Zfp655Q9CZP3 541 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Ndufs3Q9DCT2 263 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Ptpn4Q9WU22 926 aa9.62□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Sbno2Q7TNB8 1349 aa9.62□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Parp14Q2EMV9 1817 aa9.62□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 AglF8VPN4 1532 aa9.62□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Zcchc7B1AX39 541 aa9.62□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Shoc2O88520 582 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Tbx3P70324 741 aa9.62□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 NfibP97863 570 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Rbp1Q00915 135 aa9.62□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Nudt18Q3U2V3 323 aa9.62□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Brd9Q3UQU0 596 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 MyrfQ3UR85 1138 aa9.62□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Mief2Q5NCS9 454 aa9.62□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Casc4Q6P2L7 435 aa9.62□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Usp1Q8BJQ2 784 aa9.62□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Gtf2a1lQ8R4I4 468 aa9.62□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 21.4 ms