RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000026296.7

Fgd1-201, Transcript of FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Fgd1, Length 4,001 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Tmem59Q9QY73 323 aa14.97□□□□□ -0.01
Fgd1-201ENSMUST00000026296 HnrnpcQ9Z204 313 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Atp6v1b2P62814 511 aa14.97□□□□□ -0.01
Fgd1-201ENSMUST00000026296 SnrpaQ62189 287 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Jade1Q6ZPI0 834 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Nlrp4aQ8BU40 982 aa14.97□□□□□ -0.01
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Frmd4bQ920B0 1035 aa14.97□□□□□ -0.01
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Cpt1bQ924X2 772 aa14.97□□□□□ -0.01
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Ska2Q9CR46 120 aa14.97□□□□□ -0.01
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Rhox3fA2ANE1 215 aa14.97□□□□□ -0.01
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Morc3F7BJB9 942 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Farp1F8VPU2 1048 aa14.97□□□□□ -0.01
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Fam160b1Q8CDM8 764 aa14.97□□□□□ -0.01
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Gpc3Q8CFZ4 579 aa14.97□□□□□ -0.01
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Snx9Q91VH2 595 aa14.97□□□□□ -0.01
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Tas1r1Q99PG6 842 aa14.97□□□□□ -0.01
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Rnf14Q9JI90 485 aa14.97□□□□□ -0.01
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Cacng4Q9JJV4 327 aa14.97□□□□□ -0.01
Fgd1-201ENSMUST00000026296 RpgrQ9R0X5 1001 aa14.97□□□□□ -0.01
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Gm45837F7D3W5 961 aa14.96□□□□□ -0.01
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Ets2P15037 468 aa14.96□□□□□ -0.01
Fgd1-201ENSMUST00000026296 PrkchP23298 683 aa14.96□□□□□ -0.01
Fgd1-201ENSMUST00000026296 PorP37040 678 aa14.96□□□□□ -0.01
Fgd1-201ENSMUST00000026296 MafP54843 370 aa14.96□□□□□ -0.01
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Arf4P61750 180 aa14.96□□□□□ -0.01
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Trim43cP86449 446 aa14.96□□□□□ -0.01
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Irf6P97431 467 aa14.96□□□□□ -0.01
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Caprin1Q60865 707 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Stx3Q64704 289 aa14.96□□□□□ -0.01
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Taf2Q8C176 1104 aa14.96□□□□□ -0.01
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Adprhl2Q8CG72 370 aa14.96□□□□□ -0.01
Fgd1-201ENSMUST00000026296 HpdlQ8K248 371 aa14.96□□□□□ -0.01
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Ndfip2Q91ZP6 311 aa14.96□□□□□ -0.01
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Pde2aQ922S4 916 aa14.96□□□□□ -0.01
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Sh2b2Q9JID9 621 aa14.96□□□□□ -0.01
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Rnf25Q9QZR0 456 aa14.96□□□□□ -0.01
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Soat2O88908 525 aa14.96□□□□□ -0.01
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Oprl1P35377 367 aa14.96□□□□□ -0.01
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Gpc4P51655 557 aa14.96□□□□□ -0.01
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Casp7P97864 303 aa14.96□□□□□ -0.01
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Ankrd34bQ3UUF8 508 aa14.96□□□□□ -0.01
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Tmprss11eQ5S248 423 aa14.96□□□□□ -0.01
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Olfr1057Q7TR75 315 aa14.96□□□□□ -0.01
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Znf879Q8BI99 563 aa14.96□□□□□ -0.01
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Pwp2Q8BU03 919 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Clec4aQ9QZ15 238 aa14.96□□□□□ -0.01
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Pds5aQ6A026 1332 aa14.96□□□□□ -0.01
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Phka1P18826 1241 aa14.96□□□□□ -0.01
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Alox15P39654 663 aa14.96□□□□□ -0.01
Fgd1-201ENSMUST00000026296 ZufspQ3T9Z9 577 aa14.96□□□□□ -0.01
Fgd1-201ENSMUST00000026296 ChukQ60680 745 aa14.96□□□□□ -0.01
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Ptk6Q64434 451 aa14.96□□□□□ -0.01
Fgd1-201ENSMUST00000026296 CyldQ80TQ2 952 aa14.96□□□□□ -0.01
Fgd1-201ENSMUST00000026296 3830417A13RikQ8BQJ2 303 aa14.96□□□□□ -0.01
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Ctu1Q99J10 420 aa14.96□□□□□ -0.01
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Pacsin3Q99JB8 424 aa14.96□□□□□ -0.01
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Smad9Q9JIW5 430 aa14.96□□□□□ -0.01
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Sh2d4bA6X942 431 aa14.95□□□□□ -0.02
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Msh2P43247 935 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Mex3cQ05A36 652 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Slc17a7Q3TXX4 560 aa14.95□□□□□ -0.02
Fgd1-201ENSMUST00000026296 IqceQ6PCQ0 778 aa14.95□□□□□ -0.02
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Lsm8Q6ZWM4 96 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Caskin2Q8VHK1 1201 aa14.95□□□□□ -0.02
Fgd1-201ENSMUST00000026296 MceeQ9D1I5 178 aa14.95□□□□□ -0.02
Fgd1-201ENSMUST00000026296 SarnpQ9D1J3 210 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Gtf2h1Q9DBA9 547 aa14.95□□□□□ -0.02
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Trim54Q9ERP3 366 aa14.95□□□□□ -0.02
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Iigp1Q9QZ85 413 aa14.95□□□□□ -0.02
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Golga4Q91VW5 2238 aa14.95□□□□□ -0.02
Fgd1-201ENSMUST00000026296 PdgfraP26618 1089 aa14.95□□□□□ -0.02
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Atxn10P28658 475 aa14.95□□□□□ -0.02
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Sar1aP36536 198 aa14.95□□□□□ -0.02
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Znf583Q3V080 568 aa14.95□□□□□ -0.02
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Q8BGC1 442 aa14.95□□□□□ -0.02
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Pcmtd2Q8BHD8 359 aa14.95□□□□□ -0.02
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Castor2Q8CAB8 329 aa14.95□□□□□ -0.02
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Q8CIL4 281 aa14.95□□□□□ -0.02
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Mrpl58Q8R035 206 aa14.95□□□□□ -0.02
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Rnf225Q9D7D1 332 aa14.95□□□□□ -0.02
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Cyp2b13A6H6J2 491 aa14.95□□□□□ -0.02
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Gm8113E0CXS8 587 aa14.95□□□□□ -0.02
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Elac2Q80Y81 831 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Best2Q8BGM5 508 aa14.95□□□□□ -0.02
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Grik4Q8BMF5 956 aa14.95□□□□□ -0.02
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Dpp9Q8BVG4 862 aa14.95□□□□□ -0.02
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Gtpbp10Q8K013 366 aa14.95□□□□□ -0.02
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Q8VDP2 222 aa14.95□□□□□ -0.02
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Ccr10Q9JL21 362 aa14.95□□□□□ -0.02
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Msh5Q9QUM7 833 aa14.95□□□□□ -0.02
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Plod3Q9R0E1 741 aa14.95□□□□□ -0.02
Fgd1-201ENSMUST00000026296 SprtnG3X912 497 aa14.95□□□□□ -0.02
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Shoc2O88520 582 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
Fgd1-201ENSMUST00000026296 CcnoP0C242 352 aa14.95□□□□□ -0.02
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Cdk16Q04735 496 aa14.95□□□□□ -0.02
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Ubtfl1Q3USZ2 394 aa14.95□□□□□ -0.02
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Tmem65Q4VAE3 234 aa14.95□□□□□ -0.02
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Trim38Q5SZ99 471 aa14.95□□□□□ -0.02
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Zfp90Q61967 636 aa14.95□□□□□ -0.02
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Plk4Q64702 925 aa14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 42.6 ms