RNA–Protein interactions for RNA: YPR179C

HDA3, Transcript of Subunit of the HDA1 histone deacetylase complex, yeastyeast

Gene HDA3, Length 1,968 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HDA3YPR179C TY1B-GR2Q12269 1755 aa0.11□□□□□ -2.39
HDA3YPR179C TY1B-GR3Q12316 1755 aa0.11□□□□□ -2.39
HDA3YPR179C TY1B-PLQ12414 1755 aaKnown RBP0.11□□□□□ -2.39
HDA3YPR179C TY1B-ORQ92393 1755 aa0.11□□□□□ -2.39
HDA3YPR179C TY1B-DR3Q99231 1755 aa0.11□□□□□ -2.39
HDA3YPR179C NUP159P40477 1460 aa0.11□□□□□ -2.39
HDA3YPR179C YIL086CP40503 102 aa0.1□□□□□ -2.39
HDA3YPR179C LSM6Q06406 86 aaKnown RBP0.1□□□□□ -2.39
HDA3YPR179C FLO1P32768 1537 aa0.1□□□□□ -2.39
HDA3YPR179C ESP1Q03018 1630 aa0.1□□□□□ -2.39
HDA3YPR179C PDR11P40550 1411 aa0.1□□□□□ -2.39
HDA3YPR179C GEA1P47102 1408 aaPredicted RBP0.1□□□□□ -2.39
HDA3YPR179C SHU1P38751 150 aa0.1□□□□□ -2.39
HDA3YPR179C APS2Q00381 147 aa0.1□□□□□ -2.39
HDA3YPR179C ECM29P38737 1868 aa0.1□□□□□ -2.39
HDA3YPR179C TY1B-OLQ12273 1755 aa0.09□□□□□ -2.39
HDA3YPR179C YLR419WQ06698 1435 aaKnown RBP0.09□□□□□ -2.39
HDA3YPR179C IMP2P46972 177 aa0.09□□□□□ -2.39
HDA3YPR179C RTR2Q12378 196 aa0.09□□□□□ -2.39
HDA3YPR179C YPR117WQ06116 2489 aa0.09□□□□□ -2.4
HDA3YPR179C UTP10P42945 1769 aaKnown RBP0.09□□□□□ -2.4
HDA3YPR179C CCW14O13547 238 aa0.08□□□□□ -2.4
HDA3YPR179C ADK1P07170 222 aaKnown RBP0.08□□□□□ -2.4
HDA3YPR179C RPA12P32529 125 aaKnown RBP0.08□□□□□ -2.4
HDA3YPR179C YOL118CQ08259 102 aa0.08□□□□□ -2.4
HDA3YPR179C WIP1Q2V2P8 89 aa0.08□□□□□ -2.4
HDA3YPR179C TY1B-PR2P0C2J0 1756 aa0.08□□□□□ -2.4
HDA3YPR179C PMD1P32634 1753 aa0.08□□□□□ -2.4
HDA3YPR179C TY1B-BRQ12193 1756 aa0.08□□□□□ -2.4
HDA3YPR179C SCC2Q04002 1493 aa0.08□□□□□ -2.4
HDA3YPR179C PDR12Q02785 1511 aa0.08□□□□□ -2.4
HDA3YPR179C FKS3Q04952 1785 aa0.07□□□□□ -2.4
HDA3YPR179C YDR210WQ03482 75 aa0.07□□□□□ -2.4
HDA3YPR179C COX19Q3E731 98 aa0.07□□□□□ -2.4
HDA3YPR179C PAU16P35994 123 aa0.06□□□□□ -2.4
HDA3YPR179C YHR138CP38841 114 aaPredicted RBP0.06□□□□□ -2.4
HDA3YPR179C PAU15P40585 124 aa0.06□□□□□ -2.4
HDA3YPR179C HUR1P45820 110 aa0.06□□□□□ -2.4
HDA3YPR179C YNL190WP53872 204 aa0.06□□□□□ -2.4
HDA3YPR179C YDR034W-BQ6Q5X2 51 aa0.06□□□□□ -2.4
HDA3YPR179C IQG1Q12280 1495 aa0.06□□□□□ -2.4
HDA3YPR179C KRE5P22023 1365 aa0.06□□□□□ -2.4
HDA3YPR179C MPC2P38857 129 aa0.06□□□□□ -2.4
HDA3YPR179C YIR021W-AQ3E739 70 aa0.06□□□□□ -2.4
HDA3YPR179C BUD23P25627 275 aaPredicted RBP0.05□□□□□ -2.4
HDA3YPR179C YGR164WP53291 111 aa0.05□□□□□ -2.4
HDA3YPR179C YPL038W-AQ3E7B4 63 aa0.05□□□□□ -2.4
HDA3YPR179C TSC11P40061 1430 aa0.05□□□□□ -2.4
HDA3YPR179C NUM1Q00402 2748 aa0.05□□□□□ -2.4
HDA3YPR179C VMA21P41806 77 aa0.05□□□□□ -2.4
HDA3YPR179C SKI3P17883 1432 aaKnown RBP0.04□□□□□ -2.4
HDA3YPR179C YCR101CP25607 182 aa0.04□□□□□ -2.4
HDA3YPR179C HKR1P41809 1802 aa0.04□□□□□ -2.4
HDA3YPR179C TOR1P35169 2470 aa0.03□□□□□ -2.4
HDA3YPR179C RPS11AP0CX47 156 aaKnown RBP0.03□□□□□ -2.4
HDA3YPR179C RPS11BP0CX48 156 aaKnown RBP0.03□□□□□ -2.4
HDA3YPR179C SWC7Q06707 132 aa0.03□□□□□ -2.4
HDA3YPR179C RPO41P13433 1351 aaKnown RBP0.03□□□□□ -2.4
HDA3YPR179C YER039C-AP0CD97 72 aa0.03□□□□□ -2.41
HDA3YPR179C COX12Q01519 83 aa0.03□□□□□ -2.41
HDA3YPR179C LYS2P07702 1392 aa0.02□□□□□ -2.41
HDA3YPR179C STT4P37297 1900 aa0.02□□□□□ -2.41
HDA3YPR179C SRB6P32570 121 aa0.02□□□□□ -2.41
HDA3YPR179C SPT6P23615 1451 aaKnown RBP0.02□□□□□ -2.41
HDA3YPR179C MOT1P32333 1867 aa0.01□□□□□ -2.41
HDA3YPR179C RUB1Q03919 77 aa0.01□□□□□ -2.41
HDA3YPR179C YOR304C-AO14468 76 aa0.01□□□□□ -2.41
HDA3YPR179C MRPL38P35996 138 aaPredicted RBP0□□□□□ -2.41
HDA3YPR179C MRX7P53869 86 aa0□□□□□ -2.41
HDA3YPR179C YOS1Q3E834 85 aa0□□□□□ -2.41
HDA3YPR179C MIC10Q96VH5 97 aa0□□□□□ -2.41
HDA3YPR179C UTP20P35194 2493 aaKnown RBP-0.01□□□□□ -2.41
HDA3YPR179C ICY1Q04329 127 aa-0.01□□□□□ -2.41
HDA3YPR179C YCR095W-AQ3E787 52 aa-0.01□□□□□ -2.41
HDA3YPR179C GNA1P43577 159 aaPredicted RBP-0.02□□□□□ -2.41
HDA3YPR179C YGR035W-AQ45U48 73 aa-0.02□□□□□ -2.41
HDA3YPR179C YNL198CP40166 100 aa-0.03□□□□□ -2.41
HDA3YPR179C SNA2P56508 79 aa-0.03□□□□□ -2.41
HDA3YPR179C YIL046W-AQ3E7Z4 54 aa-0.03□□□□□ -2.41
HDA3YPR179C FMP27Q06179 2628 aa-0.03□□□□□ -2.41
HDA3YPR179C TEL1P38110 2787 aa-0.03□□□□□ -2.41
HDA3YPR179C GCN1P33892 2672 aaKnown RBP-0.03□□□□□ -2.41
HDA3YPR179C PAU6P0CE90 120 aa-0.03□□□□□ -2.41
HDA3YPR179C PAU18P0CE91 120 aa-0.03□□□□□ -2.41
HDA3YPR179C UBC4P15731 148 aa-0.03□□□□□ -2.41
HDA3YPR179C YBR292CP38357 123 aa-0.03□□□□□ -2.41
HDA3YPR179C RPC10P40422 70 aa-0.03□□□□□ -2.41
HDA3YPR179C YMR103CQ04436 120 aa-0.03□□□□□ -2.41
HDA3YPR179C YDR524C-BQ3E6R4 66 aa-0.03□□□□□ -2.41
HDA3YPR179C DYN1P36022 4092 aa-0.04□□□□□ -2.42
HDA3YPR179C SEN1Q00416 2231 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
HDA3YPR179C MRP17P28778 131 aa-0.04□□□□□ -2.42
HDA3YPR179C ATX1P38636 73 aa-0.04□□□□□ -2.42
HDA3YPR179C PAU5P43575 122 aa-0.04□□□□□ -2.42
HDA3YPR179C YMR105W-AQ8TGS8 64 aa-0.04□□□□□ -2.42
HDA3YPR179C LHP1P33399 275 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
HDA3YPR179C RSM18P40033 138 aa-0.05□□□□□ -2.42
HDA3YPR179C YNR034W-AQ3E841 98 aa-0.05□□□□□ -2.42
HDA3YPR179C YBR016WP38216 128 aa-0.05□□□□□ -2.42
HDA3YPR179C PAU20Q08322 120 aa-0.05□□□□□ -2.42
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