RNA–Protein interactions for RNA: YMR135W-A

YMR135W-A, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YMR135W-A, Length 534 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YMR135W-AYMR135W-A LSM2P38203 95 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
YMR135W-AYMR135W-A ICY1Q04329 127 aa3.41□□□□□ -1.86
YMR135W-AYMR135W-A ENV10Q99382 181 aa3.41□□□□□ -1.86
YMR135W-AYMR135W-A RPL22AP05749 121 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
YMR135W-AYMR135W-A RPS22AP0C0W1 130 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
YMR135W-AYMR135W-A TOR2P32600 2474 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
YMR135W-AYMR135W-A YFL065CP43539 102 aa3.4□□□□□ -1.87
YMR135W-AYMR135W-A MLP1Q02455 1875 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
YMR135W-AYMR135W-A PRM3Q08931 133 aa3.4□□□□□ -1.87
YMR135W-AYMR135W-A YPR203WQ08994 102 aa3.4□□□□□ -1.87
YMR135W-AYMR135W-A PRM7Q12459 698 aa3.4□□□□□ -1.87
YMR135W-AYMR135W-A MYO1P08964 1928 aa3.39□□□□□ -1.87
YMR135W-AYMR135W-A ROX3P25046 220 aa3.39□□□□□ -1.87
YMR135W-AYMR135W-A IMP2P46972 177 aa3.39□□□□□ -1.87
YMR135W-AYMR135W-A YLR162WQ06235 118 aa3.39□□□□□ -1.87
YMR135W-AYMR135W-A POC4Q12245 148 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
YMR135W-AYMR135W-A YDL012CQ12489 107 aa3.39□□□□□ -1.87
YMR135W-AYMR135W-A YMR175W-AQ3E766 64 aa3.39□□□□□ -1.87
YMR135W-AYMR135W-A YHR213W-AQ8TGT4 77 aa3.39□□□□□ -1.87
YMR135W-AYMR135W-A VAM10Q08474 114 aa3.38□□□□□ -1.87
YMR135W-AYMR135W-A COA3Q3E7B2 85 aa3.38□□□□□ -1.87
YMR135W-AYMR135W-A LSM6Q06406 86 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
YMR135W-AYMR135W-A FAB1P34756 2278 aa3.37□□□□□ -1.87
YMR135W-AYMR135W-A RPA12P32529 125 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
YMR135W-AYMR135W-A YBR219CP38317 127 aa3.36□□□□□ -1.87
YMR135W-AYMR135W-A YIL163CP40448 117 aa3.36□□□□□ -1.87
YMR135W-AYMR135W-A YMR321CQ04898 105 aa3.36□□□□□ -1.87
YMR135W-AYMR135W-A COA4Q05809 96 aa3.36□□□□□ -1.87
YMR135W-AYMR135W-A ICS3P47034 131 aa3.35□□□□□ -1.87
YMR135W-AYMR135W-A YCR095W-AQ3E787 52 aa3.35□□□□□ -1.87
YMR135W-AYMR135W-A MHF2Q3E829 80 aa3.35□□□□□ -1.87
YMR135W-AYMR135W-A YNL146C-AQ3E7Z1 64 aa3.34□□□□□ -1.87
YMR135W-AYMR135W-A FLO1P32768 1537 aa3.34□□□□□ -1.88
YMR135W-AYMR135W-A UBR2Q07963 1872 aa3.33□□□□□ -1.88
YMR135W-AYMR135W-A YSF3P0C074 85 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
YMR135W-AYMR135W-A YCL042WP25572 119 aa3.33□□□□□ -1.88
YMR135W-AYMR135W-A YOL118CQ08259 102 aa3.33□□□□□ -1.88
YMR135W-AYMR135W-A YCL048W-AQ2V2Q2 79 aa3.32□□□□□ -1.88
YMR135W-AYMR135W-A RPS22BQ3E7Y3 130 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
YMR135W-AYMR135W-A YDR034W-BQ6Q5X2 51 aa3.32□□□□□ -1.88
YMR135W-AYMR135W-A CDC39P25655 2108 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
YMR135W-AYMR135W-A CUP1-1P0CX80 61 aa3.31□□□□□ -1.88
YMR135W-AYMR135W-A CUP1-2P0CX81 61 aa3.31□□□□□ -1.88
YMR135W-AYMR135W-A NHP2P32495 156 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
YMR135W-AYMR135W-A YHR086W-AQ3E746 53 aa3.31□□□□□ -1.88
YMR135W-AYMR135W-A PAI3P01094 68 aa3.3□□□□□ -1.88
YMR135W-AYMR135W-A TOM6P33448 61 aa3.3□□□□□ -1.88
YMR135W-AYMR135W-A SNA2P56508 79 aa3.3□□□□□ -1.88
YMR135W-AYMR135W-A LAA1P39526 2014 aa3.29□□□□□ -1.88
YMR135W-AYMR135W-A VPS55P47111 140 aa3.29□□□□□ -1.88
YMR135W-AYMR135W-A ECM29P38737 1868 aa3.28□□□□□ -1.88
YMR135W-AYMR135W-A YHL037CP38733 133 aa3.28□□□□□ -1.88
YMR135W-AYMR135W-A SEN1Q00416 2231 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
YMR135W-AYMR135W-A SPC1P46965 94 aa3.27□□□□□ -1.89
YMR135W-AYMR135W-A CCW12Q12127 133 aa3.27□□□□□ -1.89
YMR135W-AYMR135W-A MRP17P28778 131 aa3.26□□□□□ -1.89
YMR135W-AYMR135W-A IRC21Q04772 201 aa3.26□□□□□ -1.89
YMR135W-AYMR135W-A PAU6P0CE90 120 aa3.25□□□□□ -1.89
YMR135W-AYMR135W-A PAU18P0CE91 120 aa3.25□□□□□ -1.89
YMR135W-AYMR135W-A MRPL38P35996 138 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
YMR135W-AYMR135W-A YBL071CP38185 102 aa3.24□□□□□ -1.89
YMR135W-AYMR135W-A YBR013CP38215 129 aa3.24□□□□□ -1.89
YMR135W-AYMR135W-A YGL041C-BQ3E750 60 aa3.24□□□□□ -1.89
YMR135W-AYMR135W-A CCW14O13547 238 aa3.23□□□□□ -1.89
YMR135W-AYMR135W-A YPR145C-AQ2V2P0 78 aa3.23□□□□□ -1.89
YMR135W-AYMR135W-A YDR119W-AQ2V2P9 66 aa3.23□□□□□ -1.89
YMR135W-AYMR135W-A YOR343CQ12484 108 aa3.22□□□□□ -1.89
YMR135W-AYMR135W-A MIC27P50945 234 aa3.21□□□□□ -1.9
YMR135W-AYMR135W-A GIS2P53849 153 aaKnown RBP RIP-Chip data3.21□□□□□ -1.9not detected
YMR135W-AYMR135W-A LCL2Q08045 131 aa3.21□□□□□ -1.9
YMR135W-AYMR135W-A YDR381C-AQ3E6R5 114 aa3.21□□□□□ -1.9
YMR135W-AYMR135W-A ACC1Q00955 2233 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
YMR135W-AYMR135W-A TEL1P38110 2787 aa3.2□□□□□ -1.9
YMR135W-AYMR135W-A MRPS12P53732 153 aa3.2□□□□□ -1.9
YMR135W-AYMR135W-A YHR214C-DP0CX93 97 aa3.19□□□□□ -1.9
YMR135W-AYMR135W-A YPL038W-AQ3E7B4 63 aa3.19□□□□□ -1.9
YMR135W-AYMR135W-A IRA2P19158 3079 aa3.18□□□□□ -1.9
YMR135W-AYMR135W-A MOT1P32333 1867 aa3.18□□□□□ -1.9
YMR135W-AYMR135W-A YFR010W-AP0C5N0 62 aa3.17□□□□□ -1.9
YMR135W-AYMR135W-A ATX1P38636 73 aa3.17□□□□□ -1.9
YMR135W-AYMR135W-A MRX7P53869 86 aa3.17□□□□□ -1.9
YMR135W-AYMR135W-A YDR524C-BQ3E6R4 66 aa3.17□□□□□ -1.9
YMR135W-AYMR135W-A YGR240C-AQ3E786 66 aa3.17□□□□□ -1.9
YMR135W-AYMR135W-A CYR1P08678 2026 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
YMR135W-AYMR135W-A YDR210WQ03482 75 aa3.16□□□□□ -1.9
YMR135W-AYMR135W-A FMP27Q06179 2628 aa3.15□□□□□ -1.9
YMR135W-AYMR135W-A YBR292CP38357 123 aa3.15□□□□□ -1.91
YMR135W-AYMR135W-A SWM2P40342 146 aa3.15□□□□□ -1.91
YMR135W-AYMR135W-A YJL009WP47078 108 aa3.14□□□□□ -1.91
YMR135W-AYMR135W-A PAU4P53427 120 aa3.14□□□□□ -1.91
YMR135W-AYMR135W-A COX12Q01519 83 aa3.14□□□□□ -1.91
YMR135W-AYMR135W-A YNR034W-AQ3E841 98 aa3.14□□□□□ -1.91
YMR135W-AYMR135W-A PAU1P0CE88 120 aa3.13□□□□□ -1.91
YMR135W-AYMR135W-A PAU14P0CE89 120 aa3.13□□□□□ -1.91
YMR135W-AYMR135W-A PAU8P0CE92 120 aa3.13□□□□□ -1.91
YMR135W-AYMR135W-A PAU11P0CE93 120 aa3.13□□□□□ -1.91
YMR135W-AYMR135W-A PAU13P38725 120 aa3.13□□□□□ -1.91
YMR135W-AYMR135W-A YNL122CP53921 115 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
YMR135W-AYMR135W-A PAU10Q03050 120 aa3.13□□□□□ -1.91
YMR135W-AYMR135W-A PAU9Q3E770 120 aa3.13□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 47.7 ms