RNA–Protein interactions for RNA: YKR026C

GCN3, Transcript of Alpha subunit of translation initiation factor eIF2B, yeast

Gene GCN3, Length 918 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
GCN3	YKR026C	RPP2A	P05319	106 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
GCN3	YKR026C	COX14	P39103	70 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GCN3	YKR026C	HUR1	P45820	110 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GCN3	YKR026C	YOR020W-A	Q3E824	90 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GCN3	YKR026C	ISD11	Q6Q560	94 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GCN3	YKR026C	UTP20	P35194	2493 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
GCN3	YKR026C	TOA2	P32774	122 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GCN3	YKR026C	RPR2	P40571	144 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GCN3	YKR026C	CWP2	P43497	92 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GCN3	YKR026C	YDR274C	P87283	123 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GCN3	YKR026C	RGM1	Q00453	211 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GCN3	YKR026C	YMR295C	Q03559	197 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GCN3	YKR026C	ENV10	Q99382	181 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GCN3	YKR026C	MRPL24	P36525	258 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
GCN3	YKR026C	DSE2	P38844	325 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GCN3	YKR026C	VAM10	Q08474	114 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GCN3	YKR026C	YGR035W-A	Q45U48	73 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GCN3	YKR026C	AIM19	P40502	157 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GCN3	YKR026C	YFL065C	P43539	102 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GCN3	YKR026C	YPR203W	Q08994	102 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GCN3	YKR026C	UBC11	P52492	156 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GCN3	YKR026C	COX12	Q01519	83 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GCN3	YKR026C	YPR010C-A	A5Z2X5	72 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GCN3	YKR026C	MLF3	P32047	452 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GCN3	YKR026C	ERG28	P40030	148 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GCN3	YKR026C	SKI6	P46948	246 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
GCN3	YKR026C	YCR001W	P25347	104 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GCN3	YKR026C	YBR219C	P38317	127 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GCN3	YKR026C	SVP26	P38869	228 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GCN3	YKR026C	CRC1	Q12289	327 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GCN3	YKR026C	YMR175W-A	Q3E766	64 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GCN3	YKR026C	YFL041W-A	Q3E817	63 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GCN3	YKR026C	SGF11	Q03067	99 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GCN3	YKR026C	YDL241W	Q07738	123 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GCN3	YKR026C	YAL063C-A	Q3E791	96 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GCN3	YKR026C	YLL006W-A	Q3E814	58 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GCN3	YKR026C	PBI2	P0CT04	75 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
GCN3	YKR026C	KRE1	P17260	313 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GCN3	YKR026C	MSA2	P36157	363 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GCN3	YKR026C	PBA1	Q05778	276 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GCN3	YKR026C	YLR236C	A0A023PZG4	107 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GCN3	YKR026C	YAL065C	O13511	128 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GCN3	YKR026C	RDS3	Q06835	107 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
GCN3	YKR026C	YPL229W	Q99395	206 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GCN3	YKR026C	YAR1	P46683	200 aa		4.79	□□□□□ -1.64
GCN3	YKR026C	KNH1	P50112	268 aa		4.79	□□□□□ -1.64
GCN3	YKR026C	YDR381C-A	Q3E6R5	114 aa		4.79	□□□□□ -1.64
GCN3	YKR026C	RPL29	P05747	59 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
GCN3	YKR026C	RPC10	P40422	70 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GCN3	YKR026C	IRC21	Q04772	201 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GCN3	YKR026C	SPC1	P46965	94 aa		4.77	□□□□□ -1.65
GCN3	YKR026C	YNL184C	P53876	108 aa		4.77	□□□□□ -1.65
GCN3	YKR026C	HAL1	Q01766	294 aa		4.77	□□□□□ -1.65
GCN3	YKR026C	ICY1	Q04329	127 aa		4.77	□□□□□ -1.65
GCN3	YKR026C	YHR139C-A	O13536	103 aa		4.76	□□□□□ -1.65
GCN3	YKR026C	YJR107C-A	P0CT86	78 aa		4.76	□□□□□ -1.65
GCN3	YKR026C	EMC6	Q12431	108 aa		4.76	□□□□□ -1.65
GCN3	YKR026C	YOR034C-A	Q3E735	80 aa		4.76	□□□□□ -1.65
GCN3	YKR026C	RPL26A	P05743	127 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
GCN3	YKR026C	RPL33A	P05744	107 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
GCN3	YKR026C	RPL33B	P41056	107 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
GCN3	YKR026C	MVB12	P42939	101 aa		4.75	□□□□□ -1.65
GCN3	YKR026C	RPL26B	P53221	127 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
GCN3	YKR026C	SMD1	Q02260	146 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
GCN3	YKR026C	YMR320W	Q04897	101 aa		4.75	□□□□□ -1.65
GCN3	YKR026C	YLR281C	Q05863	155 aa		4.75	□□□□□ -1.65
GCN3	YKR026C	YOR304C-A	O14468	76 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GCN3	YKR026C	AQY2	P0CD90	149 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GCN3	YKR026C	YFL019C	P43576	117 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GCN3	YKR026C	RAD6	P06104	172 aa		4.73	□□□□□ -1.65
GCN3	YKR026C	YBL039W-B	P0C268	59 aa		4.73	□□□□□ -1.65
GCN3	YKR026C	YHL042W	P38729	150 aa		4.73	□□□□□ -1.65
GCN3	YKR026C	SHH4	Q06236	168 aa		4.73	□□□□□ -1.65
GCN3	YKR026C	TSC3	Q3E790	80 aa		4.73	□□□□□ -1.65
GCN3	YKR026C	YGR039W	P53225	103 aa		4.72	□□□□□ -1.65
GCN3	YKR026C	COF1	Q03048	143 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
GCN3	YKR026C	YAL064W	P39711	94 aa		4.71	□□□□□ -1.66
GCN3	YKR026C	MPC3	P53311	146 aa		4.71	□□□□□ -1.66
GCN3	YKR026C	ATP18	P81450	59 aa		4.71	□□□□□ -1.66
GCN3	YKR026C	RTC6	O14464	93 aa		4.69	□□□□□ -1.66
GCN3	YKR026C	UBC4	P15731	148 aa		4.69	□□□□□ -1.66
GCN3	YKR026C	SMP1	P38128	452 aa		4.69	□□□□□ -1.66
GCN3	YKR026C	YSY6	P38374	65 aa		4.69	□□□□□ -1.66
GCN3	YKR026C	SFT1	P43682	97 aa		4.69	□□□□□ -1.66
GCN3	YKR026C	RSM19	P53733	91 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
GCN3	YKR026C	YDR119W-A	Q2V2P9	66 aa		4.68	□□□□□ -1.66
GCN3	YKR026C	YBL081W	P38180	368 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
GCN3	YKR026C	YDR115W	Q04598	105 aa		4.67	□□□□□ -1.66
GCN3	YKR026C	YNL162W-A	Q3E7A8	72 aa		4.67	□□□□□ -1.66
GCN3	YKR026C	DIF1	O13577	133 aa		4.66	□□□□□ -1.66
GCN3	YKR026C	FYV5	P25585	152 aa		4.66	□□□□□ -1.66
GCN3	YKR026C	YPL038W-A	Q3E7B4	63 aa		4.66	□□□□□ -1.66
GCN3	YKR026C	STF1	P01098	86 aa		4.65	□□□□□ -1.67
GCN3	YKR026C	GAT4	P40569	121 aa		4.65	□□□□□ -1.67
GCN3	YKR026C	YLR285C-A	Q3E771	56 aa		4.65	□□□□□ -1.67
GCN3	YKR026C	Q0032	Q9ZZX7	96 aa		4.65	□□□□□ -1.67
GCN3	YKR026C	TDA2	P40045	126 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GCN3	YKR026C	YLR122C	Q12312	125 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GCN3	YKR026C	YGL041C-B	Q3E750	60 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GCN3	YKR026C	YJL127C-B	Q3E828	52 aa		4.64	□□□□□ -1.67

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