RNA–Protein interactions for RNA: YKL033W

TTI1, Transcript of Subunit of the ASTRA complex, involved in chromatin remodeling, yeast

Gene TTI1, Length 3,117 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TTI1	YKL033W	KNH1	P50112	268 aa		0.61	□□□□□ -2.31
TTI1	YKL033W	GIM5	Q04493	163 aa		0.61	□□□□□ -2.31
TTI1	YKL033W	YGL041C-B	Q3E750	60 aa		0.61	□□□□□ -2.31
TTI1	YKL033W	CMC2	Q3E7A4	109 aa		0.61	□□□□□ -2.31
TTI1	YKL033W	YOR008C-A	Q3E7B9	74 aa		0.61	□□□□□ -2.31
TTI1	YKL033W	RPL28	P02406	149 aa	Known RBP	0.6	□□□□□ -2.31
TTI1	YKL033W	NTF2	P33331	125 aa	Known RBP	0.6	□□□□□ -2.31
TTI1	YKL033W	PEX17	P40155	199 aa		0.6	□□□□□ -2.31
TTI1	YKL033W	YFL019C	P43576	117 aa		0.6	□□□□□ -2.31
TTI1	YKL033W	TOS6	P48560	102 aa		0.6	□□□□□ -2.31
TTI1	YKL033W	ATP16	Q12165	160 aa		0.6	□□□□□ -2.31
TTI1	YKL033W	YNL042W-B	Q3E7Z2	85 aa		0.6	□□□□□ -2.31
TTI1	YKL033W	YAL067W-A	Q8TGK6	75 aa		0.6	□□□□□ -2.31
TTI1	YKL033W	PFY1	P07274	126 aa		0.6	□□□□□ -2.31
TTI1	YKL033W	MRPL11	P36521	249 aa	Predicted RBP	0.6	□□□□□ -2.31
TTI1	YKL033W	HSP10	P38910	106 aa		0.6	□□□□□ -2.31
TTI1	YKL033W	PHS1	P40857	217 aa		0.6	□□□□□ -2.31
TTI1	YKL033W	NSE4	P43124	402 aa		0.6	□□□□□ -2.31
TTI1	YKL033W	YPL257W	Q08974	193 aa		0.6	□□□□□ -2.31
TTI1	YKL033W	POP3	P53833	195 aa	Predicted RBP	0.6	□□□□□ -2.31
TTI1	YKL033W	YML079W	Q03629	201 aa		0.6	□□□□□ -2.31
TTI1	YKL033W	PKR1	Q03880	122 aa	Known RBP	0.6	□□□□□ -2.31
TTI1	YKL033W	HPA2	Q06592	156 aa		0.6	□□□□□ -2.31
TTI1	YKL033W	YIL002W-A	Q3E7Z5	69 aa		0.6	□□□□□ -2.31
TTI1	YKL033W	YOR020W-A	Q3E824	90 aa		0.6	□□□□□ -2.31
TTI1	YKL033W	YHR139C-A	O13536	103 aa		0.59	□□□□□ -2.31
TTI1	YKL033W	RPL31A	P0C2H8	113 aa	Known RBP	0.59	□□□□□ -2.31
TTI1	YKL033W	HMRA1	P0CY11	126 aa		0.59	□□□□□ -2.31
TTI1	YKL033W	LDS1	P31379	325 aa		0.59	□□□□□ -2.31
TTI1	YKL033W	APS1	P35181	156 aa		0.59	□□□□□ -2.31
TTI1	YKL033W	MRPL24	P36525	258 aa	Predicted RBP	0.59	□□□□□ -2.31
TTI1	YKL033W	YAL063C-A	Q3E791	96 aa		0.59	□□□□□ -2.31
TTI1	YKL033W	PAU7	P39545	55 aa		0.59	□□□□□ -2.32
TTI1	YKL033W	PAU5	P43575	122 aa		0.59	□□□□□ -2.32
TTI1	YKL033W	YNL122C	P53921	115 aa	Predicted RBP	0.59	□□□□□ -2.32
TTI1	YKL033W	CWC27	Q02770	301 aa		0.59	□□□□□ -2.32
TTI1	YKL033W	RPF1	P38805	295 aa	Known RBP	0.58	□□□□□ -2.32
TTI1	YKL033W	YPL080C	Q02826	108 aa		0.58	□□□□□ -2.32
TTI1	YKL033W	YLR361C-A	Q3E795	98 aa		0.58	□□□□□ -2.32
TTI1	YKL033W	MBF1	O14467	151 aa	Known RBP	0.58	□□□□□ -2.32
TTI1	YKL033W	YHL018W	P38744	120 aa	Predicted RBP	0.58	□□□□□ -2.32
TTI1	YKL033W	YIA6	P40556	373 aa		0.58	□□□□□ -2.32
TTI1	YKL033W	RGM1	Q00453	211 aa		0.58	□□□□□ -2.32
TTI1	YKL033W	YLR050C	Q12155	161 aa	Known RBP	0.58	□□□□□ -2.32
TTI1	YKL033W	YLL006W-A	Q3E814	58 aa		0.58	□□□□□ -2.32
TTI1	YKL033W	HAP3	P13434	144 aa		0.58	□□□□□ -2.32
TTI1	YKL033W	AIM11	P87275	137 aa		0.58	□□□□□ -2.32
TTI1	YKL033W	YMR103C	Q04436	120 aa		0.58	□□□□□ -2.32
TTI1	YKL033W	YJL127C-B	Q3E828	52 aa		0.58	□□□□□ -2.32
TTI1	YKL033W	YBL039W-B	P0C268	59 aa		0.57	□□□□□ -2.32
TTI1	YKL033W	YEL067C	P39978	195 aa		0.57	□□□□□ -2.32
TTI1	YKL033W	RPS29A	P41057	56 aa	Known RBP	0.57	□□□□□ -2.32
TTI1	YKL033W	MRPS12	P53732	153 aa		0.57	□□□□□ -2.32
TTI1	YKL033W	YPL261C	Q08976	102 aa		0.57	□□□□□ -2.32
TTI1	YKL033W	COA3	Q3E7B2	85 aa		0.57	□□□□□ -2.32
TTI1	YKL033W	Q0017	Q9ZZX8	53 aa		0.57	□□□□□ -2.32
TTI1	YKL033W	GSP1	P32835	219 aa	Known RBP	0.57	□□□□□ -2.32
TTI1	YKL033W	FYV4	P38783	130 aa	Predicted RBP	0.57	□□□□□ -2.32
TTI1	YKL033W	RPS29B	P41058	56 aa	Known RBP	0.57	□□□□□ -2.32
TTI1	YKL033W	ERV14	P53173	138 aa		0.57	□□□□□ -2.32
TTI1	YKL033W	YDR210W	Q03482	75 aa		0.57	□□□□□ -2.32
TTI1	YKL033W	POM33	Q12164	279 aa		0.57	□□□□□ -2.32
TTI1	YKL033W	ATP14	Q12349	124 aa		0.57	□□□□□ -2.32
TTI1	YKL033W	FMP16	Q12497	93 aa		0.57	□□□□□ -2.32
TTI1	YKL033W	CNB1	P25296	175 aa		0.56	□□□□□ -2.32
TTI1	YKL033W	MSA2	P36157	363 aa		0.56	□□□□□ -2.32
TTI1	YKL033W	VMA21	P41806	77 aa		0.56	□□□□□ -2.32
TTI1	YKL033W	YNL184C	P53876	108 aa		0.56	□□□□□ -2.32
TTI1	YKL033W	GSP2	P32836	220 aa	Known RBP	0.56	□□□□□ -2.32
TTI1	YKL033W	YHL005C	P38752	130 aa		0.56	□□□□□ -2.32
TTI1	YKL033W	YER134C	P40081	178 aa		0.56	□□□□□ -2.32
TTI1	YKL033W	RPL36B	O14455	100 aa	Known RBP	0.55	□□□□□ -2.32
TTI1	YKL033W	BET1	P22804	142 aa		0.55	□□□□□ -2.32
TTI1	YKL033W	HHO1	P53551	258 aa		0.55	□□□□□ -2.32
TTI1	YKL033W	YOR072W	Q08486	104 aa		0.55	□□□□□ -2.32
TTI1	YKL033W	FYV12	Q08559	129 aa		0.55	□□□□□ -2.32
TTI1	YKL033W	VMA9	Q3E7B6	73 aa		0.55	□□□□□ -2.32
TTI1	YKL033W	RPS22B	Q3E7Y3	130 aa	Known RBP	0.55	□□□□□ -2.32
TTI1	YKL033W	ATP5	P09457	212 aa		0.55	□□□□□ -2.32
TTI1	YKL033W	SPT4	P32914	102 aa	Predicted RBP	0.55	□□□□□ -2.32
TTI1	YKL033W	YGL118C	P53132	145 aa		0.55	□□□□□ -2.32
TTI1	YKL033W	SHH4	Q06236	168 aa		0.55	□□□□□ -2.32
TTI1	YKL033W	YBR230W-A	Q3E762	66 aa		0.55	□□□□□ -2.32
TTI1	YKL033W	YKR041W	P36134	250 aa		0.55	□□□□□ -2.32
TTI1	YKL033W	ATG8	P38182	117 aa	RIP-Chip data	0.55	□□□□□ -2.32	not detected
TTI1	YKL033W	APS2	Q00381	147 aa		0.55	□□□□□ -2.32
TTI1	YKL033W	SEN15	Q04675	128 aa		0.55	□□□□□ -2.32
TTI1	YKL033W	RSM18	P40033	138 aa		0.54	□□□□□ -2.32
TTI1	YKL033W	YJR128W	P47162	119 aa		0.54	□□□□□ -2.32
TTI1	YKL033W	YJL009W	P47078	108 aa		0.54	□□□□□ -2.32
TTI1	YKL033W	YGR164W	P53291	111 aa		0.54	□□□□□ -2.32
TTI1	YKL033W	MPC3	P53311	146 aa		0.54	□□□□□ -2.32
TTI1	YKL033W	YNR077C	P53758	84 aa		0.54	□□□□□ -2.32
TTI1	YKL033W	IRC21	Q04772	201 aa		0.54	□□□□□ -2.32
TTI1	YKL033W	NHP6A	P11632	93 aa	Known RBP	0.53	□□□□□ -2.32
TTI1	YKL033W	FYV5	P25585	152 aa		0.53	□□□□□ -2.32
TTI1	YKL033W	SRB6	P32570	121 aa		0.53	□□□□□ -2.32
TTI1	YKL033W	DSE2	P38844	325 aa		0.53	□□□□□ -2.32
TTI1	YKL033W	UBC12	P52491	188 aa		0.53	□□□□□ -2.32
TTI1	YKL033W	CYT2	Q00873	224 aa		0.53	□□□□□ -2.32

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